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生物技术在新兴生物经济中的安全生物内在设计
基因修饰的生物（GMO）已成为可持续生物经济学的组成部分，并在农业，生物能源和生物医学中有一系列应用。然而，转基因生物和相关合成生物学方法的快速发展引发了许多与环境逃生，检测以及对天然生态系统的影响有关的生物安全问题。已经部署在各种微生物宿主中，从经典的相互作用到全球基因组进行重新编码，已经部署了无数的遗传保护措施。然而，为了实现微生物作为生物经济中的生物催化平台的全部潜力，需要更深入地了解有关生物膜片约束的微生物响应能力的基本原理以及转基因生物与环境的相互作用。在此，我们回顾了评估生物内生物培养和微生物生物生物生产力的最新分析生物技术进步和策略，以及预测系统生物设计的机会，以确保可行的生物经济。
表观遗传和代谢变化的弥漫性内在蓬托马瘤
弥漫性中线神经胶质瘤（DMG），迄今被称为弥漫性内在蓬托胶质瘤（DIPG），是一种罕见且具有侵略性的脑癌形式，主要影响儿童。尽管尚不清楚DMG/DIPG的确切原因，但在编码His-Tone H3蛋白的基因中，DMG/DIPG肿瘤的很大一部分含有突变，特别是H3K27M突变。该突变降低了H3K27ME3的水平，H3K27ME3是一种组蛋白修饰，在通过表观遗传调节调节基因表达中起着至关重要的作用。突变还改变了Polycomb抑制复合物2（PRC2）的功能，从而防止了与癌症发展相关的基因的抑制。由组蛋白H3突变引起的H3K27ME3的降低伴随着H3K27AC的水平增加，H3K27AC的水平是与主动转录有关的翻译后修饰。失调明显影响基因表达，从而通过促进不受控制的细胞增殖，肿瘤生长和代谢来促进癌症的发展和进展。DMG/DIPG改变蛋氨酸和三羧酸周期的代谢，以及葡萄糖和谷氨酰胺摄取。已经对表观遗传和代谢变化在DMG/DIPG发育中的作用进行了广泛的研究，并且了解这些变化对于开发针对这些途径的疗法至关重要。目前正在进行研究以确定DMG/DIPG的新治疗靶标，这可能导致这种毁灭性疾病的有效治疗发展。
对HADV的内在免疫力是通过一种新型的表观遗传沉默复合物1
预印本（未通过同行评审认证）是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。此版本的版权持有人于2025年2月10日发布。 https://doi.org/10.1101/2025.02.10.637372 doi：Biorxiv Preprint
影响正常细胞和癌细胞微管动力学的内在和外在因素
摘要：微管 (MT) 是一种由 α 和 β 微管蛋白异二聚体组成的高度动态结构，参与细胞运动和细胞内交通，对细胞分裂至关重要。在细胞内，微管并不统一，因为它们可以由不同的微管蛋白同种型组成，这些同种型经过翻译后修饰并与不同的微管相关蛋白 (MAP) 相互作用。这些不同的内在因素影响着微管的动态。微管靶向剂 (MTA) 等外在因素也会影响微管动态。MTA 可分为两大类：微管稳定剂 (MSA) 和微管不稳定剂 (MDA)。因此，微管骨架是抗癌治疗的重要靶点。本综述讨论了决定正常细胞和癌细胞中微管动力学的因素，并描述了微管-MTA 相互作用，强调了微管蛋白异构体多样性和翻译后修饰在 MTA 反应中的重要性以及这种现象的后果，包括耐药性的发展。
功能性基因组学方法阐明了内在和获得化疗抗性的脆弱性
摘要：耐药性通常是癌症治疗导致治疗衰竭和疾病复发的不可避免的结果。固有（预先存在的）或获得的抗药性机制可以是药物特异性的，也可以适用于多种药物，从而导致多药耐药性。但是，耐药性的存在与细胞稳态的变化紧密耦合，这可能导致抗性耦合脆弱性。通过RNAi和CRISPR技术是公正的基因扰动，是在基因组量表上建立基因型与表型关系的宝贵工具。此外，它们在癌细胞系中的应用可以发现与抗药性机制相关的新漏洞。在这里，我们通过专注于第一个在线化疗及其强制性脆弱性来讨论针对性和公正的RNAi和CRISPR在发现耐药机制方面的努力，我们提出了一种措施来加速其临床翻译。
基于振荡的连接架构由内在空间组织而非认知状态或频率主导
神经振荡的功能连接（基于振荡的 FC）被认为能够在与任务相关的神经集合之间实现动态信息交换。尽管基于振荡的 FC 是相对于刺激前的基线进行经典定义的，从而导致个体连接发生快速的、依赖于情境的变化，但对分布式空间模式的研究表明，基于振荡的 FC 无处不在，即使在没有明确认知需求的情况下也会发生。因此，基于振荡的 FC 是否主要由认知状态形成还是本质上是内在的这一问题仍未得到解决。因此，我们试图通过查询 18 名术前人类患者（8 名女性）的 ECoG 记录来协调这些观察结果，以确定在六个任务状态下的五个典型频带中基于振荡的 FC 的状态依赖性。相位和振幅耦合的 FC 分析揭示了跨认知状态的高度相似、基本上状态不变（即内在）的空间成分。这种空间组织在所有频带上共享。然而，至关重要的是，每个波段还表现出时间独立的 FC 动态，能够支持频率特定的信息交换。总之，基于振荡的 FC 的空间组织在认知状态下基本稳定（即本质上主要是内在的），并在各个频带之间共享。总之，我们的发现与之前对空间不变的 FC 模式的观察结果相吻合，这些模式源自 fMRI 信号中极其缓慢和非周期性的波动。我们的观察表明，“背景”FC 应该在针对任务相关变化的基于振荡的 FC 的概念框架中得到考虑。
自动加固学习：探索开放式环境中技能获取的内在动机
收到：2024年11月18日修订：2024年12月26日接受：2025年1月13日发布：2025年1月30日摘要 - 本文介绍了自动增强学习（RL）的全面概述，强调了内在动机在技能撰写的开放式形成中的作用。我们描述了基于知识和基于能力的内在动机之间的区别，并说明了这些概念如何为能够产生和追求自定义目标的自主剂的发展提供了信息。探索了本质上动机的目标探索过程（IMGEP）的类型，重点是对多目标RL和发展机器人技术的影响。自动学习问题是在无奖励的马尔可夫决策过程（MDP）中构建的，在该过程中，代理必须自主代表，产生和掌握自己的目标。我们应对评估此类代理的独特挑战，提出各种指标，以衡量复杂环境中的探索，概括和鲁棒性。这项工作旨在促进对自动RL代理的理解及其在各种动态环境中增强技能获取的潜力。
内在体感反馈支持运动控制和学习操作人造身体部位
摘要 目的 人们投入了大量资源，通过提供非自然形式的体感反馈来增强假肢的控制和可用性。在本文中，我们研究了远程控制假肢的身体部位的内在体感信息是否可以被运动系统利用来支持控制和技能学习。 方法 在安慰剂对照设计中，我们使用局部麻醉来减弱大脚趾的体感输入，同时参与者学习通过压力传感器操作脚趾控制的手动佩戴的机器人额外手指。将运动学习结果与接受假麻醉的对照组进行比较，并在三种不同的任务场景中进行量化：与生物手指隔离操作、同步协调操作和协作操作。 主要结果 两组都能够学会操作机器人额外手指，大概是因为视觉反馈和其他相关的感官提示非常丰富。重要的是，远端身体控制器提供的位移体感提示有助于获得独立的机器人手指运动、保持和转移同步手部机器人协调技能以及在认知负荷下的表现。当任务涉及与生物手指的密切协作时，脚趾麻醉不会损害运动表现，这表明运动系统可以通过动态整合来自多个甚至远端身体部位的任务内在体感信号来弥补感觉反馈差距。意义总之，我们的研究结果表明，除了人工刺激之外，还有多种自然途径可以提供内在替代体感信息来支持对人造身体部位的运动控制。
家庭冲突的纵向作用和神经奖励敏感性在年轻人的内在症状中
青春期通常与心理病理学的增加有关。以前的研究已经研究了家庭环境和神经奖励敏感性如何在青年的情绪发展中分别发挥作用，但在预测青年的内在症状方面，他们如何相互互动仍然未知。因此，当前的研究采用了一种生物心理社会的方法来检查这个问题，该问题使用青少年脑认知发展研究中的9353个前preadolagents（T1; 51％男孩的平均年龄= 9.93岁）的两波纵向数据进行了检查。使用混合效应模型，结果表明，较高的家庭冲突预测了1年后青年的内在症状增加，而奖励收到期间较大的腹纹状体（VS）活动预测随着时间的推移会减少内部化症状。重要的是，家庭冲突与活动之间有相互作用的效果。对于在奖励收据期间表现出更大的激活与激活的年轻人，高家庭冲突更有可能预测内在症状的增加。在奖励收据期间有低VS激活的青年表现出高水平的内在症状，而不论家庭冲突如何。调查结果表明，青年的神经奖励敏感性是对不利家庭环境的敏感性的标志，并强调了培养支持性家庭环境的重要性，在这些家庭环境中，青年在家庭中经历较少的冲突。
实施主义：主要是古老想法的新名称？连接内在和感知的可信度
本文提出了对AI可信度的正式描述，并在操作示意图中连接了内在和感知的可信度。我们认为，可信度超出了AI系统的固有功能，包括观察者的看法，例如感知到的透明度，代理基因座和人类的监督。在文献中讨论了感知到的可信度的概念，但很少有尝试将其与AI系统的内在可信度联系起来。我们的分析引入了一种新颖的示意图，以评估预期和观察到的行为之间的差异以及这些如何影响感知的不确定性和信任，以量化可信度。本文考虑了感知和内在特征，为衡量可信赖性提供了形式化。通过详细说明影响信任的因素，本研究旨在促进更具道德和广泛接受的AI技术，以确保它们符合功能和道德标准。