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图1。Spade的示意图。Spade是一种用于空间转录组学数据设计的工具,该工具使用参考单细胞RNA测序数据来确定样品中每个位置的单元格类型比例。它首先使用组织学,空间位置和基因表达来识别组织中的空间结构域。随后,Spade通过识别存在的特定细胞类型对每个域进行全面分析。获得细胞类型信息后,Spade会使用SCRNA-SEQ数据进行反卷积。此过程的结果是每个空间位置的细胞类型比例的估计。
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