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蝎子的基因组规模系统发育:模型比较和位点组成异质性建模 div>
蝎子的基因组规模系统发育:模型比较和位点间组成异质性建模摘要蝎子的进化史是一个备受关注的课题,蝎子是最具魅力的节肢动物群之一,已描述的物种超过 2,500 种。鉴于其独特的身体结构和古老的化石记录,了解其系统发育至关重要。最近的基因组规模数据已显示出阐明蝎子生命树中科间关系的潜力;然而,分子数据集之间也存在差异。为了解决这个问题,我们通过综合之前的三项系统基因组学研究,使用考虑位点间组成异质性的模型比较方法探索了蝎子的系统发育关系。我们的分析表明,在无限位点异质性 CAT 和有限混合模型下,蝎目内的关系与普遍结论有显著不同,尤其是关于布提达内的科间关系。我们的结果表明了以下关系:[Pseudochactoidea + [Buthoidea + Chaeriloidea]]。我们的留一交叉验证分析表明,位点异质性 CAT-GTR+G 模型的拟合效果明显优于位点同质性模型 (LG) 和有限混合模型 (LG+C20、LG+C60),并且它识别了蝎子系统发育中的争议节点。这些分析解决了深层蝎子系统发育中长期存在的争议,并强调了
来源:Arácnido蝎子的基因组规模系统发育:模型比较和位点间组成异质性的建模
摘要
蝎子的进化史是一个备受关注的课题,蝎子是最具魅力的节肢动物群之一,已描述的物种超过 2,500 种。鉴于其独特的身体结构和古老的化石记录,了解其系统发育至关重要。最近的基因组规模数据已显示出阐明蝎子生命树中科间关系的潜力;然而,分子数据集之间也存在差异。为了解决这个问题,我们通过综合之前的三项系统基因组学研究,使用考虑位点间组成异质性的模型比较方法,探索了蝎子的系统发育关系。我们的分析表明,在无限位点异质性 CAT 和有限混合模型下,蝎目内部的关系与普遍结论有显著差异,尤其是关于 Buthida 内部科间关系。我们的结果显示以下关系:[Pseudochactoidea + [Buthoidea + Chaeriloidea]]。我们的留一交叉验证分析表明,位点异质性 CAT-GTR+G 模型的拟合效果明显优于位点同质性模型 (LG) 和有限混合模型 (LG+C20、LG+C60),并且它识别了蝎子系统发育中的有争议的节点。这些分析解决了深层蝎子系统发育中长期存在的争议,并强调了充分建模成分异质性对于重建蝎子深层系统发育的重要性。