单个粒子冷冻EM可以通过将嵌入在纳米厚的玻璃体冰中的几百万个纯化的蛋白质颗粒可视化到几百万纯化的蛋白质颗粒,从而重建蛋白质的接近原子或什至原子分辨率3D蛋白质。这对应于纯化蛋白质的皮克图,这些蛋白质可以从几千个细胞中分离出来。因此,Cryo-Em具有最敏感的分析方法之一,该方法提供了高分辨率蛋白质结构作为读数。实际上,准备低温EM网格需要超过一百万倍的起始生物材料。为了缩小差距,我们开发了一种微分离(MISO)方法,该方法将基于微流体的蛋白质纯化与冷冻EM网格制剂相结合。我们验证了可溶性细菌和真核膜蛋白的方法。我们表明,Miso可以从一个微克的靶蛋白微克开始,并在几个小时内从细胞到冷冻EM网格。这将纯化缩短了几百到几千倍,并为迄今无法访问的蛋白质的结构表征打开了可能性。
皮肤鳞状细胞癌 (cSCC) 是具有转移潜能的最常见癌症类型之一。microRNA 在转录后水平调节基因表达。在本研究中,我们报告 miR- 23b 在 cSCC 和光化性角化病中下调,并且其表达受 MAPK 信号通路调控。我们发现 miR-23b 抑制与关键致癌途径相关的基因网络的表达,并且 miR-23b 基因特征在人类 cSCC 中富集。miR-23b 降低了 FGF2 在 mRNA 和蛋白质水平的表达,并削弱了 cSCC 细胞的血管生成诱导能力。miR23b 过表达抑制了 cSCC 细胞形成集落和球体的能力,而 CRISPR/Cas9 介导的 MIR23B 缺失导致体外集落和肿瘤球形成增加。与此一致,miR-23b 过表达的 cSCC 细胞在注射到免疫功能低下的小鼠体内后,形成的肿瘤明显较小,细胞增殖和血管生成减少。从机制上讲,我们证实 RRAS2 是 miR-23b 在 cSCC 中的直接靶标。我们表明 RRAS2 在 cSCC 中过表达,干扰其表达会损害血管生成和集落和肿瘤球的形成。总之,我们的结果表明 miR-23b 在 cSCC 中以肿瘤抑制的方式发挥作用,并且在鳞状细胞癌变过程中其表达会降低。
背景:RNA 结合蛋白 IGF2BP2/IMP2/VICKZ2/p62 是一种癌胚蛋白,在几种癌症实体中过表达。利用 IMP2 敲除的结肠直肠癌细胞,我们可以展示 IMP2 在几种癌症特征中的重要作用。本研究旨在从功能上表征肺癌(A549、LLC1)和肝细胞癌(HepG2、Huh7)细胞系中的 IMP2,以评估其作为这些癌症实体的潜在靶点的作用。方法:通过 CRISPR/Cas9 及其变体方法主要编辑产生 IMP2 敲除;通过下一代测序验证两种单向导 RNA(sgRNA)的编辑效率。我们研究了 IMP2 敲除对细胞增殖、菌落形成和迁移的影响,并采用了 IMP2 的小分子抑制剂。结果:尽管多次尝试,但无法在 A549 和 Huh7 细胞中产生 IMP2 双等位基因敲除。两种 sgRNA 均表现出良好的编辑效率。然而,编辑后的细胞失去了增殖能力。使用 CRISPR/Cas9 在 LLC1 细胞中生成 IMP2 双等位基因敲除的尝试取得了成功。IMP2 的单等位基因敲除细胞系显示 2D 细胞增殖减少和迁移减少。在 3D 培养中,观察到形态从紧凑的球体变为松散的聚集体,并且 IMP2 敲除的集落形成能力明显降低,这种效果与先前发现的 IMP2 抑制剂化合物相似,也显示出对集落形成的抑制作用。结论:我们的体外靶标验证支持 IMP2 对几种癌症实体中的肿瘤细胞增殖、迁移和集落形成至关重要。
背景:子宫内膜癌是全球最常见的妇科恶性肿瘤之一。本研究的目的是寻找子宫内膜样子宫内膜癌的新治疗靶点。材料和方法:进行生物信息学分析,筛选出CDK1作为EC发病机制中的关键基因之一。免疫组织化学方法验证子宫内膜癌组织中CDK1的表达。通过细胞活力和集落形成实验研究CDK1对体外子宫内膜癌细胞增殖和集落形成的影响。通过细胞凋亡和细胞周期实验阐明CDK1影响细胞增殖的机制。进行肿瘤异种移植试验以显示CDK1对体内子宫内膜癌细胞生长的影响。结果:CDK1在子宫内膜样子宫内膜癌中过表达,细胞质CDK1的积累与EC的组织学分级有关。 CDK1在体外促进子宫内膜癌细胞生长和克隆形成。抑制CDK1活性可诱导细胞凋亡,使子宫内膜癌细胞细胞周期停滞于G2/M期。抑制CDK1活性也可抑制异种移植模型中的子宫内膜癌生长。结论:CDK1参与了子宫内膜样子宫内膜癌的发病机制,为子宫内膜样子宫内膜癌的治疗提供了新的靶点。
目的:据报道,泛素特异性肽酶 5 (USP5) 可促进多种恶性肿瘤的进展。它可能通过调节细胞周期和集落形成来影响癌症的发展。在胰腺癌中,USP5 的生物学功能,特别是在迁移和侵袭方面的作用仍不清楚。方法:使用免疫组织化学 (IHC) 检测原发性胰腺癌和淋巴结转移组织中 USP5 蛋白的表达水平。使用 χ 2 检验、Kaplan-Meier 分析、单变量和多变量分析来评估 USP5 表达与临床病理特征之间的关系。进行 RT-qPCR 以定量胰腺癌细胞系中 USP5 的 mRNA 表达水平。进行 CCK8 和集落形成试验以证明 USP5 在增殖中的作用。通过 Transwell 和划痕愈合试验评估肿瘤转移。通过蛋白质印迹检测 EMT 和 STAT3 信号相关标志物。结果:(1)USP5蛋白表达水平与肿瘤分化程度、CEA及CA19-9水平相关。(2)单因素及多因素分析均显示USP5高表达是胰腺癌的不良预后因素,Kaplan–Meier分析直接表明USP5高表达患者总生存期较短。(3)USP5表达增高与胰腺癌的增殖和转移均相关。(4)USP5被证实介导胰腺癌细胞中的STAT3信号传导。结论:研究结果提示USP5在胰腺癌患者中高表达并可能具有临床意义。USP5高表达通过激活STAT3信号传导促进进展和转移。因此,USP5可能是胰腺癌治疗的潜在靶点。
在两种情况下(培养未分化细胞和 CD56 + 细胞期间)孵育后,计算集落形成单位(CFU,具有超过 100 个细胞的神经球)、簇形成单位(ClFU,30 至 100 个细胞的神经球)的含量、CFU 的有丝分裂活性及其特化强度。使用羟基脲(1 µ M)通过细胞自杀技术评估祖细胞的增殖活性。[6] 细胞周期 S 期的 CFU 池根据以下公式确定:N = [( ab)/a ] × 100%,其中 a 是未用羟基脲处理的细胞的 CFU 数量的组平均值;b — 用羟基脲处理的细胞的 CFU 数量的组平均值。通过计算 ClFU 与 CFU 的比率来确定祖细胞特化过程的强度(分化指数)。[6,9]
剂量密集化疗和标准化疗之间的毒性只有微小差异。在四项试验中,剂量密集化疗组的贫血和口腔炎发生率高于对照组。在两项和四项试验中,接受剂量密集化疗的受试者中,有更高比例的人出现 3 级或以上腹泻和呕吐症状(在试验中分类不同)。荟萃分析的作者指出,使用集落刺激生长因子 (G-CSF) 来降低剂量密集化疗组发生中性粒细胞减少事件的风险,使得不同治疗方法之间的血液学毒性比较变得复杂,两项试验中,剂量密集化疗治疗中记录的白细胞减少症发生率在统计学上显著降低。
图 1. 人类 iPSC 发育成脑类器官的代表性图像。(A) 健康个体的人类诱导多能干细胞集落。(B) 接种在圆底板中的 DIV2 胚状体。(C) DIV7 胚状体,神经外胚层的形成表现为胚状体周围的光晕。(D) DIV10 胚状体嵌入 Matrigel 中,支持神经上皮的形成。(E) DIV13 脑类器官,神经花结的存在代表干细胞分化为神经祖细胞。(F) DIV34 脑类器官,其中类器官的直径 >1,000 µm。(G) DIV35 类器官中神经元前体 SOX2(红色)和成熟神经元 NeuN(白色)的免疫组织化学染色。
目的:探讨LZAP在宫颈癌发生发展中的关系及作用机制,为宫颈癌的治疗提供新的靶点和干预方法。方法:利用TCGA等在线数据库对LZAP表达水平进行数据挖掘和分析,建立稳定过表达LZAP的宫颈癌细胞株,探讨LZAP过表达对细胞增殖、侵袭、迁移及体内成瘤的影响及其作用机制。结果:研究显示,LZAP在宫颈癌中表达上调,LZAP过表达能显著促进宫颈癌细胞的增殖、集落形成、侵袭和迁移能力。裸鼠成瘤试验显示,LZAP过表达可促进宫颈癌细胞在体内的成瘤性;LZAP还能促进AKT473位点磷酸化,促进上皮间质转化(EMT)。结论:LAZP在宫颈癌中表达增高,并通过促进AKT磷酸化增强宫颈癌细胞的侵袭、转移及EMT。