USDA/ERS:2000 年至 2016 年美国各州及全美转基因玉米、陆地棉和大豆品种;以及甜菜估计 https://www.ers.usda.gov/topics/crops/sugar-sweeteners/background /
本临时规则适用的联邦援助计划的名称和编号为:商品贷款和购买 - 10.051;稻米生产稳定 - 10.065;棉花生产稳定 - 10.052,详见《联邦国内援助目录》。已确定《监管灵活性法案》不适用于本临时规则的规定,因为农业稳定和保护局(“ASCS”)或商品信贷公司(“CCC”)均未根据《美国法典》第 553 章或任何其他法律规定发布有关本临时规则主题的拟议规则制定通知。环境评估已确定此行动不会对人类环境质量产生重大影响。因此,不需要环境评估或环境影响声明。该计划/活动不受行政命令 12372 规定的约束,该命令要求与州和地方官员进行政府间磋商。请参阅与 7 CFR 第 3015 部分第 V 部分相关的通知,发布于 48 29115(1983 年 6 月 24 日)。由于 1949 年法案规定大米营销证书计划、陆地棉一级经销商计划和陆地棉库存保护计划将于 1986 年 8 月 1 日开始实施,因此已确定此规则应于该日期生效。但是,请就该条款提出意见
摘要 CRISPR/Cas9 和 Cas12a (Cpf1) 工具已大规模用于基因组编辑。最近建立了一种具有单个核酸酶结构域、相对较小尺寸、低频率脱靶效应和高温下切割能力的新效应物,并将其命名为 CRISPR/Cas12b (C2c1)。Cas12b 还表现出在哺乳动物系统中的温度诱导性。因此,该系统对于编辑耐高温植物物种(如棉花)的基因组具有潜在价值。利用这种新系统,在一系列温度下通过农杆菌介导的遗传转化成功生成了陆地棉突变体。暴露在 45°C 下 4 天的转化子(被农杆菌感染的外植体)显示出最高的编辑效率。全基因组测序未检测到脱靶突变。T0 代中 AacCas12b 进行的基因组编辑忠实地传递给了 T1 代。综上所述,CRISPR/Cas12b 是一种高效、精确的棉花基因组编辑工具。
近年来,植物基因组学取得了重大进展,研究人员能够识别负责植物生长、发育和逆境反应的基因和基因组区域。2019 年植物基因组学特刊汇集了 57 篇论文,深入探讨了植物基因组学的各个方面,包括基因发现、数量性状位点(QTL)鉴定、基因组预测、基因组编辑、植物叶绿体基因组测序和比较分析、microRNA 分析和比较基因组学。这些研究广泛采用结合生物信息学和转录组分析的综合研究方法来识别响应各种生物和非生物逆境的基因 [ 1 , 2 ]。该方法包括(1)从参考基因组及其注释中全基因组识别所研究的基因家族,对已识别基因进行生物信息学分析,如染色体分布、基因结构、相似性和重复、保守结构域和基序分析以及系统发育分析; (2) 使用来自 Illumina RNA-Seq 测序和/或实时 PCR 分析的转录组数据,对不同胁迫处理下不同发育阶段的不同组织进行表达谱分析,并研究响应研究性状的基因沉默。使用这种方法,在 22 篇论文中,研究了已报道的各种基因家族,以识别响应非生物胁迫、果实成熟、种子发育、种子产量和花粉发育的基因,涉及 12 多个物种,例如番茄、小麦、桉树、烟草、葡萄、拟南芥、番茄、木薯、芜菁、陆地棉、谷子和西瓜。这些基因家族包括2-氧代戊二酸依赖性双加氧酶(2OGD)、细胞分裂素氧化酶/脱氢酶(CKX)、钙依赖性蛋白激酶(CPK)、核转运蛋白β、VQ、水通道蛋白、赤霉酸刺激的拟南芥(GASA)、YABBY转录因子、B3结构域转录因子、多聚半乳糖醛酸酶(PG)和果胶甲酯酶(PME)、MADS-box转录因子、WRKY转录因子、teosinte-branched 1/cycloidea/增殖(TCP)转录因子、III类过氧化物酶(POD)、糖苷水解酶家族1β-葡萄糖苷酶、RNA编辑因子、蛋白磷酸酶(PP2C)、LIM、油菜素类固醇信号激酶(BSK)和查尔酮合酶(CHS)。微小RNA(miRNA)是一类小RNA分子,在基因表达中发挥着重要的调控作用。两篇论文探讨了miRNA在不同植物物种中的作用。第一篇论文开发了一种人工miRNA前体系统,可以在拟南芥和水稻中高效克隆和沉默基因。该系统可以成为这些作物功能基因组学研究的宝贵工具[3]。第二篇论文鉴定并描述了亚麻籽(一种重要的油料作物)正在发育的种子中的miRNA[4]。结果表明,miRNA 在种子发育过程中发挥着重要作用,可以作为作物改良的靶标。总体而言,这些研究有助于我们了解 miRNA 在植物生长发育中的调控作用,并有望应用于作物改良。GWAS 已广泛用于识别与植物重要性状相关的 QTL 或数量性状核苷酸 (QTN)。本期的一篇精彩论文是关于与西瓜驯化相关的瓜氨酸变异的 GWAS 匹配单倍型网络 [ 5 ]。该论文确定了控制瓜氨酸合成的基因组区域,瓜氨酸是一种非蛋白氨基酸,在植物的生长发育中起着至关重要的作用。