Resnet 驱动的瓦山东方蜘蛛毒液腺转录组先导肽的计算机识别结合分子对接和动力学模拟摘要背景: 瓦山东方蜘蛛是一种具有相当生态和科学重要性的毒蜘蛛。其毒液成分复杂且易于采集,是发现天然肽类药物的宝贵资源。传统的湿实验室筛选方法受到实验条件严格、资源消耗高、研究周期长的限制,阻碍了对该蜘蛛毒腺转录组功能肽的高效鉴定。方法:为了解决这些技术瓶颈,本研究开发了一种名为 PepPI-DRN 的新型深度学习模型,用于肽-蛋白质相互作用预测。该模型利用肽和蛋白质的序列和结构特征,集成了残差等变图神经网络、残差一维卷积神经网络和双模态注意力机制。结果:独立测试集的结果表明,与最先进的方法相比,PepPI-
狼蛛毒液和丝基因的性别和发育特异性转录组分析为生态适应和捕食策略提供了见解摘要蜘蛛毒液和丝腺是有助于猎物捕获、防御和繁殖的两个主要分泌系统,但它们在流浪狼蛛中的性别和发育特异性分子调控仍然知之甚少。在这里,中国重要的农业天敌黄豹蛛(Pardosa astrigera)的转录组揭示了成年雌性、成年雄性和幼蜘蛛之间与性别和发育相关的显着分子分化。共获得100,025个unigene,其中23,852个进行功能注释,为该物种提供了全面的转录组资源。差异表达模式显示各组之间存在显着差异,在 PAF 与 PAS、PAM 与 PAS 以及 PAF 与 PAM 中分别检测到 531、1792 和 832 个
DNA polymerization activates RNA cleavage of a reverse transcriptase–like antiviral enzyme | Science
防御相关逆转录酶 (DRT) 转录非编码 RNA (ncRNA) 来进行抗病毒防御,但不依赖 ncRNA 的 DRT 的机制仍不清楚。在这项工作中,我们证明单个 DRT4 通过...介导 RNA 靶向反噬菌体防御。
分离的毒蛇(Bitis arietans)毒液丝氨酸蛋白酶的结构和功能表征摘要已知丝氨酸蛋白酶(SVSP)在毒蛇毒液的血液毒性作用中发挥重要作用,但与其他医学上重要的毒蛇相比,毒蛇毒液的丝氨酸蛋白酶尚未得到广泛表征。为了解决这个问题,我们分离、鉴定和表征了尼日利亚粉蝰蛇毒液中丝氨酸蛋白酶的生物活性,我们之前已经证明这种毒蛇的毒素含量特别丰富。鉴定出两个不同的组,每个组具有不同的蛋白质底物特异性。两者的分子量相似,均为 52-62 kDa,具有 4-6 个 N-聚糖,但一组由胰蛋白酶样酸性 SVSP 组成,另一组由非胰蛋白酶样碱性 SVSP 组成,对 P1 位的脂肪族氨基酸具有特异性。每种对纤维
Sahathippayakul、Supapongsri、Kuncharoen、Suwannarach et Lueangjaroenkit,2026 年的 Clonostachys kasetsartana。DOI:doi.org/10.1099/ijsem.0.007273AbstractTwo 真菌分离株,DMKU-RG2M15ᵀ 和DMKU-RG2P11 是从红树林 Ceriops tagal (Perr.) C.B. Rob.(采集于泰国尖竹汶府)健康叶子的叶面中分离出来的。使用基于形态学、生理学和多位点系统发育分析的多相方法研究了它们的分类位置。菌落产生具有轮生分枝的初级分生孢
Noisy Text in RAG: Typos, OCR, and the Gap Classical Spell-Check Leaves
企业文档智能 [Vol.1 #B1] - 一个问题的三个根源。用户打字错误、快速打字转录噪音、OCR 字符错误。经典的拼写检查可以处理其中之一。嵌入带来其余的 RAG 中的嘈杂文本:打字错误、OCR 和 Gap 经典拼写检查叶子首先出现在《走向数据科学》上。
Scorpion Venom Peptides: Novel Therapeutic Approaches for Inflammatory and Hepatic Disorders
蝎毒肽:炎症和肝脏疾病的新型治疗方法摘要慢性肝脏疾病,例如代谢功能障碍相关的脂肪性肝炎 (MASH)、酒精相关性肝病 (ALD) 和病毒性肝炎(乙型肝炎病毒 [HBV]/丙型肝炎病毒 [HCV]),主要是由持续性免疫介导的炎症和肝星细胞激活驱动的,导致纤维化,但传统疗法缺乏组织和分子特异性。通过进化选择精制而成的蝎毒肽提供了高效的、能够调节肝内炎症网络的靶向特异性支架。最近的体内临床前研究表明,电压门控钾 (Kv1.3) 通道阻断肽(例如 BmKK2)可显着减少巨噬细胞活化并抑制下游细胞因子的产生,从而有效改善小鼠模型中饮食诱导的脂肪性肝炎和组织疤痕。工程化的亲肝候选药物,如 Smp76 和
Bungarus multicinctus venom induces pyroptosis via the NLRP3/Caspase-1/GSDMD pathway in BV2 cells
作者:Yung-Lun Lin - https://www.inaturalist.org/photos/339509447,CC BY 4.0,https://commons.wikimedia.org/w/index.php?curid=181835911Bungarus multicinctus 毒液通过 BV2 细胞中的 NLRP3/Caspase-1/GSDMD 途径诱导焦亡是一种与炎症相关的促炎性程序性细胞死亡。虽然动物毒液可以引发细胞焦亡,但神经毒性蛇金环蛇 (BM) 的毒液是否可以诱导小胶质细胞焦亡仍不清楚。本研究旨在研究小鼠 BV2 小胶质细胞的这一过程。我们将细胞暴露于骨髓
X-chromosome inactivation draws L1 mutagenesis to the human X chromosome | Science
X 染色体失活 (XCI) 能够在 XX 真兽类中实现基因剂量补偿。长散布元件 1(LINE-1 或 L1)反转录转座子在人类 X 染色体上异常丰富,并被假设可促进 XCI。在这里,我们使用了 long-...
Venomous Lepidoptera: defensive toxin systems, venom composition, and clinical significance
有毒鳞翅目:防御性毒素系统、毒液成分和临床意义摘要有毒鳞翅目是一类未被充分认识但具有医学意义的产毒节肢动物,它们通过专门的外皮结构(如刚毛、刺和脊柱)采用接触介导的防御性螫入。与主动蜇人的节肢动物不同,这些昆虫在接触时被动地释放毒液,引起多种临床表现,统称为鳞翅目害虫病。临床结果范围从局部疼痛和皮炎到严重的全身反应,包括出血综合征、补体激活和慢性炎症性疾病。蛋白质组学和转录组学技术的最新进展改变了我们对鳞翅目毒液的理解,揭示了意想不到的复杂毒素库,包括丝氨酸蛋白酶、磷脂酶、成孔蛋白、富含二硫键的肽、神经活性 RF-酰胺肽和免疫调节成分。这些发现为毒性的分子基础、宿主与病原体的相互作用以及鳞翅目