1 1表遗传学和细胞命运中心,CNRS /PARISITéParisCité,巴黎,法国2 Arthur和Sonia Labatt脑肿瘤研究中心,病假儿童医院,多伦多,多伦多,加拿大,加拿大玛格丽特癌症中心,玛格丽特癌症中心,大学健康网络,大学街101号,多伦多,多伦多,M5G1L7,M5G1L7 INSERM,CHU LILLE,U1192 -PROTéomiqueréponseinfymatoirespectrométrieDeMasse- Prism- Prism- F -59000法国Lille,法国6生物科学系,纽约大学,纽约,纽约,10027,10027 York, NY 10032, USA 9 CNRS UMR9019 Genome Integrity and Cancers, Université Paris-Saclay, Gustave Roussy Institute, Villejuif, France 10 Department of Medical Oncology, Dana-Farber Cancer Institute, Boston, USA 11 Protein Analysis Unit, BioMedical Center, Faculty of Medicine, Ludwig-Maximilians-University, Martinsried, Germany 12 Department of美国波士顿的小儿肿瘤学,达纳 - 法伯波士顿儿童癌和血液疾病中心1表遗传学和细胞命运中心,CNRS /PARISITéParisCité,巴黎,法国2 Arthur和Sonia Labatt脑肿瘤研究中心,病假儿童医院,多伦多,多伦多,加拿大,加拿大玛格丽特癌症中心,玛格丽特癌症中心,大学健康网络,大学街101号,多伦多,多伦多,M5G1L7,M5G1L7 INSERM,CHU LILLE,U1192 -PROTéomiqueréponseinfymatoirespectrométrieDeMasse- Prism- Prism- F -59000法国Lille,法国6生物科学系,纽约大学,纽约,纽约,10027,10027 York, NY 10032, USA 9 CNRS UMR9019 Genome Integrity and Cancers, Université Paris-Saclay, Gustave Roussy Institute, Villejuif, France 10 Department of Medical Oncology, Dana-Farber Cancer Institute, Boston, USA 11 Protein Analysis Unit, BioMedical Center, Faculty of Medicine, Ludwig-Maximilians-University, Martinsried, Germany 12 Department of美国波士顿的小儿肿瘤学,达纳 - 法伯波士顿儿童癌和血液疾病中心
水星(HG)污染是全球问题,因为全球HG的毒性高和广泛的分散。由于人为活动还是自然过程,HG排放量正在稳步增加,在某些地区,水平很高,直接威胁到人类和生态系统健康。然而,细菌和真菌已经响应HG诱导的应激而发展和适应,并开发了耐受性机制,尤其是基于Mer Operon系统,该系统通过HG摄取和通过HG减少反应涉及的MER操纵子系统。其他过程,例如生物蓄积或细胞外隔离,参与HG耐药性,污染土壤的研究允许隔离许多能够具有这些机制的微生物,具有强大的生物治疗方法的潜力。除了在确定生物地球化学周期中汞的命运方面发挥重要作用外,这些微生物确实可以用于降低HG浓度或至少稳定HG以修复受污染的土壤。此外,由于生物技术工具的开发,基于易汞的微生物的生物修复可以优化。最后,这些微生物是生物监测器的相关候选者,例如通过生物传感器的工程化,因为对汞的检测是维护生物健康的主要问题。
CRISPR/Cas9 产生的双链断裂的致突变结果取决于切割两侧的序列和细胞 DNA 损伤修复。这些特征之间的相互作用在很大程度上尚未得到探索,这限制了我们理解和操纵结果的能力。在这里,我们测量了 18 个修复基因的缺失如何改变小鼠胚胎干细胞中 2,838 个合成靶序列中 Cas9 双链断裂产生的 83,680 个独特突变结果的频率。这项大规模调查使我们能够以无偏见的方式对结果进行分类,从而产生有关双链断裂修复新模式的假设。我们的数据表明,Prkdc(DNA-PKcs 蛋白)和 Polm(Polμ)在创建与 Cas9 切口近端核苷酸(相对于原间隔区相邻基序 (PAM))相匹配的 1bp 插入方面发挥着特殊作用,Nbn(NBN)和 Polq(Polθ)在创建不同的删除结果方面发挥着不同的作用,并且存在一类独特的单向删除结果,这些结果既依赖于末端保护基因 Xrcc5(Ku80),也依赖于切除基因 Nbn(NBN)。我们利用修复环境中可重复变异的知识,建立了 Cas9 断裂诱变结果的预测模型,该模型优于当前标准。这项工作提高了我们对 DNA 修复基因功能的理解,并为更精确地调节 CRISPR/Cas9 产生的突变提供了途径。
本文旨在评估一种自热测试方法,用于表征单道厚度增材制造试件的疲劳性能。它还评估了微观结构取向相对于载荷方向对耗散行为和微裂纹起始的影响。所研究的 316L 不锈钢试件采用定向能量沉积技术制造,有两种配置:(i) 完全打印试件(2 个取向)和 (ii) 修复试件。本文首先介绍形态学和晶体学纹理分析,其次介绍一系列循环载荷下的自热测试。微观结构分析显示,晶粒伸长,其尺寸、形状和优选取向由工艺参数控制。循环拉伸载荷下的自热测量证明,可以通过红外测量对小规模、薄试件进行耗散估算。自热曲线可以成功地用 Munier 模型表示。此外,可以建立打印参数和自热结果之间的几种联系。例如,连续沉积层之间的垂直增量越小,平均
1。中国100038的北京医科大学北京Shijitan医院通用外科系。 2。 中国100080北京北京大学海德大学北京海德医院胸外科医院胸腔手术系。 3。 中国100038北京北京希吉丹医院胸外科。 4。 中国北京第三北京大学第三医院通用外科系。 5。 中国医学科学院和北京北京北京的北京北京大学北京北京北京医学院医学院通用外科系,中国。 6。 中国北京北京Liangxiang医院内分泌学系,北京,102401,中国。 7。 北京Shijitan医院科学技术系,首都医科大学,北京,中国100038。中国100038的北京医科大学北京Shijitan医院通用外科系。2。中国100080北京北京大学海德大学北京海德医院胸外科医院胸腔手术系。3。中国100038北京北京希吉丹医院胸外科。4。中国北京第三北京大学第三医院通用外科系。 5。 中国医学科学院和北京北京北京的北京北京大学北京北京北京医学院医学院通用外科系,中国。 6。 中国北京北京Liangxiang医院内分泌学系,北京,102401,中国。 7。 北京Shijitan医院科学技术系,首都医科大学,北京,中国100038。中国北京第三北京大学第三医院通用外科系。5。中国医学科学院和北京北京北京的北京北京大学北京北京北京医学院医学院通用外科系,中国。6。中国北京北京Liangxiang医院内分泌学系,北京,102401,中国。 7。 北京Shijitan医院科学技术系,首都医科大学,北京,中国100038。中国北京北京Liangxiang医院内分泌学系,北京,102401,中国。7。北京Shijitan医院科学技术系,首都医科大学,北京,中国100038。北京Shijitan医院科学技术系,首都医科大学,北京,中国100038。
在一个例子中,科学家能够诱导干细胞开始形成从头到尾延伸的小鼠身体,类似于子宫内的正常胚胎发育。在另一个例子中,科学家能够刺激干细胞产生一个大的心脏状结构,该结构具有中央腔和规律的跳动,以及早期血管网络。
“我们正在申请专利的支架使用起来非常简单;它可以像乐高积木一样堆叠在一起,并以数千种不同的配置放置,以适应几乎任何情况的复杂性和规模,”领导该技术开发、俄勒冈健康与科学大学牙科学院副教授和俄勒冈健康与科学大学医学院生物医学工程副教授 Luiz Bertassoni 博士说道。
。CC-BY 4.0 国际许可(未经同行评审认证)是作者/资助者,他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。它是此预印本的版权持有者此版本于 2020 年 2 月 24 日发布。;https://doi.org/10.1101/2020.02.24.962423 doi:bioRxiv 预印本
摘要避免由损伤引起的测序错误是准确识别 DNA 样本中中到稀有频率突变的关键步骤。在 FFPE 样本中,胞嘧啶部分的脱氨作用代表了导致 DNA 材料丢失和测序错误的重大损伤。在这项研究中,我们证明,虽然胞嘧啶和甲基化胞嘧啶部分的脱氨作用造成的损伤会导致 C 到 T 的转换升高,但错误概况和调解策略是不同的并且容易区分。虽然胞嘧啶脱氨引起的损伤诱导测序错误是由 NGS 工作流程中常用的末端修复步骤驱动的,但甲基化胞嘧啶脱氨引起的 DNA 损伤是 CpG 位点测序错误的另一个主要因素。尿嘧啶 DNA 糖基化酶和人胸腺嘧啶 DNA 糖基化酶可以分别消除和减轻 FFPE DNA 样本中的两种损伤,从而显著提高中等等位基因频率变异鉴定的测序准确性。
