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花青素 - 具有多种生物活性的饮食天然产物，用于促进人类和动物健康
花色苷是许多食用植物中包含的水溶性色素。这项研究提供了关于花青素的总体定量文献分析。文献计量数据，该数据产生了44,121个出版物在科学核心收藏中的索引。使用VosViewer软件生成了术语地图，以可视化常见的术语以及其引文数据。自2000年代以来，文献一直在迅速增长，主要由原始文章组成，与评论相比，其比例为13.8：1。最有生产力的作者是波尔图大学的Victor de Freitas教授，而生产力最高的国家是中国和美国。许多出版物发表在食品科学技术和植物科学期刊上。经常提到的化学药品/化学类别包括花青素，类黄酮，氰化素，酚类化合物和多酚。花青素纸的重复食品是葡萄，许多浆果和特定的大米，玉米，土豆和番茄。
基于天然产物的糖酵解抑制剂作为表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂耐药非小细胞肺癌的治疗策略
1 釜山国立大学韩医学院韩医科学系，韩国梁山 50612，韩国；jinling0122@pusan.ac.kr 2 釜山国立大学韩国健康老龄化医学研究中心，韩国梁山 50612，韩国；yanges@pusan.ac.kr（E.-SY）；chunsay1008@pusan.ac.kr（S.-YC） 3 韩国东方医学研究所韩医应用中心，韩国大邱 41062，韩国；hanjh1013@kiom.re.kr 4 成均馆大学医学院分子细胞生物学系，韩国水原 16419，韩国；weishibo8186@163.com 5 高新大学医学院分子生物学和免疫学系，韩国釜山 49267， dr.baesj@kosin.ac.kr 6 光州科学技术学院生物医学科学与工程系，光州 61005，韩国；dryu@gist.ac.kr * 通信地址：hschung@kiom.re.kr (H.-SC)；hagis@pusan.ac.kr (K.-TH) † 这些作者对这项工作做出了同等贡献。
NMR光谱窗口对SARS-COV-2感染对循环细胞因子的血浆脂蛋白和代谢产物的系统性影响
摘要：为了研究SARS-COV-2感染的全身代谢效应，我们分析了人类血浆中的1 H NMR光谱数据，并与多个血浆细胞因子和趋化因子和趋化因子和趋化因子（并行测量）共同建模。因此，在从SARS-COV-2 RRT-PCR阳性患者（n = 15，具有多个样本时间点）和年龄相匹配的健康对照（N = 34的CORMED-CCR）中，在SARS-COV-2 RRT-PCR阳性患者（n = 15，n = 15，n = 15）中记录的血浆中收集了600 MHz 1 h溶剂抑制的单脉冲，自旋回波和2D J分解光谱。测试了SARS-COV-2阴性的Uenza样临床症状（n = 35）。我们将单脉冲NMR光谱数据与体外诊断研究（IVDR）的信息进行了比较，以了解从原始1D NMR数据中提取的定量脂蛋白促蛋白（112个参数）。所有NMR方法都对使用单个NMR方法的对照组和SARS-COV-2阴性患者对SARS-COV-2阳性患者进行了高度显着歧视，从而给出了有关疾病诱导的现场版本的不同诊断信息。选定患者的纵向轨迹分析表明，在恢复阶段没有可检测的病毒的个体中，代谢恢复是不完整的。我们观察到四个血浆细胞因子簇，它们表达了与多种脂蛋白和代谢产物的复杂统计关系。IL-18，IL-6和IFN-γ与IP-10一起，RANTES与LDL1-4亚构件表现出很强的正相关性，并且与多个HDL亚段的负相关性。包括以下内容：群集1，包括MIP-1β，SDF-1α，IL-22和IL-1α，与多个增加的LDL和VLDL亚隔离相关；群集2，包括IL-10和IL-17A，仅与脂蛋白蛋白相关。群集3，包括IL-8和MCP-1，与多种脂蛋白成反比。总体而言，这些数据表明了与SARS COV-2感染的多级细胞免疫反应与血浆脂蛋白相互作用的多级免疫反应，从而使疾病的强烈和特征性免疫代谢表型相互作用。我们观察到，呼吸道恢复阶段和无测试病毒的一些患者在代谢上仍然是高度异常的，这表明这些技术在评估全身恢复中的新作用。关键字：血浆，Covid-19，Sars-Cov-2，NMR光谱，单脉冲，自旋回波，IVDR，代谢表型，生物标志物，诊断模型，脂蛋白■简介
利用复杂生物基质中的药物，代谢产物和内源激素的低水平检测的灵敏度提高
在本技术说明中，Sciex 7500系统上的技术创新被利用以提高许多具有挑战性的法医工作流程的灵敏度和总体量化性能。通过比较Sciex 7500系统和上一代仪器QTRAP 6500+系统上观察到的信号来研究这些灵敏度增长的影响。结果显示了检测下限（LLOD）和定量（LLOQ）的改进，这些限制提供了常规，鲁棒检测从具有挑战性的生物矩阵中提取的超低分析物的能力。这种提高的灵敏度还可以使较小的样品和注射体积可显着最大程度地减少矩阵干扰，因此提供了更一致的电离。结果还表明，可以利用增加的灵敏度来简化样本准备程序，从而提高了常规分析的生产率。能够分析这些化合物而无需艰苦且耗时的样本准备程序，提高了整体运营效率和吞吐量，从而使法医测试实验室能够超过其当前的生产率水平。
通过优化基因组规模上的途径定位和适应性高效合成植物天然产物的微生物细胞工厂
植物天然产物（PNP）具有重要的药理活性，广泛应用于化妆品、保健品和食品添加剂等。目前，大多数PNP主要从栽培植物中提取，产量受到生长周期长、气候变化和加工步骤复杂的限制，使该过程不可持续。然而，PNP的复杂结构显著降低了化学合成的效率。随着代谢工程和合成生物学的发展，在微生物细胞工厂中异源生物合成PNP提供了一种有吸引力的替代方案。基于对基因组和转录组数据的深入挖掘和分析，许多天然产物的生物合成途径已被成功阐明，为异源生产奠定了重要基础。然而，PNP的微生物合成存在中间体的毒性、酶活性低、多重营养缺陷依赖性和不可控的代谢网络等问题。尽管已经开发出各种代谢工程策略来解决这些问题，但在全基因组范围内优化途径的定位和适应性是微生物中的重要策略。从这个角度出发，本综述介绍了CRISPR/Cas9在模式微生物中编辑PNPs生物合成途径的应用，途径定位的影响，以及优化代谢途径和底盘宿主之间的适应性以促进PNPs生物合成的方法。
洞悉用于新型分子发现的光合微生物的共培养和增强的专业代谢产物
摘要：该研究的目的是研究碳水化合物代谢疾病和胰岛素抵抗指数对冠状动脉搭桥术（CABG）的直接结果的影响。方法。Patients with coronary artery disease who underwent CABG ( n = 383) were examined to determine glycemic status, free fatty acid and fasting insulin levels, and insulin resistance indices (Homeostasis Model Assessment of Insulin Resistance (HOMA-IR), McAuley index, Quantitative Insulin Sensitivity Check Index (QUICKI), Revised-QUICKI).患者的围手术期并发症的发育及其在医院的住院时间。组成了两组：第1组，终点合并的患者（CEP，任何并发症和/或住院时间> 10天），n = 291；第2组（n = 92）没有CEP。围手术期特征是分类的，并评估了医院并发症和长时间住院时间的预测因子。结果。CEP组的患者年龄较大，其中女性中有更多的女性（p = 0.003）。在这一组中，有更多的糖尿病患者（37.5％vs 17.4％，p <0.001），肥胖症（p <0.001）和较高的合并手术百分比（p = 0.007）。在具有CEP的组中，葡萄糖的水平（P = 0.031），糖化血红蛋白（P = 0.009）和游离脂肪酸（P = 0.007）和经过修订的Quicki（p = 0.020）的水平高于没有复杂性的组的组。复合终点的预测因子包括女性，年龄，左心房大小和游离脂肪酸水平（p <0.001）。在重新分析中，并发症的独立预测因素是合并操作（p = 0.016），长期住院时间（> 14天）的预测因素是女性，左心房大小和糖尿病（p <0.001）。结论：在CABG之后患有院内并发症的组中，糖尿病的存在不仅频繁地检测到糖尿病，而且更高水平的游离脂肪酸和更高的修订后的Quicki。因此，建议在CABG之前患者对胰岛素抵抗和游离脂肪酸水平的其他评估。
使用共培养策略探索来自海洋微生物的多种生物活性二级代谢产物
摘要：越来越多的二级代谢产物的隔离和鉴定具有独特的骨骼，并具有来自海洋微生物的多种生物活性，从而赢得了许多天然产物化学家的利益。越来越强调如何培养微生物以增强代谢物的化学多样性并避免重新发现已知的化学物质。鉴于次生代谢产物作为微生物之间的交流方式的重要性，已经引入了微生物共培养。通过模仿自然栖息地中微生物群落的生长模式，预计共培养策略可以刺激在传统的实验室培养条件下保持休眠状态的生物合成基因簇，从而诱导新的二级代谢产物的产生。与以前的评论不同，主要关注发酵条件或来自海洋衍生的共同生产菌株的代谢物多样性，涵盖了从20122年到2022年的海洋来源的共培养微生物，并转向特定的讨论，突出了针对海洋衍生的微生物的选择，尤其是在选择的途径，尤其是在海上衍生的疾病。为了方便而快速检测新型代谢物，因为这些代谢物在共培养中很重要。最后，还讨论了分子的结构和生物活性多样性。对作者的观点的行为讨论了共同文化的挑战和前景。
高脂肪饮食与肠道微生物蛋白营养不良有关，肠道微生物衍生的代谢产物与年轻göttingenMinipigs
目的是1）表征代谢综合征的Gottingen Minipig模型，涉及其结肠微生物群和循环微生物产物，以及2）评估卵巢切除的女性和cast割的雄性少女是否显示出相似的表型。根据性别和饮食，将二十四个9周龄的gottingen Minipig分配给四组：卵巢饮食和castrated的雄性，喂食食物或高脂饮食（HFD）12周。在研究结束时，测量了身体成分和血浆生物标志物，并进行了混合饮食耐受性测试（MMT）和静脉葡萄糖耐受性测试（IVGTT）。与CHOW组相比，HFD组的体重增加，脂肪百分比，空腹血浆胰岛素和胰高血糖素的体重显着更高。胰岛素抵抗指数（HOMA-IR）的稳态模型增加，并从MMT中降低了来自MMT的IVGTT和Matsuda的胰岛素敏感性指数的葡萄糖有效性。HFD组表现出血脂异常，总，LDL-和HDL-胆固醇显着增加，HDL/非HDL胆固醇比降低。HFD Minipigs的结肠微生物群显然与精益控制（Gunifrac Distance Matrix）不同。驱动这种分离的主要细菌家族是梭状芽胞杆菌科，纤维细菌科，黄霉菌科和卟啉单核科。此外，HFD显着降低了物种丰富度。此外，HFD降低了短链脂肪酸和有益的微生物代谢物的循环水平，黄氨酸和trigonelline，同时增加了分支链氨基酸的水平。分别在肝脏和肝脂肪组织中分别差异地表达了六个和九个征用相关的基因。HFD喂养的猪伴有代谢综合征，肠道微生物营养不良以及健康肠道微生物产物的明显降低，因此与人类肥胖和胰岛素耐药性相似。
链接的基因组学测序和质谱学多模式数据集以及用于微生物应变库中的简化天然产物的模型
预印本（未通过同行评审认证）是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。此版本的版权持有人于2025年1月21日发布。 https://doi.org/10.1101/2025.01.20.633932 doi：biorxiv Preprint
短杆菌代谢产物对哈茨木霉L-赖氨酸-α-氧化酶的诱导及其分离纯化工艺的改进
摘要背景：来自哈茨木霉的 L-赖氨酸-α-氧化酶是一种很有前途的抗癌、抗真菌和抗菌剂。深入探索其物理化学性质和可能的应用方式需要足够数量的蛋白质，而这又取决于微生物生产者的良好培养技术、酶软分离和纯化以及储存技术。方法：提出了一种改进的酶分离和纯化方法。采用特定的柱吸附剂组合，并采用氯化钠梯度洗脱来提高酶的产量。测试了短杆菌属代谢产物 (MP) 以及 Ulocladium sp. 和木霉属真菌代谢物的诱导影响。酶活性测定基于在过氧化物酶反应与 L-赖氨酸-α-氧化酶反应相结合的情况下检测氧化的二甲基联苯胺。还探索了一些酶特性。结果：改进后的分离纯化工艺使酶得率达到79%左右。所有短杆菌属菌株均能有效增强L-赖氨酸-α-氧化酶活性及其伴随活性。诱导的酶似乎特异性较低但热稳定性更高。讨论了改性酶的可能应用范围。磷酸盐缓冲液（pH=5.6）似乎是长期保存酶的最佳溶液。结论：检测到短杆菌属MP对L-赖氨酸-α-氧化酶有明显的诱导作用，并改进了其分离纯化工艺。关键词：抗菌剂、抗真菌、抗肿瘤、短杆菌、L-赖氨酸氧化酶、木霉、哈茨木霉 引用本文：Smirnova I、Neborak E、Shkinev V、Larichev V、Shneyder Y、Bashkirova I 等。短杆菌属代谢产物诱导哈茨木霉 L-赖氨酸-α-氧化酶及其分离纯化技术的改进。Avicenna J Med Biotech 2025；17(1)：39-46。