AI仍然与蛋白质斗争:来自形状转化的血蛋白的教训

在布鲁塞尔国际化学研究所的研究人员,根特大学Vrije Universiteit的结构生物学研究小组,根特大学的IbiTech-Biommeda小组揭示了与炎症和癌症(Alpha-1 accId-Acacid Glycopopotin(Agp)相关的关键血液蛋白如何参与 - 这些发现说明了甚至最强大的AI工具在理解这些动态生物学过程时的局限性。 与巴西几家机构的生态学家和昆虫学家团队,与墨西哥的一位同事合作,观察到胆量第一次为胆汁诱发的胆小鬼象鼻虫提供保护。该组织在发表在《生态学》杂志上的论文中描述了他们如何在巴西米纳斯·格拉斯(Minas Gerais)的一个农场发生大火后,在索拉纳姆·利卡帕姆植物(Solanum Lycocarpum)植物的一些胆汁中活着。 非洲主要是雨林的农业部门非常容易受到不稳定的降雨和气候变化的影响。尽管具有巨大的灌溉潜力,但目前只有一小部分非洲耕地可以进行灌溉。 政府需要采取紧急措施,以扭转英格兰大街的恶化,尤其是在北部以及更贫穷的沿海地区。

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在布鲁塞尔国际化学研究所的研究人员,根特大学Vrije Universiteit的结构生物学研究小组,根特大学的IbiTech-Biommeda小组揭示了与炎症和癌症(Alpha-1 accId-Acacid Glycopopotin(Agp)相关的关键血液蛋白如何参与 - 这些发现说明了甚至最强大的AI工具在理解这些动态生物学过程时的局限性。 Bhawna Dixit博士作为博士学位论文的一部分进行了研究。她专注于AGP,因为它在人血浆中很丰富,并以调节免疫反应及其与药物相互作用而闻名。 进行了研究 尽管进行了数十年的研究,但其全部行为仍然是一个神秘的,主要是因为该蛋白质已大量糖基化,这意味着它具有附着在特定位点的复杂糖分子(称为聚糖)。这些聚糖具有高度动态性和可变性,为其结构增添了显着的复杂性。 使用分子模拟,Dixit博士和她的同事表明,即使在癌症患者中发现的AGP中的一些小基因突变也可以大大改变蛋白质的移动和与药物相互作用。在存在或不存在特定的聚糖的情况下,这些影响会变得更加复杂,这些聚糖会根据人体的疾病或炎症状态转移。 癌症患者 “蛋白质中的一个微小变化,尤其是在其糖基化位点附近,可以完全重塑其行为方式,” Dixit说。 “这对精密医学如何对不同人的工作方式具有真正的影响。” 在发表在《分子生物学杂志》上的后续研究中,研究人员评估了Alphafold是一种以预测蛋白质结构而闻名的备受瞩目的AI系统,是否可以捕获各种蛋白质集中的柔性和动态性质。 已发布 分子生物学杂志 实验数据 计算生物学 更多信息:

在布鲁塞尔国际化学研究所的研究人员,根特大学Vrije Universiteit的结构生物学研究小组,根特大学的IbiTech-Biommeda小组揭示了与炎症和癌症(Alpha-1 accId-Acacid Glycopopotin(Agp)相关的关键血液蛋白如何参与 - 这些发现说明了甚至最强大的AI工具在理解这些动态生物学过程时的局限性。

Bhawna Dixit博士作为博士学位论文的一部分进行了研究。她专注于AGP,因为它在人血浆中很丰富,并以调节免疫反应及其与药物相互作用而闻名。

进行了研究

尽管进行了数十年的研究,但其全部行为仍然是一个神秘的,主要是因为该蛋白质已大量糖基化,这意味着它具有附着在特定位点的复杂糖分子(称为聚糖)。这些聚糖具有高度动态性和可变性,为其结构增添了显着的复杂性。

使用分子模拟,Dixit博士和她的同事表明,即使在癌症患者中发现的AGP中的一些小基因突变也可以大大改变蛋白质的移动和与药物相互作用。在存在或不存在特定的聚糖的情况下,这些影响会变得更加复杂,这些聚糖会根据人体的疾病或炎症状态转移。

癌症患者

“蛋白质中的一个微小变化,尤其是在其糖基化位点附近,可以完全重塑其行为方式,” Dixit说。 “这对精密医学如何对不同人的工作方式具有真正的影响。”

在发表在《分子生物学杂志》上的后续研究中,研究人员评估了Alphafold是一种以预测蛋白质结构而闻名的备受瞩目的AI系统,是否可以捕获各种蛋白质集中的柔性和动态性质。 已发布 分子生物学杂志 实验数据 计算生物学更多信息: