Advancing regulatory variant effect prediction with AlphaGenome
根据 DNA 序列预测功能基因组测量结果的深度学习模型是破译遗传调控密码的强大工具。现有方法涉及输入序列长度和预测分辨率之间的权衡,从而限制了它们的模态范围和性能1,2,3,4,5。我们推出了 AlphaGenome,这是一个统一的 DNA 序列模型,它以 1 Mb 的 DNA 序列作为输入,并通过不同的模式预测数千个功能基因组轨迹,最高可达单碱基对分辨率。这些模式包括基因表达、转录起始、染色质可及性、组蛋白修饰、转录因子结合、染色质接触图、剪接位点使用以及剪接连接坐标和强度。 AlphaGenome 在人类和小鼠基因组上进行训练,在 26 项变异效应预测评估中的 25 项中匹配或超过了最强的
Call It What It Is: Texas Didn’t Order an Audit. It Ordered a Pause.
真正的考验不是德克萨斯州是否审核这些项目。它应该。考验在于国家是否利用审计来建立可预测的监管框架,或者只是创建一个开放式的拖延许可单。投资者可以进行价格调控。社区可以围绕监管进行规划。定价和计划都无法规避的就是不确定性。如果这种暂停仍然是一个没有可预测结局的过程,那么这最终就是德克萨斯州所面临的风险。这篇文章称其为:德克萨斯州没有下令进行审计。它下令暂停。首先出现在 Watts Up With That? 上。
狼蛛毒液和丝基因的性别和发育特异性转录组分析为生态适应和捕食策略提供了见解摘要蜘蛛毒液和丝腺是有助于猎物捕获、防御和繁殖的两个主要分泌系统,但它们在流浪狼蛛中的性别和发育特异性分子调控仍然知之甚少。在这里,中国重要的农业天敌黄豹蛛(Pardosa astrigera)的转录组揭示了成年雌性、成年雄性和幼蜘蛛之间与性别和发育相关的显着分子分化。共获得100,025个unigene,其中23,852个进行功能注释,为该物种提供了全面的转录组资源。差异表达模式显示各组之间存在显着差异,在 PAF 与 PAS、PAM 与 PAS 以及 PAF 与 PAM 中分别检测到 531、1792 和 832 个
Iran appoints former Revolutionary Guards chief Mohsen Rezaei as top national security official
伊朗总统马苏德·佩泽什基安任命前革命卫队指挥官穆赫森·雷扎伊为最高国家安全委员会主席,接替穆罕默德·巴格尔·佐尔加德尔。雷扎伊在两伊战争的大部分时间里领导着近卫军,此前曾担任高级政治和军事职务,并强调控制霍尔木兹海峡的战略重要性。
Scientists Discover the Brain May Enter a New Biological Phase Between 50 and 75
一项单细胞研究揭示了衰老人类海马体内免疫细胞、基因组组织和基因调控的重大变化,为大脑衰老和与年龄相关的痴呆症提供了重要见解。大约在 50 岁到 75 岁之间,人类海马体的细胞结构开始发生变化。免疫细胞发生变化,基因组的物理组织减弱,并且 [...]