预测氨基酸取代引起的蛋白质热稳定性的变化对于了解人类疾病和工程有用的蛋白质对临床和工业应用至关重要。虽然蛋白质生成模型的最新进展是在以结构或进化序列环境为条件的氨基酸上学习概率分布的,但在没有任务特异性训练的情况下预测各种蛋白质特性方面表现出了令人印象深刻的性能,但其强大的无监督预测能力并未扩展到所有蛋白质功能。尤其是,它们改善蛋白质稳定性预测的潜力仍未得到探讨。在这项工作中,我们提出了一个新颖的深度学习框架,它可以适应和整合两个通用蛋白质生成模型 - 一种蛋白质语言模型(ESM)和一个反折叠模型(ProteinMPNN) - 有效的稳定性预测器。马刺采用轻量级的神经网络模块来将蛋白质MPNN学到的每个残留结构表示形式重新融合到ESM的注意层中,从而为ESM的序列表示学习提供了信息。这种重新布线策略使马刺能够从序列和结构数据中利用进化模式,在这种数据中,ESM所学的序列类似分布的条件是基于由蛋白质MPNN编码的结构先验,以预测突变效应。我们通过在最近发布的Mega规模的热稳定性数据集中进行监督的培训将该集成的框架引导到稳定预测模型。此外,它通过用作提高准确性的稳定性模型来增强当前的低N蛋白适应性预测模型。在12个基准数据集中进行的评估表明,马刺提供了准确,快速,可扩展和可推广的稳定性预测,并且始终超过了当前的最新方法。值得注意的是,马刺在蛋白稳定性和功能分析中表现出显着的多功能性:与蛋白质语言模型结合使用时,它以无监督的方式准确地识别蛋白质功能位点。这些结果突出显示了马刺是推动当前蛋白质稳定性预测和机器学习引导的蛋白质启动工作流程的强大工具。马刺的源代码可在https://github.com/luo-group/spurs上获得。
体外模型现已成为心脏毒性评估动物模型的现实替代品。但是,实施体外电生理系统来研究心脏细胞所需的成本和专业知识构成了广泛使用的强大障碍。这项研究介绍了一种新型的,具有成本效益的方法,用于使用完全印刷的石墨烯的微电极阵列(PGMEAS)以及开源信号采集系统结合使用的全印刷石墨烯的微电极阵列(PGMEAS)。我们表征了PGMEAS的电性能和生物相容性,观察到低阻抗值和细胞活力。我们证明了该平台从HL-1细胞培养物中记录自发的电生理活性的能力,并监测和量化了它们对去甲肾上腺素的化学刺激的反应。这项研究证明了为体外电生理学产生完全印刷的基于石墨烯的设备的可行性。我们在这里提供的可访问且通用的平台代表了开发心脏安全筛查替代方法的进一步。
kfbg位于香港最高山的Tai Mo Shan北部山坡上的农村新地区,那里有两个陡峭的马刺将其深层的山谷围起来。在肯基布(KFBG)内,有溪流,林地,果园,蔬菜花园,步行小径,专注于活动物,植物群和艺术的独立展览,可持续的农业示范地,一个野生动物救援中心,一个本地的树木托儿所,保护和教育设施,以及魔法,魔术,莫斯蒂·弗恩花园。肯德基的一个特别部门是绿色枢纽,绿色枢纽位于经过翻新的旧太极警察局(Tai Po Police Stoilt) - 这是一座1年级的历史建筑,可追溯到1899年 - 我们在那里运行社区计划,以展示我们如何可持续地生活,同时又尊重大自然和彼此。此外,2024年4月,我们开设了Kadoorie Center Food Hub,用于住宅务虚会和创新的烹饪。更多关于明年的信息!
葡萄树干疾病(GTD)给全球葡萄行业造成严重的经济损失(Fontaine等,2016b; Mondello等,2018a)。休闲药包括各种分类学上的真菌(Gramaje等,2018; Mondello等人,2018b),可以单独或一起影响植物。除了在叶子和簇上引起外部症状外,这些病原体还会引起内部木材变色。症状表达中不可预测的不连续性是这些疾病的特征(Mugnai等,1999)。GTD包括影响成年和年轻葡萄藤的一系列疾病。esca复合物,杂化磷酸盐死亡和尤特巴死亡被认为是成年葡萄藤的主要GTD(Claverie等,2020)。ESCA复合物与许多系统发育多样的真菌有关(Mugnai等,1999),包括ascomycota和basidiomycota。与ESCA相关的comycetes包括血管病原体phaeomoniella chlamydospora和phaeoacremonium最低限度(Syn。pm。Aleophilum)(u rbez-Torres等,2014)和其他phaeoacremonium。Wood-decay basidiomycetes include Fomitiporia mediterranea in Europe ( Moretti et al., 2021 ), and other pathogens belonging to the genera Fomitiporella, Fomitiporia, Inocutis, Inonotus, Stereum , and Phellinus in non-European countries ( Cloete et al., 2011 ; White et al., 2011 );这些真菌已从受感染的葡萄树干中分离出来,但是它们在疾病病因学中的作用尚未完全了解(Surico等,2006; Bertsch等,2013; Gramaje等,2018),并且在近年来被重新考虑。botryosphaeria dieback是由20种以上的杂化磷酶科引起的,包括dothidea N. Luteum,N。Rib,Eliplodia Serita和D. Mutila(Van Niekerk等,2004; Taylor等,2005;ÚRbez-Torres and Gubler,2009; Amponsah et al。 2013)。eutypa dieback是由eutypa lata和其他diatrypaceai特殊的特殊的(Trouillas and Gubler,2010; Luque等,2012)。这些病原体可以单独从受影响的木材中回收,也可以与其他真菌(例如PA)相结合。衣原体,下午。Aleophilum,Sphaeropsis Mariorum和Diaporthempelina(PéRros等,1999)。GTD症状是多缩的,包括马刺和手臂的死亡,木材的变色或内部条纹,扇形木材坏死和白色腐烂;由于植物可以同时受到多种真菌的影响,因此在其中GTD中,某些症状可能重叠(Gramaje等,2018)。木材变色和de骨是由多种结构和生理变化引起的,由真菌产生的纤维素分解和木质素溶酶,由于凝胶和牙龈由联邦木质部分泌的凝胶和牙龈引起的血管闭塞细胞或木质部实质细胞的坏死,导致真菌毒素(Bertsch等,2013; Claverie等,2020)。所有这些变化都会导致木质部伏特定功能的木质部发生变化,从而导致水和养分运动(Mugnai等,1999; Sparapano等,2000; Andol和Andol et et al。,2011)。最近报道了(Mondello等,2018b),详细描述了与不同GTD的症状。叶子从未分离出GTD真菌(Bertsch等,2013),也显示了多种症状,也已经描述过这些症状(Mugnai等,1999;Amborabé等,2001; Mondello et al。,2018b);木材和木质部血管改变,真菌毒素和继发代谢物的沉积均有助于