hal是一个多学科的开放访问档案,用于存款和传播科学研究文件,无论它们是否已发表。这些文件可能来自法国或国外的教学和研究机构,也可能来自公共或私人研究中心。
原理 抗菌药物敏感性测试 (AST) 是由实验室技术人员执行的一种实验室程序,用于确定哪种抗菌药物对个别患者特别有效。各种抗菌药物被用于治疗各种感染,这表明有必要在所有微生物实验室中将抗菌药物敏感性测试作为常规程序。抗生素通常被定义为微生物(如青霉菌)产生的物质,它能够杀死或抑制其他微生物(主要是细菌)的生长。抗菌药物敏感性测试 (AST) 主要测量抗生素或其他抗菌剂抑制体外微生物生长的能力。抗生素敏感性测试的基本原理已在微生物实验室中使用了 80 多年。直到 1950 年代,实验室还缺乏用于准确测定生物体对抗菌剂的体外反应的方法和设备。Bauer 等人开始使用纸片扩散系统开发抗菌药物敏感性测试的标准化方法。抗菌药敏试验有定量和定性两种。临床实验室目前根据其提供的实验室测试菜单采用几种方法。这些方法包括纸片扩散法和最低抑菌浓度 (MIC) 法。纸片扩散试验是一种定性测试方法。美国国家临床实验室标准委员会 (NCCLS)(现称为临床实验室标准研究所 (CLSI))已发布有关纸片扩散系统的综合文件。琼脂纸片扩散试验是常规抗菌药敏试验最方便和使用最广泛的方法。在后续和当前的实践中,将抗菌浸渍纸片应用于琼脂表面。各种监管机构和标准编写组织发布了基于 Kirby-Bauer 方法的标准化参考程序。WHO 和 FDA 发布了纸片系统的标准化参考程序,并由 CLSI(以前称为 NCCLS)定期更新,以用于任何抗菌测试、质量控制或临床测试。然而,在处理敏感度光盘时需要采取一些预防措施,应查阅最新的 CLSI 文档以了解当前的建议。
迄今为止,许多基于培养和基于基因工程的策略、靶向基因操作技术(如启动子工程和 CRISPR 介导的基因编辑)和非靶向方法(如核糖体工程和调节基因的激活/失活)已经使得有效激活隐蔽的 SM-BGC 成为可能 (7,8)。但与上述技术相比,通过共培养微生物来增加次级代谢产物的产生具有简单的优点,因为它不需要事先了解 smBGC 或基因工程工具。共培养复制了生态压力,例如物种间竞争期间的营养缺乏,并导致鉴定出几种完美的生产者和诱导者组合,这些组合可有效促进新型生物活性化合物的合成。
ISSN印刷:2617-4693 ISSN在线:2617-4707 IJABR 2024; SP-8(8):1288-1293 www.biochemjournal.com收到:17-05-2024被接受:20-06-06-2024印度农业研究所戈德瓦里昆虫学司,印度新德里,印度Shivanna shivanna bentomology of nripomology of nibrociagy of New Delhi,bengangalulagy of Nippiplia ofipp thripp ofipp thripp ofipp of。印度卡纳塔克邦班加罗尔农业科学大学卡维亚·梅雷马斯农业科学系,农业科学系,达瓦德,卡纳塔克邦,卡纳塔克邦,阿奇纳塔克邦,阿奇纳塔克邦,阿奇纳塔纳塔克邦,萨尔纳塔克省,萨尔纳塔克尔大学,萨尔纳塔克省,萨尔纳塔克省,萨尔纳塔克省。印度卡纳塔克邦班加罗尔,印度班加罗尔大学,班加罗尔,印度卡纳塔克邦,班加罗尔大学昆虫学系,科索尔·普贾尔农业科学系,孟加拉罗尔大学,印度卡纳塔克邦,印度卡纳塔克邦
链霉菌Albidoflavus是一种流行且遗传上的平台菌株,用于通过异源生物合成基因簇(BGC)的表达进行自然产物发现和生产。然而,其转录调节网络(TRN)及其对继发代谢的影响尚不清楚。在这里,我们通过将独立的组件分析应用于来自内部和公共资源的218个高质量RNA-SEQ转录组的纲要,通过将独立的组件分析应用于88个独特的增长条件,来表征其TRN。我们获得了78个独立调制的基因集(imodulons),这些基因(imodulons)在定量地描述了跨不同条件的TRN及其活性状态。Through analyses of condition-dependent TRN activity states, we (i) describe how the TRN adapts to different growth conditions, (ii) conduct a cross-species iModulon comparison, uncovering shared features and unique characteristics of the TRN across lineages, (iii) detail the transcriptional activation of several endogenous BGCs, including surugamide, minimycin and paulomycin, and (iv) infer potential functions of 40% albidoflavus基因组中未表征的基因。我们的发现提供了对Albidoflavus的TRN的全面和定量的理解,为进一步的探索和实验验证提供了知识库。
艾德斯·埃及林恩。(Diptera:culicidae)是登革热和基孔肯尼亚等最常见的引起疾病的arbovirus的载体之一。缺乏这些疾病的疫苗以及当前增加杀虫剂耐药性的问题加剧了寻找控制载体种群的新颖和有效方法的需求。因此,本文旨在研究菲律宾链霉菌与AE的生物学活性。埃及作为管理这些蚊子种群的潜在生物学剂。在测试生物学活性之前,使用其16S rRNA序列根据形态,文化和分子表征确定了八个放线菌分离株。生成的核苷酸序列的BLASTN结果显示出98–100%与不同链霉菌物种的相似性,并用GenBank登录号MZ317443 – MZ317450分配。在八个分离株中,针对3至5天的雌性艾迪斯埃及埃及成年人的CDC瓶生物测定法显示,CGS C13(92.68%),DK 5-10(85.53%)(85.53%)和CGS B11(81.91%)表现出最高的成人活性对照(均表现出较高的成人活动)。LC 50通过剂量反应生物测定测定表明,CGS B11的活性最高(2.838 ppm),其次是DK 5-10(6.083 ppm)和CGS C13(519.281 ppm)。这是关于这些链霉菌物种对AE的杀虫活性的第一份报告。埃及。
Muratina是Mt.肯尼亚,从蜂蜜自发发酵的葫芦中获得的蜂蜜发酵,干燥的kigelia africana(lam。)benth.fruits。葡萄酒的生产仍是使用传统技术进行的,并且从未扩大规模。它在社区中为文化和社会价值服务。这项研究的目的是表征和记录产品过程并评估Muratina的化学和微生物质量。生产过程涉及将水和蜂蜜分别以17升水和3公斤蜂蜜混合,然后在30°C的30°C中允许其在葫芦中发酵3-5天。Muratina的酒精含量为19.66±0.47(mL/100ml),pH值为4.06±0.12,可滴定酸度为7.57±0.45(G tartaric Acid/100 mL)。Muratina的微生物学分析显示,在2.1-5.5 x 103 CFU/mL的有氧中寄生者,实验室为3.2-7.7 x 104 cfu/ml,浓度为5.6 - 7.0 x 103 cfu/ml。实验室分离株的生化分析揭示了对OX GAL,pH和NaCl的各种抗性,表明它们可能用作益生菌。所有测试的分离株都能够承受3%的牛,尽管没有一个在pH 1-3下生长。使用API 50 CHL对实验室进行了识别,并使用API ID 32进行酵母菌的测序。分离株被鉴定为乳杆菌植物,spp和pediocococcus spp。酿酒酵母是分离的主要酵母。Muratina的高酒精含量表明它具有可能具有商业价值的酵母。
耐链霉素(SM)的结核分枝杆菌( M . tuberculosis )是结核病(TB)治疗中关注的焦点,但其具体的耐药机制尚不清楚。本研究主要通过多基因组学的联合分析,对链霉素耐药相关基因进行初步筛选。通过全基因组甲基化、转录组和蛋白质组分析,阐明结核分枝杆菌H37Rv中特定基因与链霉素耐药性的关联。甲基化分析显示,SM耐药组与正常组之间有188个基因存在差异甲基化,其中89个基因为高甲基化,99个基因为低甲基化。功能分析显示,这188个差异甲基化基因富集在74条通路中,多数富集在代谢途径中。转录组分析显示耐药组与正常组之间有516个差异表达基因,其中显著上调和下调的基因分别有263和253个。KEGG分析表明这516个基因富集在79条通路上,大多数基因富集在组氨酸代谢途径,甲基化水平与mRNA丰度呈负相关。蛋白质组分析发现56个差异表达蛋白,其中14个上调,42个下调。此外,通过综合分析获得了3个枢纽基因(coaE、fadE5和mprA)。本研究结果提示,整合的DNA甲基化、转录组和蛋白质组分析可为SM耐药结核分枝杆菌H37Rv的表观遗传学研究提供重要资源。
摘要:微生物技术在改进工业过程方面发挥着至关重要的作用,特别是在生产具有多种应用的化合物方面。在本研究中,我们使用生物信息学方法分析了链霉菌 MGMM6 的基因组结构,并确定了参与各种代谢途径的具有重大生物技术潜力的基因。基因组挖掘显示,MGMM6 由 6,932,303 bp 的线性染色体组成,G+C 含量高达 73.5%,缺乏任何质粒重叠群。在注释的基因中,预测有几个基因编码酶,例如染料过氧化物酶、芳香环开双加氧酶、多铜氧化酶、细胞色素 P450 单加氧酶和芳香环羟基化双加氧酶,这些酶负责生物降解多种内源性和外来污染物。此外,我们还鉴定了与重金属抗性相关的基因,例如砷、镉、汞、铬、碲、锑和铋,这表明 MGMM6 具有用于环境修复目的的潜力。对次生代谢物的分析表明,存在多个生物合成基因簇,这些基因簇负责产生具有强效抗菌和金属螯合活性的化合物。此外,在受控条件下进行的实验室测试表明,MGMM6 可有效抑制植物病原微生物,使废水中的芳香族三苯甲烷染料(尤其是 Blue Brilliant G250)脱色和降解,效果高达 98 ± 0.15%。总体而言,我们的研究结果凸显了 S. albidoflavus MGMM6 的生物技术潜力。
摘要:母乳喂养被认为是婴儿营养中的黄金标准,这不仅是因为母乳的内在营养益处,而且还因为不同生物活性组合(例如2-氟二氟霉素(2'FL))在母亲的牛奶中的含量高。它促进了其两个主要消费者Bi Fibacterium longum SSP的增长。iftantis和双杆菌双胞胎,但对婴儿微生物群的其他肠道微生物的影响仍未完全理解。pH无控制的粪便培养物,鉴定为“快速2'FL-degrader”微生物型表型,用于分离2'FL相关的微生物。使用特异性选择剂的使用允许B.b。IPLA20048和Gasseri IPLA2L20136成功隔离。2'FL消耗及其部分的特征表明,当两种微生物一起生长时,在2'FL消耗后的生长,pH下降和乳酸产生更为明显。结果表明,BIFUM IPLA20048和L. gasseri IPLA2L20136之间的关联,其中L. gasseri能够通过B. bifium B. bifium水解2'FL后从乳糖部分中使用半乳糖。在与乳酸杆菌共同培养中,对两组两组双杆菌(n = 38)的额外筛选(n = 38),快速降低了2'FL的降级器,基于从双杆菌2'FL BREAKEND中释放的降解产物的潜在交叉喂养机制。我们的工作表明,这种现象在婴儿肠道中可能广泛存在于乳酸杆菌和双杆菌中。需要进行更多的研究,以破译如何降解2'FL和其他人乳寡糖的能力如何影响新生儿中的微生物群建立以及成人生活中微生物群的演变。
