精确修复DNA双链断裂(DSB)对于维持基因组完整性至关重要,因为无法修复DSB会导致细胞死亡。该细胞已经发展了DSB修复的两种主要机制:非同源最终连接(NHEJ)和同源性定向修复(HDR),其中包括单链退火(SSA)和同源重组(HR)。虽然已知某些因素(例如年龄和染色质的状态)会影响DSB修复途径的选择,但在多细胞生物中尚未阐明发育阶段,组织类型和性别的作用。通过分子分析DR-sophila melanogaster在各种胚胎发育阶段,幼虫和成人组织的影响,通过分子分析DR-白色测定法(Tide)。在维持规范(G1/S/S/G2/M)细胞周期的组织中,HR修复的比例最高,并且在两个末端分化和多倍体组织中都被抑制。为了确定性别对修复途径选择的影响,分析了男性和女性的不同组织中的修复。当分子检查含有大部分细胞的组织时,雄性和女性会占据相似的HR和NHEJ比例。然而,当使用DR-White分析的表型分析对男性和雌性前生殖细胞中DSB修复进行分析时,与雄性相比,女性的HR显着下降。这项研究描述了发育,组织特异性循环特征的影响,在某些情况下,性别对DSB修复结果的影响,强调了多细胞生物的修复的复杂性。
1 英国伦敦东伦敦大学卫生、体育与生物科学学院联合与公共卫生系,2 英国伦敦约克圣约翰大学公共卫生系,3 英国吉林汉姆梅德韦 NHS 基金会信托研究与创新系,4 卡塔尔多哈哈马德·本·哈利法大学科学与工程学院可持续发展部,5 美国弗吉尼亚州布莱克斯堡弗吉尼亚理工大学化学系,6 美国图森亚利桑那大学化学与生物化学系,7 尼日利亚伊巴丹伊巴丹大学科学学院化学系,8 美国图森亚利桑那大学系统与工业工程系,9 美国斯塔克维尔密西西比州立大学兽医学院比较生物医学科学系
在威斯康星州,亚历克斯(Alex)对紫外线辐射的影响的广泛利益得到了国家研究委员会项目的支持,导致了实验,这表明细胞可以从辐射的影响中恢复过来的可能性(1935)。这种可能性确实是一个暗示,多年后引起了包括Alex在内的研究人员,在暴露于电离辐射后发现了DNA修复的证据。这些发现是在第5卷(1975)中广泛描述的,即DNA,A和B部分修复的分子机制,由P. C. Hanawalt和R. B. Setlow编辑,在基本生命科学的一系列文章中,由Plenum Press发表,为Hollaender出版,Hollaender是一般的编辑。他写了《前锋》,并包括上述1935年的文章,给了它附加的标题“ DNA修复的早期建议”。
CRISPR/CAS技术的常见应用涉及工程基因敲击素,其中DNA序列被取代或插入特定的基因组基因座。In contrast with CRISPR-mediated indels, which result from the error-prone non-homologous end joining (NHEJ) pathway, gene knockins are often engineered via homology-directed repair (HDR), typically through the use of CRISPR reagents (Cas enzyme and guide RNA) in tandem with a DNA template that shares homology with the target site and encodes for the desired modification (Hsu et al., 2014;图1,下面)。用于HDR的模板可以是双链DNA(DSDNA,线性或质粒)或单链DNA(SSDNA),并且最近的发现表明,修复机制取决于使用的模板类型而变化。 dsDNA触发了一种反映减数分裂同源重组(HR)的RAD51依赖性机制,而HDR涉及ssDNA(称为单链模板修复或SSTR)是Rad51独立的,并且需要多个组件,并且需要多个组成部分的Fanconi Anemia Anemia(FA)维修路径(RICHARDARDSON ERATHEWAY(RICHARDARSEN)等。
人工智能在理解生物视觉方面的前景依赖于将计算模型与大脑数据进行比较,从而捕捉视觉信息处理的功能原理。深度神经网络 (DNN) 已成功匹配大脑前馈视觉通路延伸至腹侧颞叶皮层过程中发生的分层处理转换。然而,我们仍有待了解 DNN 是否能够成功描述早期视觉皮层中的反馈过程。在这里,我们研究了人类早期视觉皮层与具有编码器/解码器架构的 DNN 之间的相似性,以无监督方式训练以填充遮挡并重建未见过的图像。使用表征相似性分析 (RSA),我们比较了人类参与者在观看部分遮挡图像时未受刺激的早期视觉皮层斑块的 3T fMRI 数据与来自相同图像的不同 DNN 层激活。结果表明,我们的网络在与 fMRI 数据的相似性方面优于经典监督网络 (VGG16),这意味着改进的视觉神经网络模型需要结合捕捉皮层反馈处理的架构。我们还发现,与编码器激活相比,DNN 解码器通路激活与大脑处理更相似,这表明早期视觉皮层中存在中级和低级/中级特征的整合。挑战 AI 模型和人脑解决同一项任务提供了一种将 DNN 与大脑数据进行比较的宝贵方法,并有助于限制我们对信息处理的理解,例如神经元预测编码。
摘要:近年来,由于其治疗潜力和多功能性在药物化学中,有机苯苯甲酸盐引起了很大的关注。在这里,我们报告了5-苯基碳酰甲基戊烯基硒酸(SELSA-2)抑制的机制,这是特征良好的组蛋白脱乙酰基酶抑制剂suberoylanilide suberoylanilide hydroxamic的类似物(Sahavorinostat)。我们表明,组蛋白脱乙酰基酶6和10可以促进硒氰酸酯水解产生硒酸盐阴离子,并且我们通过可逆形成二苯胺来调节抑制活性,探索硒的氧化还原化学。组蛋白脱乙酰基酶6的2.15Å分辨率晶体结构与SELSA-2结合结构,最终证明它不是硒氰酸酯,而是硒酸盐阴离子,这是负责酶抑制的活性药理。
背景和目标:红树林的主要功能是沉积物中的碳固执。这项研究旨在确定各种红树林和环境参数中沉积物中碳含量的差异。方法:这项研究是在佩萨瓦兰(Pesawaran)作为天然红树林进行的,在南坎普(South Lampung)作为印度尼西亚修复的红树林进行。目的抽样方法。使用直径为47.46千米的聚氯乙烯管和高度为30厘米的聚氯乙烯管进行沉积物采样。 所测得的沉积物参数是块状密度,碳储量和固存。 测量的环境参数包括沉积物纹理,氢的潜力,温度,盐度和总溶解固体。 使用主成分分析进行了统计分析,以确定有机碳库存与环境参数之间的关系。 的发现:研究结果表明,天然红树林(Pesawaran)的有机碳值比修复的红树林(South Lampung)的有机碳值高2.2±0.32%,为0.9±0.25%。 主成分分析结果表明,有机碳,二氧化碳当量,碳储备和碳固换具有正相关特性受盐度,淤泥和粘土影响,而负相关特性则受温度,总溶解固体和沙子的影响。 沉积物质地的分布倾向于在修复的红树林中显示出更多的淤泥,而天然红树林往往在沙子和淤泥之间具有相同的成分。沉积物采样。所测得的沉积物参数是块状密度,碳储量和固存。测量的环境参数包括沉积物纹理,氢的潜力,温度,盐度和总溶解固体。使用主成分分析进行了统计分析,以确定有机碳库存与环境参数之间的关系。的发现:研究结果表明,天然红树林(Pesawaran)的有机碳值比修复的红树林(South Lampung)的有机碳值高2.2±0.32%,为0.9±0.25%。主成分分析结果表明,有机碳,二氧化碳当量,碳储备和碳固换具有正相关特性受盐度,淤泥和粘土影响,而负相关特性则受温度,总溶解固体和沙子的影响。沉积物质地的分布倾向于在修复的红树林中显示出更多的淤泥,而天然红树林往往在沙子和淤泥之间具有相同的成分。自然和修复的红树林中氢条件的潜力没有明显的值差异。佩萨瓦兰的盐度被归类为天然红树林,由于潮汐的影响,直接面对海岸线。与此同时,在南坎普(South Lampung)被归类为已修复的红树林,由于较长的干旱季节,盐度较低,而运河无法支撑进入红树林的水。结论:研究地点的有机碳含量受到根茎型叶片的年龄较大的影响,而根瘤菌粘膜粘膜和ceriop thakal类型的红树林的影响。自然红树林的碳固相值值为1.65–3.14,而修复的红树林的碳固化速率值则显示为0.29–1.25,因此,自然红树林中的速率比康复的成熟楼层高(2-3倍)。