eDNA 长读揭示的新真菌门和类

长读长测序技术的最新进展已经产生了大量有关真核生物的高质量 rRNA 标记基因数据,但其中许多类群在最高分类水平(门和界)上仍然未知。现在,通过对 EUKARYOME 长读数据库的彻底分析,Leho Tedersoo 教授(爱沙尼亚塔尔图大学)领导的国际团队发现,很大一部分未知真核生物属于深层的、迄今为止尚未描述的真菌谱系。

来源:英国物理学家网首页
最大似然 SSU-5.8S-LSU 系统图,指示真菌王国中新谱系的位置,以彩色阴影和红色字体突出显示。先前描述的分类进化枝被瓦解了。图片来源:MycoKeys (2025)。 DOI:10.3897/mycokeys.124.161674
MycoKeys

长读长测序技术的最新进展已经产生了大量有关真核生物的高质量 rRNA 标记基因数据,但其中许多类群在最高分类水平(门和界)上仍然未知。现在,通过对 EUKARYOME 长读数据库的彻底分析,Leho Tedersoo 教授(爱沙尼亚塔尔图大学)领导的国际团队发现,很大一部分未知真核生物属于深层的、迄今为止尚未描述的真菌谱系。

通过开发创新的分类学方法并进行严格的系统发育分析,研究人员描述了从目到门级别的 30 种新真菌谱系,包括这些类群的模式种。他们在 MycoKeys 上发表了论文。

分类 纸张

新分类群的名称由所有合著者制定并投票选出,其中使用母语词干(美洲印第安语、萨米语、爱沙尼亚语)来指代模式产地的名称占主导地位。作者还提出了分类学术语“nucleotype”和“legitype”,分别指代源自正型标本的 DNA 样本和 DNA 序列,在某些情况下(例如,当正型标本丢失时)也可以用作类型。

Tedersoo 及其同事开发的分类方法提供了一种描述和交流看不见的、可能无法培养的微型真核生物类群的方法。

更多信息:Leho Tedersoo 等人,三十种新颖的真菌谱系:基于环境样本和 DNA 的正式描述,MycoKeys (2025)。 DOI:10.3897/mycokeys.124.161674 mycokeys.pensoft.net/article/161674/

更多信息: DOI:10.3897/mycokeys.124.161674 mycokeys.pensoft.net/article/161674/