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转座元件的压抑增强了干扰素beta信号传导和
图1：与光子相比，质子辐射的类器官显示出更高的自我更新能力和IFN-β响应。（a）自我更新测定法的示意图。在第5天进行辐照，并在第18天的自我更新后计算了按器官形成效率（Ofe％）的定量。（b）自我更新后培养中器官的代表性图像。比例尺，100 µm。（c）相对于对照样品的折叠变化（FC）所示的器官定量。n = 9动物/病情。（d）大量RNA-Seq分析的示意图。RNA。（e）前10名重要（p.adj。<0.05）在辐照后2和6天，质子与控制和光子对照中的生物过程。（f）显着（p <0.05）ISG的基因表达水平从辐照后6天的类器官的大量RNA-seq数据推断出来。数据相对于对照样品显示为log 2 FC。（g）辐照后6天对ISG的RT-QPCR分析。数据相对于对照样品显示为FC。n = 4个动物/状况。（h）辐照后6天后对类器官的STAT1，PSTAT1和GAPDH的Western印迹分析。（i）STAT1的蛋白质印迹定量（图1i和S2e）。STAT1蛋白水平的GAPDH标准化。 数据相对于对照样品显示为FC。 n = 6只动物/状况。 数据是平均值±s.e.m。 学生的T检验和双向ANOVA。 *p <0.05，** p <0.01。STAT1蛋白水平的GAPDH标准化。数据相对于对照样品显示为FC。n = 6只动物/状况。数据是平均值±s.e.m。学生的T检验和双向ANOVA。*p <0.05，** p <0.01。另请参见图S1和S2。
DNA扩散：利用生成模型来控制染色质的可及性和通过合成调节元件的基因表达
序列为热编码格式，并引入固定量的标准正常噪声。训练有素的U-NET使用预期噪声水平（由时间步骤确定）和单元格类型信息来预测和删除添加的噪声。在整个序列数据集的训练过程中，都重复使用这种噪声预测过程，并具有不同的噪声强度。一旦受过训练，U-NET就可以预测原始DHS内源序列中添加的初始噪声，从而能够生成针对不同细胞类型的新序列。e）要产生一个给定细胞类型标签的新序列，生成了带有随机高斯噪声的热编码的DNA矩阵，U-NET迭代在50个步骤上逐渐融合了该矩阵，逐渐收敛到反映目标细胞类型的特征性的序列。f）用于评估DNA扩散和内源性DHS区域的可及性，调节活性和基序组成的可及性，调节活性和基序组成。g）为基于细胞类型的信号特异性，强度或基序组成选择和解释生成的序列而开发的框架。
ogt防止DNA脱甲基化并抑制1个异染色质中可转座元件的表达，通过限制TET活性全基因组2
O- GlcNAC转移酶OGT与所有三种哺乳动物TET甲基二偶联酶都与所有三种哺乳动物Tet甲基二加氧酶进行牢固相互作用。我们20在这里表明，小鼠胚胎干细胞中的OGT基因（MESC）的缺失导致21种tet产物5-羟基甲基胞嘧啶（5HMC）在构体和杂色和异杂体中均具有22个同时降低Tet suisptrate 5-mettrate sistratrate 5-ettratrate contratation（5-hmc）。MESC设计了23，以消除TET1-OGT相互作用，同样显示出全基因组的降低5MC。DNA在24个OGT缺陷型细胞中的甲基化伴随着可转移元件（TES）的抑制，主要位于25个异染色质中，TE表达的这种增加有时会伴随着增加的26个基因和外显子的CIS表达增加。因此，TET-OGT相互作用通过限制跨TET活性基因组来阻止异染色质中DNA脱甲基化和27 TE表达。我们建议OGT保护28个基因组免受DNA降压降低和异染色质完整性的损害，从而防止在癌症，自身免疫性疾病，细胞衰老和衰老中观察到的TE 29表达的异常增加。30
风隧道表征的石墨烯增强pedot：飞机冰检测系统的PSS传感元件
摘要：本研究详细介绍了基于石墨烯的冰探测系统的开发和验证，旨在通过监视飞机表面上的冰的积累来增强飞行安全性。该系统使用石墨烯电极采用半导体聚合物（PEDOT：PSS），解释电阻变化以实时检测水撞击和冰的形成。在各种温度和气流条件下，在风洞中对传感器的性能进行了严格的测试，重点是电阻信号依赖于空气温度和相位变化。结果证明了传感器将水滴影响与冰的形成区分开的能力，其电阻信号幅度与水滴的影响之间有着显着的相关性，从而导致冰积聚。进一步的分析显示了空气温度与电阻信号振幅之间的显着关系，尤其是在有益于冰形成的较低温度下。这强调了传感器在各种大气条件下的精度。该系统的紧凑设计和准确的检测突出了其改善飞机冰监测的潜力，为通往强大可靠的冰探测系统提供了一条路径。
细菌基因组和移动元件注释管道
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证（未经同行评审证明）获得的是作者/资助者，他授予Biorxiv授予Biorxiv的许可，以永久显示预印本。这是该版本的版权持有人，该版本发布于2024年1月26日。 https://doi.org/10.1101/2024.01.25.577299 doi：Biorxiv Preprint
基于线粒体 DNA 和超保守元件的北美鹿之间的关系，以及对线粒体-核不一致的评论
（Carr 等人，1986 年）。Hopken 等人（2015 年）发现，在太平洋西北地区的一小块区域内，线粒体DNA 控制区序列将大多数（但不是全部）白尾鹿和黑尾鹿分开。基于线粒体DNA Cyt b 序列的美洲鹿属和种的系统发育无法将黑尾鹿和白尾鹿分开，它们共享几种线粒体DNA单倍型（Gutiérrez 等人，2017 年）。然而，地理采样的范围很有趣。Gutiérrez 等人（2017 年）使用的 O. hemionus 样本代表了广泛的范围，包括 8 个亚种（hemionus、crooki、sheldoni、fuliginatus、inyoensis、peninsulae、californicus、eremicus）。相比之下，Gutiérrez 等人使用的 O. virginianus 样本(2017) 代表了该范围的一小部分，其中有一个来自奇瓦瓦州的 O. v. couesi 样本，没有 O. v. clavium 样本。他们的线粒体 DNA 树将大多数黑尾鹿 (O. h.
MBD2夫妇DNA甲基化在男配子发生过程中对转座元件沉默
DNA甲基化是可转座元件（TE）沉默的重要组成部分，但是甲基化引起转录抑制的机制仍然尚不清楚1 - 5。在这里，我们研究了拟南芥甲基-CPG结合结构域（MBD）蛋白MBD1，MBD2和MBD4，并表明MBD2在男配子发生过程中起着TE抑制剂的作用。MBD2结合的染色质区域，含有高水平的CG甲基化，MBD2能够将其束缚在其启动子上时能够使FWA基因沉默。MBD2损失在成熟花粉的营养细胞中的一小部分TE上引起激活，而不会影响DNA甲基化水平，这表明MBD2介导的沉默作用严格在DNA甲基化的下游下游。TE激活在MBD5 MBD6和ADCP1突变体背景中变得更加重要，这表明MBD2与其他沉默途径相比起作用以抑制TES。总体而言，我们的研究将MBD2鉴定为甲基读取器，在男配子发生过程中，在DNA甲基化下方作用以使TES保持沉默。
含两个不同分数阶RC梯形元件的分数阶电路分析
摘要：本研究在模拟以及使用分数阶电路的实际电气元件进行实验的背景下探讨了不同分数阶的课题。在研究适当参数的电阻电容 (RC) 梯形电路的两种解决方案时，考虑了电路的不同分数阶。基于连分数展开 (CFE) 近似法设计了两个分数阶 (非整数) 元件。对 CFE 方法本身进行了修改，以允许自由选择中心脉冲。还提出了在制作单个梯形电路时，如果没有具有程序指定参数的元件，则应通过串联或并联市售元件来获得它们。最后，使用状态空间方法对这种电路进行了理论分析，并通过实验进行了验证。
基于飞秒激光直写的成像/非成像微光学元件和立体系统
现代信息技术的发展导致对具有复杂表面轮廓和纳米级表面粗糙度的微光学元件的需求巨大。因此，各种微纳加工技术被用于制造微光学元件和系统。飞秒激光直写（FsLDW）利用超快脉冲和飞秒激光的超强瞬时能量进行微纳加工。FsLDW表现出各种优异的性能，包括非线性多光子吸收、超越衍射极限的高精度加工和可加工材料的通用性，展示了其在三维（3D）微纳制造中的独特优势和潜在应用。FsLDW已在各种微光学系统的制造中展示了其价值。本研究详细介绍了FsLDW的三种典型原理、几种提高加工性能的设计考虑因素、可加工材料、成像/非成像微光学元件及其立体系统。最后，对FsLDW支持的微光学元件和立体系统的未来研究方向进行了总结和展望。
聚合物光学元件和模制玻璃光学
计划委员会：罗斯 - 霍尔曼理工学院（美国）霍斯辛·阿利萨法伊（Hossein Alisafaee）； John P. Deegan，Rochester Precision Optics，LLC（美国）；里克·菲茨帕特里克（Rick Fitzpatrick），挤满了有限责任公司（美国）； Marcel Friedrichs，Fraunhofer-InstitutfürProduktionStechnologieIPT（德国）； Ulf Geyer，Auer Lighting GmbH（德国）； Panasonic生产工程有限公司Koji Handa（美国）； Sai K. Kode，Micro-Lam，Inc。（美国）； Oscar M. Lechuga，Fresnel Technologies Inc.（美国）； Chris Morgan，Moore Nanotechnology Systems，LLC（美国）； Panasonic生产工程有限公司Tomofumi Morishita（日本）； J. David Musgraves，Musgraves Consulting（美国）；吉姆·奥尔森（Jim Olson），Syntec Optics（美国）；迈克尔·舒布（Michael P. Schaub），元（美国）； Ulrike Schulz，Fraunhofer-InstitutfürAngewandteoptik und feinmechanik iof（德国）；汉密尔顿·谢泼德三世（Hamilton Shepard III），Waymo，LLC（美国）； Jan-Helge Staasmeyer，Leica Camera AG（德国）