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沙漠蝎 Mesobuthus przewalskii 的染色体水平基因组组装

2024年10月22日 20:43 33 Comments
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亚洲旱地沙漠蝎 Mesobuthus przewalskii 的染色体水平基因组组装摘要蝎子是具有医学重要性的古老而迷人的节肢动物群，但该群体的高质量参考基因组仍然缺乏。在这里，我们对塔克拉玛干沙漠特有的沙漠蝎子 Mesobuthus przewalskii 进行了全基因组测序。我们结合 PacBio HiFi 测序和 Hi-C 染色体构象捕获，为这种具有医学重要性的蝎子生成染色体水平、单倍型解析和完全注释的基因组组装。组装由两个单倍型（分别为 1052.01 Mbp 和 1055.19 Mbp）组成，达到染色体水平的连续性和 >98% 的 BUSCO 完整性。序列锚定在 13 条染色体上，重叠群 N50 为 34.44 Mbp，支架 N50 为 81.43 Mbp。还提供了几个关键基因组特征和线粒体基因组组装。该基因组代表了蝎目中的第五个但最完整的组装。Su, Y., Xiu, M., Yang, H., & Shi, C. 亚洲旱地沙漠蝎 Mesobuthus przewalskii 的染色体水平基因组组装。遗传杂志。https://doi.org/10.1093/jhered/esae059

来源:Arácnido
蝎子是一群具有医学重要性的节肢动物的古老而有魅力的群体，但仍然缺乏该群体的高质量参考基因组。在这里，我们对塔克里马坎沙漠中特有的沙漠蝎子进行了中库斯·普雷瓦尔斯基（Mesobuthus Przewalskii）进行全基因组测序。我们将PACBIO HIFI测序和HI-C染色体构象捕获，以生成染色体水平，单倍型分辨和完全注释的基因组组装，以实现这一重要的医学性蝎子。该组件由两种单倍型（分别为1052.01 MBP和1055.19 MBP）组成，分别达到染色体水平的连续性和> 98％的BUSCO完整性。将序列锚定在13个染色体中，其中重叠群N50为34.44 Mbp，而支架N50为81.43 Mbp。还提供了几种关键基因组特征和线粒体基因组组件。该基因组代表了Scorpiones.su，Y.，Xiu，M.，Yang，H。，H。和Shi，C。的第五个但最完整的组装。遗传期刊。 https://doi.org/10.1093/jhered/esae059
Mesobuthus przewalskii

su，Y.，Xiu，M.，Yang，H。，＆Shi，C。来自亚洲旱地的染色体级基因组组装组装。遗传期刊。 https://doi.org/10.1093/jhered/esae059

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