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多毒素:多类蛋白质毒素分类的基于序列的堆叠集合模型

MultiTox: A sequence-based stacked ensemble model for multiclass protein toxin classification

多毒素:一种基于序列的堆叠集合模型,用于多类蛋白毒素分类,以示意毒素蛋白的结构和功能多样性对于阐明大分子分子行为,机械变异性和结构驱动的生物活性至关重要。传统方法主要集中于二进制毒性预测,从而有限地解决了不同的毒素作用模式。在这里,我们提出了基于分子的作用模式:神经毒素,细胞毒素,血状毒素和肠毒素的分类的多毒素,用于分类毒素蛋白的合奏堆叠框架。我们策划了24,756种蛋白质(20,361毒素和4395个非毒素)的综合数据集,并提取了编码进化,结构和生物化学特征的高维ESM-2嵌入。两层堆叠框架集成了LGBM,MLP,ET,KNN和QDA作为基本分类器,XGBoost作为元分类器。 Multit

IEEE关于进化计算的交易,第29卷,第4期,2025年8月

IEEE Transactions on Evolutionary Computation, Volume 29, Issue 4, August 2025

1)遗传编程具有柔性区域检测的遗传编程,以进行细粒度的图像分类器:Qinyu Wang,Ying Bi,Ying Bi,Bing Xue,Mengjie Zhangpages:853-8642)学习扩展/签约帕累托在动态多目标优化中扩展/签约帕累托集合,并具有不断变化伯恩哈德·塞霍夫(Bernhard Sendhoff),Xin Yaopages:865-8793)在高度多模式的rastrigin功能上的多组合进化策略自动适应:Amir omeradzic,hans -Georg beyerpages:880-8904)近似noctimation nibity nibity nogition