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蝙蝠侠将T细胞受体疗法带出阴影
想象一下您的免疫细胞可以修饰以攻击任何形式的癌症。 T细胞受体(TCR)疗法有可能成为普遍的癌症治疗。但是有风险。癌细胞和健康细胞之间的相似性会影响人体的免疫反应,从而导致T细胞攻击意外的靶标。
来源:英国物理学家网首页想象一下您的免疫细胞可以修饰以攻击任何形式的癌症。 T细胞受体(TCR)疗法有可能成为普遍的癌症治疗。但是有风险。癌细胞和健康细胞之间的相似性会影响人体的免疫反应,从而导致T细胞攻击意外的靶标。
TCR疗法需要激光聚焦以防止友好的火灾。在冷泉港实验室(CSHL)开发的新的和奇怪的AI可以提供。
它是如何工作的,为什么我们需要AI来工作?在生物学中,细胞通过在其表面上显示肽来宣布其状态。 T细胞使用这些肽来区分癌细胞和健康细胞。但是,人体中的肽和TCR的数量是巨大的,使确定给定TCR可以结合的肽几乎不可能且非常昂贵。
肽为了解决这个问题,CSHL助理教授Hannah Meyer与Saket Navlakha副教授和博士后Amitava Banerjee合作。该团队开发了一个大型的新数据库,其中包含22,000多种TCR肽相互作用。他们称其为蝙蝠洞。散布数据集这将需要一生。因此,团队建立了AI模型。您如何称呼AI设计用于梳理蝙蝠洞?除了蝙蝠侠,还有什么。
这项工作已发表在细胞系统中。
单元系统Navlakha解释说:“我们在一堆TCR上训练了[蝙蝠侠]以及他们认识的内容。但是给我一个不在数据库中的新TCR,我需要弄清楚它与什么结合。因此,我们问,我应该选择哪些最好的肽来做出预测?”
在测试过程中,蝙蝠侠在准确预测哪种肽与给定的TCR结合方面优于竞争模型。英勇的AI还揭示了为什么看似无关的肽被交火捕获。
有关免疫系统的问题 更多信息: doi:10.1016/j.cels.2025.101345期刊信息:单元系统
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