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摘要 马达加斯加长春花(Catharanthus roseus)属于夹竹桃科。这种药用植物原产于马达加斯加,可生产许多重要药物,包括单萜吲哚生物碱 (MIA) 长春新碱和长春花碱,用于世界各地治疗癌症。在这里,我们提供了一个新版本的 C. roseus 基因组序列,该序列是通过结合 Oxford Nanopore Technologies 长读和 Illumina 短读获得的。这个更连续的组装由 173 个支架组成,总长度为 581.128 Mb,N50 为 12.241 Mb。使用公开的 RNAseq 数据,预测并功能注释了 21,061 个蛋白质编码基因。总共 42.87% 的基因组被注释为可转座因子,其中大多数是长末端重复序列。随着对 MIA 产生植物基因组的了解日益增多,这个更新版本应该会简化进化研究,从而更好地了解 MIA 生物合成途径的进化。

马达加斯加长春花基因组的最新版本

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