转录增强子图谱可以揭示每种细胞类型背后的核相互作用，并将特定细胞类型与疾病联系起来。 使用 5'单细胞 RNA 测序方法，我们定义了增强子 RNA 和其他类别的转录起始位点......
Bilby future enhanced with completion of first full genome map
研究人员首次对澳大利亚大兔耳袋狸的整个基因组进行了测序，他们说这将改善对濒危物种的保护工作。大兔耳袋狸 (Macrotis lagotis) 是一种原产于澳大利亚的有袋动物。由于它长着像兔子一样的长耳朵，有时被称为澳大利亚的“复活节兔子”。这种夜行杂食动物生活在 […]
Zancleopsis grandis Schuchert & Collins, 2024 DOI: 10.35929/RSZ.0113摘要这项工作是对我们之前研究 (Schuchert & Collins, 2021) 的补充，该研究是在佛罗里达附近的墨西哥湾流夜间潜水期间观察和收集的水螅水母。特写照片和收集选定的样本进行 DNA 提取和 16S 条形码测序使我们能够区分 49 种不同的形态类型或种类的水螅水母。其中 18 个是 2021 年论文中报告的新内容。49 个潜在物种中有 7 个仅被鉴定到属级别，1 个被鉴定到科级别。描述了两个新物种：Zancleopsis grandis sp.
Virus Field Research: Policy Options to Help Reduce Risks and Enhance Benefits
GAO 发现了什么病毒实地研究显示了应对疫情爆发的好处和一些预测能力。然而，确定此类研究的具体预防益处具有挑战性，部分原因是很难确定研究对预防结果的影响。专家告诉我们，为阻止疫情爆发而采取的预防措施有很多例子，部分原因是从病毒现场研究中获得的知识。病毒现场研究人员面临着各种环境、职业和传染风险同时进行病毒实地研究。此外，病毒现场样本采集受到不同程度的监管。因此，病毒联邦现场研究实践各不相同，各机构使用自己的暴露和感染报告指南。替代方法可以帮助降低病毒现场研究活动的风险，但病毒现场样本收集是诸如此类技术的必要数据来源。作为疾病模型，可以帮助预测潜在的传播和爆发。还有一些技术和方法可用于减少这些样
越冬狼蛛肠道菌群性别差异的潜在意义摘要肠道菌群可以促进宿主节肢动物对低温胁迫的抵抗力。冬季狼蛛雌性抗冻化合物水平低于雄性，抗寒能力较弱，这意味着其越冬期间肠道菌群可能存在差异。本研究主要利用16S rRNA基因测序比较了温带地区狼蛛雌雄肠道菌群。研究结果表明，雌性狼蛛肠道菌群的Chao1和Shannon指数显著高于雄性，而Simpson指数显著低于雄性。雄性肠道细菌群落以门水平的变形菌门（Proteobacteria）和放线菌门（Actinobacteriota）为特征，以属水平的假单胞菌（Pseudomonas）和红球菌（Rhodococcus）为特征，总相对丰度分别为89.58%和85.2
用于诊断疾病的 DNA 测序仪曾经占据了整个房间。将其放入手掌即可在现场进行准确诊断。当作战人员部署到面临生物战剂潜在威胁的严峻环境时，快速、及时的威胁检测对于制定适当的医疗对策以及更广泛的联合部队健康保护至关重要。国防威胁降低局 (DTRA) 化学和生物技术部作为化学和生物防御联合科学技术办公室 (JSTO)，正在与太平洋西北国家实验室 (PNNL) 共同投资一个项目，以适应便携式、商业现成的纳米孔测序技术，用于在护理点快速检测和诊断蛋白质。在 JSTO 新闻 2023 年 1 月号中了解这一新的“旅行装”快速检测技术。
DNA 测序仪曾经非常宽敞。将其放入手掌中可以改变该领域诊断的一切。DNA 测序技术的进步使人们能够前所未有地研究生物体的遗传图谱，彻底改变了现代医学，并增强了诊断能力。当作战人员部署到面临生物战剂 (BWA) 潜在威胁的严峻环境时，快速、及时的威胁检测对于制定适当的医疗对策以及更广泛的联合部队健康保护至关重要。
Pandemic Origins: Technologies and Challenges for Biological Investigations
GAO 的发现确定流行病的可能起源具有挑战性。研究人员可能会使用多种技术来调查大流行的起源。例如，研究人员使用基因组测序、生物信息学分析和遗传数据库等技术来生成、分析病原体的基因构成并将其与其他病原体的基因构成进行比较。这些技术的一个关键限制是，一些基于实验室的基因改造可能与自然变异无法区分。获取样本对于进行基因序列分析至关重要，这使得研究人员能够生成和分析支持大流行可能起源所需的数据。大流行起源调查的技术示例研究人员还使用血清学（即血液分析）和流行病学监测——跟踪疾病在人群中的传播——以监测人类和动物群体中的病原体感染和疾病发生。由此产生的数据可以支持大流行起源调查。然而，为了使这些技术有效
在最新一期的全球最优秀科学新闻中，学习一个简单的技巧来改善您的心理健康，以及机器人和人工智能如何帮助改善农业。ScienceSeeker 编辑在各自感兴趣和专业领域内最喜欢的帖子还涵盖了许多其他重要且令人兴奋的主题。为什么不阅读、了解信息并满足您的科学好奇心呢？结合 3D 打印和自组装制造世界上最轻的材料，作者：Michael Berger，Nanowerk 这种石墨烯晶格本身的密度小于空气，但不会飘走，因为它充满了空气。与氡的竞赛，作者：Chris Baraniuk，Knowable Magazine 人类基因组终于完全测序了！ Rosa García-Verdugo 撰写，Mapping
Grad School, Entrepreneurship, and VC with Dr. Vijay Pande (a16z)
6 月份，斯坦福生物技术集团邀请了 a16z 普通合伙人兼 a16z Bio Fund 创始人 Vijay Pande 博士进行炉边谈话。讨论的重点包括：在生物学和技术的交叉领域进行创新在 a16z bio 基金中形成投资论文及其自成立以来的发展数据在生物技术公司中不断演变的角色从创业、风险投资和研究生院中吸取的教训您可以在下面访问整个录音关于作者Sevahn VorperianSevahn 是 Quake 实验室的研究生，也是化学工程系的博士生。她对所有测序事物都充满热情，并利用各种测量技术来获得对人类健康和疾病的定量见解。Sevahn 获得了 NSF 研究生奖学金、Benchmark 斯坦
AlphaFold 2 Explained: A Semi-Deep Dive
上个月底，谷歌机器学习研究部门 DeepMind 创下了新纪录：准确预测蛋白质结构。DeepMind 以开发击败围棋和星际争霸 II 世界冠军的机器人而闻名。如果他们的结果像团队声称的那样好，他们的模型 AlphaFold 可能会为药物发现和基础生物学研究带来重大福音。但这种基于神经网络的新模型是如何工作的呢？在这篇文章中，我将尝试简要但半深入地介绍支持该模型的机器学习和生物学。首先，快速了解一下生物学：蛋白质在体内的功能完全由其三维结构决定。例如，臭名昭著的“刺突蛋白”可以标记冠状病毒，从而使病毒进入我们的细胞。同时，Moderna 和辉瑞等 mRNA 疫苗复制了这些刺突蛋白的形状，从而
A Measurement System for the Study of Nonlinear Propagation Through Arrays of Scatterers
摘要：测量通过散射体阵列传播的非线性声脉冲的空间和时间场存在各种实验挑战。探头干扰和不良高频响应困扰着声学麦克风的典型方法，这些方法也仅限于解析单个位置的压力场。使用光学方法进行的测量没有这样的缺点，并且纹影测量特别适合测量散射体阵列中非线性脉冲传播的空间和时间演化。本文描述了一种基于 z 型纹影装置的测量系统，该系统适用于测量轴对称现象和可视化弱冲击传播。为了降低方向性并启动近球对称传播，激光诱导击穿充当非线性脉冲源。纹影系统的一个关键组件是标准纹影，它可以进行定量纹影测量。通过前向阿贝尔变换，从非线性脉冲生成预期光折射的估计值，从而帮助确定标准纹影的尺寸。最后，指定了实验测序、图像捕获和旨
Алгоритмы машинного обучения прогнозируют опасные мутации в клетках
DNA 测序或建立核苷酸序列的技术为医学开辟了新的机遇 - 现在，对 DNA 片段或蛋白质中的氨基酸序列的分析可用于诊断和治疗。即使DNA看似微小的变化也可能是严重疾病的征兆。
为了庆祝国际家庭日，我们特邀 Dr.玛丽-克莱尔·金 (Mary-Claire Kings) 开创性地开发了线粒体 DNA 测序技术来识别生物联系，这使得 20 世纪 70 年代中期和 80 年代阿根廷离散的 100 多个家庭得以团聚。
雷汉·萨拉姆（Reihan Salam）发表了一篇有趣的职位，记载了拉齐布·汗（Razib Khan）的保证，他承诺与他的完整基因组公开（雷汉（Reihan）也承诺），以帮助解决集体行动问题，即没有很多基因组公开。汗说：我希望最晚能在几年内对完整的基因组进行测序。发生这种情况时，我将尝试[…]基因组后承诺首先出现在附带经济学家上。
