生成式 AI 模型描绘了新抗生素如何针对肠道细菌

通过使用 AI 筛选 10,000 多个分子,研究人员发现了肠洛林(插图),这种化合物可以阻断有害肠道细菌的关键途径,并且在患有 IBD 的小鼠中,可以在不干扰其余微生物群的情况下缓解感染。图片来源:Alex Shipps/MIT CSAIL,使用研究人员和 Pexels 的资产。作者:雷切尔·戈登 […]

来源:ΑΙhub

通过使用 AI 筛选 10,000 多个分子,研究人员发现了肠洛林(插图),这种化合物可以阻断有害肠道细菌的关键途径,并且在患有 IBD 的小鼠中,可以在不干扰其余微生物群的情况下缓解感染。图片来源:Alex Shipps/MIT CSAIL,使用研究人员和 Pexels 的资产。

作者:雷切尔·戈登

对于炎症性肠病患者来说,抗生素可能是一把双刃剑。通常用于治疗肠道炎症的广谱药物可以杀死有益微生物和有害微生物,有时会随着时间的推移使症状恶化。在对抗肠道炎症时,您并不总是想带着大锤去进行刀战。

麻省理工学院计算机科学与人工智能实验室 (CSAIL) 和麦克马斯特大学的研究人员发现了一种采用更有针对性的方法的新化合物。这种被称为肠洛林的分子可以抑制一组与克罗恩病爆发有关的细菌,同时使其余的微生物群基本保持完整。使用生成式人工智能模型,该团队绘制了该化合物的工作原理图,这一过程通常需要数年时间,但在这里加速到了短短几个月。

鉴定出一种新化合物

“这一发现说明了抗生素开发中的一个核心挑战,”该研究的一篇新论文的资深作者、麦克马斯特大学生物化学和生物医学助理教授、麻省理工学院安利捷健康机器学习诊所的研究助理 Jon Stokes 说道。 “问题不在于找到杀死培养皿中细菌的分子——我们长期以来一直能够做到这一点。一个主要障碍是弄清楚这些分子在细菌内部的实际作用。如果没有详细的了解,你就无法将这些早期抗生素开发成对患者安全有效的疗法。”

关于该工作的新论文 大肠杆菌 DiffDock 大肠杆菌

研究人员将测序数据发布在公共存储库中,并在 GitHub 上公开发布了 DiffDock-L 代码。

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