Next-Generation PCR Instruments Boost Workflows
现代、直观、可靠的热循环仪擅长优化测序、克隆和基因分型通量。
蜘蛛 Steatoda sp. 的鱼精蛋白提供了精子发生过程中液-液相分离染色质转变的一个例子尽管关于脊椎动物精子核碱性蛋白 (SNBP) 的信息非常丰富,但相比之下,关于节肢动物的信息却非常少。本文旨在通过分析假寡妇蜘蛛 Steatoda nobilis(蜘蛛目,球蛛科)精子中的这些蛋白质来填补这一空白。为此,我们开发了一种蛋白质提取方法,可以提取含半胱氨酸和不含半胱氨酸的鱼精蛋白,适用于从起始组织材料数量有限的样本中制备和分析 SNBP。我们进行了自上而下的质谱测序和分子系统发育分析,以表征 S. nobilis 和其他蜘蛛的鱼精蛋白。我们还使用电子显微镜分析了 Steatoda 精子的染
“A Total Shock” – Japanese Sardines Detected in U.S. Waters
2022 年和 2023 年对太平洋沙丁鱼进行的基因组测序发现,加州洋流中不仅存在一种沙丁鱼,而是两种不同的沙丁鱼。当研究科学家 Gary Longo 首次审查沙丁鱼基因组分析的结果时,他认为他一定是混淆了样本。除了常见的太平洋沙丁鱼 [...]
Newly Found Fat Cell Uses a Different Approach to Heat the Body
单细胞测序揭示了 10 种脂肪细胞,其中一种使用替代的热调节策略来防止体重增加。
Genomic Advances Promise New Era for Early Disease Detection in Infants
一项新研究表明,使用 DNA 分析进行新生儿筛查可以发现比传统方法更严重但可治疗的健康状况。这项名为 GUARDIAN 的研究是首批使用基因组测序进行新生儿筛查的大型项目之一,早期结果表明,这种方法可以大大改善儿童的医疗保健。早期 [...]
Ceroptres promethei Nastasi, Smith, & Davis, in Nastasi, Smith, Davis, Ward, Brown, Zhuang, Rollins, Friesen, Tribull, Forbes et Deans, 2024. DOI: 10.11646/zootaxa.5508.1.1摘要我们描述了新物种Ceroptres Hartig, 1840(膜翅目:Cynipidae:Ceroptresini)由 Ward 等人测序的凭证材料代表。 (2024)。我们描述了 22 个新物种,全部由 Nastasi、Smith 和 Davis 创
亚洲旱地沙漠蝎 Mesobuthus przewalskii 的染色体水平基因组组装摘要蝎子是具有医学重要性的古老而迷人的节肢动物群,但该群体的高质量参考基因组仍然缺乏。在这里,我们对塔克拉玛干沙漠特有的沙漠蝎子 Mesobuthus przewalskii 进行了全基因组测序。我们结合 PacBio HiFi 测序和 Hi-C 染色体构象捕获,为这种具有医学重要性的蝎子生成染色体水平、单倍型解析和完全注释的基因组组装。组装由两个单倍型(分别为 1052.01 Mbp 和 1055.19 Mbp)组成,达到染色体水平的连续性和 >98% 的 BUSCO 完整性。序列锚定在 13 条染色体上,重
三种新型蜘蛛基因组揭示了蜘蛛蛋白的多样性和 Hox 簇结构:Ryuthela nishihirai(Liphistiidae)、Uloborus plumipes(Uloboridae)和 Cheiracanthium punctorium(Cheiracanthiidae)摘要蜘蛛是一种高度多样化的分类单元,是几乎所有陆地栖息地中最丰富的捕食者之一。它们的成功通常归因于其进化过程中的关键发展,例如丝和毒液的产生以及主要的衍生性状,例如全基因组复制。解决蜘蛛生命树中的深层关系在历史上一直具有挑战性,因此很难衡量这些新奇事物对蜘蛛进化的相对重要性。全基因组数据为这些努力以及功能基因组研究提供了重
Study finds drop in soil microbes in post flood, landslide areas of Attapadi, Nelliyampathy
他们利用先进的高通量 16S rRNA 基因测序技术,研究了土壤细菌群落的多样性和组成,发现受灾地区的微生物健康状况显著下降
遗传条形码用于幽灵蜘蛛(Araneae、Anyphaenidae、Amaurobioidinae)的物种识别和系统发育评估摘要蜘蛛物种的识别面临许多挑战,因为在大多数情况下,所使用的特征来自仅在成年阶段完全发育的生殖器结构,因此通常无法识别未成熟的物种。此外,这些结构通常还存在一些种内变异性,这在某些情况下使得近亲物种的识别变得困难。基于线粒体标记细胞色素 c 氧化酶亚基 I (COI) 测序的遗传条形码技术(DNA 条形码)已被证明是一种有用的补充工具,可以克服这些限制。本研究使用精炼单链接分析 (RESL) 算法划分操作分类单元 (OTU),并与自动分割组装物种 (ASAP) 算法进行比较
适应性辐射的群体基因组学:加那利群岛特有蜘蛛的遗传多样性和重组水平极高摘要蜘蛛属 Dysdera 在加那利群岛的海洋群岛中经历了显著的多样化,自群岛起源以来的 2000 万年间,约有 60 种特有物种出现。这种进化辐射伴随着大量的饮食变化,通常以表型改变为特征,包括形态、代谢和行为变化。因此,这些特有蜘蛛是了解进化驱动因素和确定适应性辐射背后的基因组决定因素的绝佳模型。最近,我们首次对特有物种之一 D. silvatica 进行了染色体水平的基因组组装,为进化基因组学研究提供了高质量的参考序列。在这里,我们对来自拉戈梅拉岛的 D. silvatica 自然种群进行了低覆盖率重测序研究。利用新的
Privately owned tigers are suprisingly not that inbred
如果你几年前连续观看过《虎王》,你就会知道美国有大量私人饲养的老虎种群,而现在美国的研究人员通过对 138 只私人饲养的老虎进行 DNA 测序,检测了它们的遗传多样性。他们发现,所有老虎都含有来自所有六个老虎亚种的 DNA,尽管来自东北虎和孟加拉虎的 DNA 最为常见。私人饲养的老虎的遗传多样性和近亲繁殖水平与野生种群相似。研究人员还发现,这些老虎没有任何真正独特的 DNA 可以帮助该物种的生存。
Comprehensive Genomic Analysis Accelerates Cancer Research
测序进展提供了有关基因组变异如何驱动癌症发生和发展的全面见解。
Bill targeting Chinese biotechs worries U.S. researchers
《生物安全法案》可能阻碍科学合作,限制测序仪购买
CMFRI scientists decode genome of Asian green mussel ‘Kallummakkaya’
这种海洋无脊椎动物物种的染色体水平基因组测序是印度首次进行的此类测序,将对该国可持续水产养殖实践和抗病能力产生深远影响
The genes that impact when menopause occurs could also determine the risk of some cancers
据澳大利亚和国际研究人员称,与更年期提前有关的基因也可能影响各种癌症的风险。该团队对 100,000 多名绝经后女性的基因测序进行了研究,以研究特定基因及其对更年期时间的影响。他们说,他们发现了四种基因,它们对更年期时间的影响是迄今为止发现的最大的,这些基因的变化与更年期提前两到五年有关。该团队之前的研究发现,这些基因影响更年期的可能原因是它们影响卵子的遗传完整性,一些变异意味着女性的卵子在生命早期会丢失,从而引发更年期。他们说,许多与更年期提前有关的基因也是癌症的风险因素,这可能是因为其他细胞同样缺乏遗传完整性,更容易患病。