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非小细胞肺癌的分子分析
肺癌通常采用常规疗法治疗，包括化疗和放疗。然而，这些方法并不针对癌细胞，而是攻击存在的每个细胞，包括正常细胞。个性化疗法提供了更有效的治疗选择，因为它们针对的是个人的基因组成。这项研究的目的是确定早期各种肺癌亚型中致病基因突变的频率。从 799 名接受肺癌切除术的患者中选取了 833 个非小细胞肺癌样本，对六种已知突变进行分子分析，包括 EGFR、KRAS、BRAF、PIK3CA、HER2 和 ALK。SNaPshot 检测用于点突变，片段分析用于搜索插入和缺失。通过 IHC +/- FISH 评估 ALK。进行了统计分析以确定分子数据与临床/病理患者数据之间的相关性。在大多数（66.15%）病例中均未发现任何测试变异。在总样本和腺癌病例中观察到的频率有明显差异，频率最高的是 KRAS 突变（24.49% vs. 35.55%），其次是 EGFR（6.96% vs. 10.23%）、PIK3CA（1.20% vs. 0.9%）、BRAF（1.08% vs. 1.62%）、ALK（0.12% vs. 0.18%），而最低的是 HER2 突变（两者均为 0%）。统计分析显示，突变的存在与性别、癌症类型、血管侵犯和吸烟史之间存在相关性。本研究结果将提供帮助分层患者预后的数据，并支持开发更精准的治疗方法，从而改善未来肺癌患者的预后。
Hasan MK，Datta AK，Saha A，Begum S（2025）Hipposideros Grandis G.M.的新分销记录艾伦（Allen），1936年，大叶鼻子蝙蝠（Chiroptera，HipposiLepidocollema Brisbanense（c。Knight）p.m. Jørg。，一个新的...
Lepidocollema Vain。是大型属属，在1890年在Pannariaceae Tuck（真菌，Ascomycota）内首次描述。它是peltigerales组的第二大属（Ekman等人2014）。该属被其皮质的，叶状的thallus与nostoc作为光增生器，带有平坦rosettes的灰色thallus和黑色的假设（Poengsungngnoen等人。2021）。最近的分子分析发现，鳞翅目不构成单系组（Elvebakk 2021）。但是，该属和生理学杂志之间存在密切的亲和力（Ekman等人2014; Elvebakk等。2016）。的物理学以厚壁孢子的存在为由，而鳞翅目的特征是存在薄壁的孢子孢子（Ekman等人。2014; Elvebakk 2021）。Lepidocollema被广泛分布，根据索引真菌（2024）和GBIF（2024），全球有24种公认的物种。它们的分布主要在热带地区，但有些也出现在亚热带地区（包括泰国）（Rangsiruji等人。2016; Poengsungnoen等。2021），日本，印度，拉雷尼翁，澳大利亚，美国，菲律宾，巴西，斯里兰卡，巴布亚新几内亚，瓜德罗普（Ekman等）（Ekman等人2014）。印尼群岛的各种地理和环境条件解释了它们的庞大但仍然不足的地衣生物多样性。北莫卢卡斯（North Moluccas）以及马鲁省（Maluku Province）是Moluccas群岛的一部分，位于Wallacea的中央生物地理区域（Van Welzen等人目前对地衣的研究重点主要集中在其作为环境生物指导者的多样性和潜力上，并在苏门答腊和Java地区进行了广泛的研究（Windadri 2019）。2005）。 Wallacea被认为是世界上25个生物多样性热点之一，它支持具有许多独特物种的高度多样化的生物群落（Myers等人。 2000; Van Welzen等。 2005; CEPF 2014），包括真菌的多样性。 根据Retnowati等人的说法。 （2019），这些岛屿上记录的地衣多样性约占印度尼西亚已知的物种总物种的2.5％。 在Moluccas中，通常发现了来自11个家庭的35种地衣，覆盖了各种颜色和形式的岩石，树木和其他表面（Windadri 2019）。 但是，印度尼西亚东部地衣多样性的数据仍然有限，这突出了需要进一步研究和探索以发展对该地区的更全面理解的必要性。 在分析从2022年从莫鲁卡斯岛的生物调查中获得的材料分析时，观察到一个值得注意的地衣标本。 为了确定有趣的地衣的身份，我们进行了预先比较。 对形态特征和分子数据的研究都导致了该系列代表一个新物种，即莱皮多罗玛·布里斯巴森（Lepidocollema Brisbanense）（C. Knight） Jørg。，对于印度尼西亚，特别是在莫卢卡斯群岛，我们在这里记录。 在此过程中，我们还发现了来自印度尼西亚的未发表收藏。2005）。Wallacea被认为是世界上25个生物多样性热点之一，它支持具有许多独特物种的高度多样化的生物群落（Myers等人。2000; Van Welzen等。2005; CEPF 2014），包括真菌的多样性。 根据Retnowati等人的说法。 （2019），这些岛屿上记录的地衣多样性约占印度尼西亚已知的物种总物种的2.5％。 在Moluccas中，通常发现了来自11个家庭的35种地衣，覆盖了各种颜色和形式的岩石，树木和其他表面（Windadri 2019）。 但是，印度尼西亚东部地衣多样性的数据仍然有限，这突出了需要进一步研究和探索以发展对该地区的更全面理解的必要性。 在分析从2022年从莫鲁卡斯岛的生物调查中获得的材料分析时，观察到一个值得注意的地衣标本。 为了确定有趣的地衣的身份，我们进行了预先比较。 对形态特征和分子数据的研究都导致了该系列代表一个新物种，即莱皮多罗玛·布里斯巴森（Lepidocollema Brisbanense）（C. Knight） Jørg。，对于印度尼西亚，特别是在莫卢卡斯群岛，我们在这里记录。 在此过程中，我们还发现了来自印度尼西亚的未发表收藏。2005; CEPF 2014），包括真菌的多样性。根据Retnowati等人的说法。（2019），这些岛屿上记录的地衣多样性约占印度尼西亚已知的物种总物种的2.5％。在Moluccas中，通常发现了来自11个家庭的35种地衣，覆盖了各种颜色和形式的岩石，树木和其他表面（Windadri 2019）。但是，印度尼西亚东部地衣多样性的数据仍然有限，这突出了需要进一步研究和探索以发展对该地区的更全面理解的必要性。在分析从2022年从莫鲁卡斯岛的生物调查中获得的材料分析时，观察到一个值得注意的地衣标本。为了确定有趣的地衣的身份，我们进行了预先比较。对形态特征和分子数据的研究都导致了该系列代表一个新物种，即莱皮多罗玛·布里斯巴森（Lepidocollema Brisbanense）（C. Knight）Jørg。，对于印度尼西亚，特别是在莫卢卡斯群岛，我们在这里记录。在此过程中，我们还发现了来自印度尼西亚的未发表收藏。
通过深度学习方法预测非小细胞肺癌脑转移患者的 EGFR 突变状态
摘要目的非小细胞肺癌 (NSCLC) 倾向于转移到大脑。10% 到 60% 的 NSCLC 携带表皮生长因子受体 (EGFR) 的激活突变，可通过选择性 EGFR 抑制剂进行靶向治疗。然而，由于原发性肿瘤和脑转移瘤 (BM) 的分子特征不一致率很高，因此确定个体患者 BM 的 EGFR 状态需要通过侵入性手术进行组织诊断。我们采用了深度学习 (DL) 方法，旨在非侵入性地检测 NSCLC BM 中的 EGFR 突变状态。方法我们回顾性收集了 2009-2019 年期间被诊断为 BM 并接受 BM 切除术的所有 NSCLC 患者的临床、放射学和病理分子数据。然后根据 EGFR 突变状态将研究人群分为两组。我们进一步采用深度学习技术根据术前磁共振成像特征对两组进行分类。采用增强技术、迁移学习方法和预测结果的后处理来克服相对较小的队列问题。最后，我们建立了模型预测 NSCLC BM EGFR 突变状态的准确性。结果本研究纳入了 59 例患者，其中 16 例患者携带 EGFR 突变。我们的模型在 5 个验证数据集中预测突变状态的平均准确率为 89.8%、灵敏度为 68.7%、特异度为 97.7%，受试者工作特征曲线值为 0.91。结论基于深度学习的无创分子表征是可行的，具有较高的准确性，应该在大型前瞻性队列中进一步验证。
骨头
骨折的愈合可能会变得异常，并导致骨折，进而对患者健康产生负面影响。了解为什么骨骼通常无法治愈的原因会使我们能够对患者的生活产生积极影响。虽然我们在裂缝修复的啮齿动物模型上拥有大量的分子数据，但人类与人类不一样。因此，仍然缺乏有关正常生理修复和骨无法分子差异的信息。这项研究旨在通过比较生理裂缝愈伤组织与两种不同的骨不连类型的差异表达的基因（DEG），即肥厚（HNU）和贫营养（ONU）之间的差异表达基因（DEG）来解决这一差距。RNA测序数据在每个样品中揭示了约18,000个基因。使用生理愈伤组织作为对照和肉骨样品作为实验组，生物信息学分析分别确定了HNU和ONU的67和81统计学意义的DEG。在HNU的67摄氏度中分别向上和下调。同样，在ONU的81度中，48和33分别向上和下调。此外，我们还确定了两个骨不连的样品之间的共同基因。 8（10.8％）上调，12（22.2％）下调。我们进一步确定了许多生物学过程，并具有几种具有统计学意义的生物过程。其中一些与肌肉有关，并且在两个骨不连的样品之间很常见。这项研究代表了了解人类肉瘤生物学中发生的全球分子事件的首次全面尝试。通过进一步的研究，我们也许可以破译可能针对治疗靶向的人骨骨折的异常愈合的新分子途径。
致电授予申请-Hepatobiliary Cancers（...
肝胆癌的治疗进展正在为患者带来巨大变化。具有免疫疗法作为治疗方案的骨干的效用，与此类药物的组合疗法已成为中心阶段，为进一步的进步开辟了大门，以优化患者的疗效，安全性和易用性。1这导致了大量试验，评估了双特异性分子在肝脏空间中的作用。1鉴于双特异性代理商的独特MOA和新颖性，在治疗肝脏癌的多学科团队成员中，需要教育。2现在开始教育将减少学习曲线，并为患者的快速采用这些分子铺平道路。提案可能会讨论包括：我们正在寻求提出的提案，以解决有助于解释肝小癌中双特异性分子的基本原理的主题。更具体地说，建议可以详细概述双特异性分子的MOA，从而清楚地解释了它们与当前方案，它们是什么以及没有什么不同。为什么双特异性分子可以有效地治疗肝癌癌。概述了正在探索双特异性分子以治疗肝胆癌的双特异性分子，以及迄今为止可能存在的双特异性分子数据，包括安全性和功效。医学教育活动可清楚地概述这些分子并建立基准理解水平，目前必须从中扩展其他计划。参考需要双特异性分子是肝胆汁空间的新手，因此，我们预计在了解这些分子的独特作用机理以及在患者中使用这种治疗方式时，我们预计会有很大的学习曲线。
属性图的属性分子生成模型
培训生成模型，捕获数据的丰富语义并解释由此类模型编码的潜在表示，这是未/自我监督学习的非常重要的问题。在这项工作中，我们提供了一种简单的算法，该算法依赖于预先训练的生成自动编码器的潜在代码的扰动实验，以发现生成模型暗示的属性图。我们执行扰动实验，以检查给定潜在变量对属性子集的影响。鉴于此，我们表明一个人可以拟合一个有效的图形模型，该模型在被视为外源变量的潜在代码和被视为观察到的变量的属性之间建模结构方程模型。一个有趣的方面是，单个潜在变量控制着属性的多个重叠子集，与试图施加完全独立性的传统方法不同。使用在大型小分子数据集中训练的预训练的生成自动编码器，我们证明，我们算法学到的各种分子属性和潜在代码之间的图形模型可用于预测从不同分布中绘制的分子的特定特性。我们比较了对简单基线选择的各种特征子集的预测模型，以及现有的因果发现和稀疏学习/特征选择方法，以及从我们的方法中衍生的马尔可夫毛毯中的预测模型。的结果从经验上表明，依赖于我们的马尔可夫毛花属性的预测因子在转移或通过新分布中的一些样本进行微调时，尤其是在训练数据受到限制时，分布变化是可靠的。
评估DNA修复缺陷的突变积累...
李斯特氏病是由细菌单核细胞增生菌引起的，是一种严重的食源性疾病，具有很大的公共卫生影响，尤其是由于其在高危人群中的严重结果。弱势群体 - 包括老年人，孕妇，新生儿和免疫功能低下的个体 - 特别容易受到这种疾病的侵入性形式，例如菌血症和脑膜炎。这些条件与高病态率率有关，强调了良好的食品安全和监视系统的重要性，即通过迅速识别受污染的食物来源来迅速检测和管理暴发。欧洲疾病预防与控制中心（ECDC）的最新数据表明，欧洲李斯特菌病病例的增加，强调了这种感染对公共卫生的持续挑战（欧洲预防疾病预防与控制中心，2023年）。在奥地利，自2014年以来，从人，食物和环境来源的单核细胞增生菌菌分离出来。自2016年以来，这些分离株已通过全基因组测序（WGS）和核心基因组多焦点序列（CGMLST）常规分析（Cabal等，2019; Pietzka等，2019）。NRL在中央数据库中管理WGS数据，应用CGMLST跟踪簇和跟踪潜在的污染源。这种系统的监测与欧盟范围内的计划保持一致，该计划授权了侵入性李斯特菌病病例的通知，并使用基于WGS的监视作为早期爆发检测和控制的基石。在李斯特菌爆发调查中，CGMLST是一种具有高歧视性的技术。在李斯特菌爆发调查中，CGMLST是一种具有高歧视性的技术。通过分析单核细胞增生乳杆菌基因组中的保守基因来鉴定遗传相关的克隆。Ruppitsch等人（欧洲疾病预防与控制中心，2020年），用于单核细胞增生李斯特菌的键入。 具有1,701个靶基因以及Moura等人的巴斯德方案的方案（Ruppitsch等，2015）。 具有1,748个目标基因是常用的CGMLST方案，在整个欧盟成员国的监视工作协调方面起着至关重要的作用（Ruppitsch等，2015; Moura等，2016; 2016; 2016;欧洲疾病预防与控制中心，2020年）。 CGMLST在李斯特菌爆发检测中的一个基本方面是应用簇阈值（通常为7-10个等位基因差异）将与爆发相关的病例与零星的病例分开。 该阈值基于研究表明，从同一暴发中分离出来的分离率通常差异少于7-10个等位基因（Ruppitsch等，2015；欧洲疾病预防与控制中心，2022年）。 通过应用此限制，调查人员可以有效地确定何时开始爆发调查并优化食物追溯工作。 将分子数据与流行病学证据的整合，包括患者的食物史，在几项爆发研究中证明至关重要，从而可以鉴定受污染的食物来源以及快速实施控制措施，例如食品产品召回。 例如，从2014年到2019年，涉及22例欧盟成员国的22例单核细胞增生疫苗爆发与使用CGMLST污染的鲑鱼产品有关（欧洲疾病中心用于单核细胞增生李斯特菌的键入。具有1,701个靶基因以及Moura等人的巴斯德方案的方案（Ruppitsch等，2015）。 具有1,748个目标基因是常用的CGMLST方案，在整个欧盟成员国的监视工作协调方面起着至关重要的作用（Ruppitsch等，2015; Moura等，2016; 2016; 2016;欧洲疾病预防与控制中心，2020年）。 CGMLST在李斯特菌爆发检测中的一个基本方面是应用簇阈值（通常为7-10个等位基因差异）将与爆发相关的病例与零星的病例分开。 该阈值基于研究表明，从同一暴发中分离出来的分离率通常差异少于7-10个等位基因（Ruppitsch等，2015；欧洲疾病预防与控制中心，2022年）。 通过应用此限制，调查人员可以有效地确定何时开始爆发调查并优化食物追溯工作。 将分子数据与流行病学证据的整合，包括患者的食物史，在几项爆发研究中证明至关重要，从而可以鉴定受污染的食物来源以及快速实施控制措施，例如食品产品召回。 例如，从2014年到2019年，涉及22例欧盟成员国的22例单核细胞增生疫苗爆发与使用CGMLST污染的鲑鱼产品有关（欧洲疾病中心具有1,701个靶基因以及Moura等人的巴斯德方案的方案（Ruppitsch等，2015）。具有1,748个目标基因是常用的CGMLST方案，在整个欧盟成员国的监视工作协调方面起着至关重要的作用（Ruppitsch等，2015; Moura等，2016; 2016; 2016;欧洲疾病预防与控制中心，2020年）。CGMLST在李斯特菌爆发检测中的一个基本方面是应用簇阈值（通常为7-10个等位基因差异）将与爆发相关的病例与零星的病例分开。该阈值基于研究表明，从同一暴发中分离出来的分离率通常差异少于7-10个等位基因（Ruppitsch等，2015；欧洲疾病预防与控制中心，2022年）。通过应用此限制，调查人员可以有效地确定何时开始爆发调查并优化食物追溯工作。将分子数据与流行病学证据的整合，包括患者的食物史，在几项爆发研究中证明至关重要，从而可以鉴定受污染的食物来源以及快速实施控制措施，例如食品产品召回。例如，从2014年到2019年，涉及22例欧盟成员国的22例单核细胞增生疫苗爆发与使用CGMLST污染的鲑鱼产品有关（欧洲疾病中心
利用量子化学指导的多目标贝叶斯优化发现储能分子材料
氧化还原液流电池 (RFB) 因其灵活的设计、可扩展性和低成本而成为固定储能应用的一项有前途的技术。在 RFB 中，能量以可流动的氧化还原活性材料 (redoxmers) 的形式传输，这些材料存储在外部并在运行期间泵送到电池中。要进一步提高 RFB 的能量密度，就需要设计具有更宽氧化还原电位窗口和更高溶解度的氧化还原聚合物。此外，设计具有荧光自报告功能的氧化还原聚合物可以监测 RFB 的健康状况。为了加速发现具有所需特性的氧化还原聚合物，最先进的机器学习 (ML) 方法（例如多目标贝叶斯优化 (MBO)）非常有用。在这里，我们首先采用密度泛函理论计算，基于 2,1,3-苯并噻二唑 (BzNSN) 核心结构，为 1400 个氧化还原聚合物分子生成还原电位、溶剂化自由能和吸收波长的数据库。根据计算出的属性，我们确定了 22 种兼具所有所需属性的帕累托最优分子。我们进一步利用这些数据开发和基准测试了 MBO 方法，以快速有效地识别具有多种目标属性的候选分子。使用 MBO，与蛮力或随机选择方法相比，从 1400 个分子数据集中识别最佳候选分子的效率至少提高 15 倍。重要的是，我们利用这种方法从 100 万个基于 BzNSN 的分子的未知数据库中发现了有前途的氧化还原体，我们发现了 16 种新的帕累托最优分子，其性能比最初的 1400 种分子有显著改善。我们预计这种主动学习技术是通用的，可用于发现满足多种所需属性标准的任何一类功能材料。
重新审视Axelrod的假设：北半球常绿的硬化橡树的起源是什么？
Quercus属（Oaks）是Fagaceae家族中生物多样性最多的属，其中包括分布在北半球的400多种。橡树种类与松树一起在森林生态系统中起着至关重要的作用，因为它们是最大的树木生物量，并支持中纬度森林中最大的物种多样性[1]。与其他属不同，例如带有上述的Pinus或密切相关的岩石果，Oaks在形态学，解剖学，物候，生理和生态和生态特征和策略中显示出显着的差异。这种异质性使橡树物种能够在该属的巨大分布范围内占据广泛的不同气候和环境[2]。橡木物种的确切数量仍然不确定，并且可能无限期地保持如此无限。难度在于这些物种形态特征的显着可塑性，以及物种之间的杂交和渗入。尽管如此，几位与该属的作者最近解决了非同叶进化枝内的许多关系 - 通过应用分子数据，经过了广泛的重新分类[3-8]。因此，在对亚属进化枝的最后一次重大修订[5]之后，Quercus属已分为两个亚属：近代的塞里斯（旧世界橡树）和果酱（新世界橡木），以及八个部分：cyclobalanopsis，ilex和cerris suberius cerris and cerranus subnus and loctae and oft unt obbate and oft unt obbate untib andob insob insob insob，亚凝胶Quercus（图1）。除了教派外，目前严格存在于世界各地的每个部分。Quercus，具有霍拉克斯分布和两个分离的种类。Ponticae。尽管2017年之前的研究正在考虑对各节或子属的一些不同概念，但我们将在本综述中提到当前的概念。两个子属的起源都被认为位于各自的地区，旧世界[8]和
下一代测序和基因组图谱
简介：肺癌是全球癌症相关死亡的主要原因，在摩洛哥发病率很高。该国这种疾病的流行病学复杂，需要深入分析基因图谱以改善诊断和治疗。本研究利用新一代测序 (NGS) 绘制摩洛哥肺癌患者的基因变异图谱，而这一领域的分子数据严重缺乏。重要的是，本研究使用新一代测序技术对摩洛哥人群中的肺癌进行了开创性的分析。虽然以前的研究只关注有限数量的基因，但我们的研究提供了对该队列中基因变异的全面而详细的视角，包括肿瘤印迹的生成。方法：本研究涉及 100 名经组织学确诊的肺癌患者。使用 NGS 技术结合 Oncomine Precision Assay GX 方案检测基因异常。制备、纯化和测序肺活检样本，并分析所得数据以识别显著的遗传变异。结果：分析显示 13 种不同基因存在遗传变异，其中 TP53、KRAS 和上皮生长因子受体 (EGFR) 基因的突变率较高。TP53 突变出现在 27% 的病例中，而 KRAS 和 EGFR 分别在 19% 和 14% 的样本中出现突变。ALK、MET、ERBB2 和 ROS1 基因中也发现了具有临床意义的突变，凸显了该群体中存在大量基因组多样性。结论：本研究结果增强了对摩洛哥肺癌患者遗传变异的了解，并强调了加强摩洛哥先进分子诊断工作的必要性。NGS 的使用已经确定了关键的基因突变，促进了个性化治疗的发展并改善了临床结果。这些发现为旨在改进诊断和治疗策略的未来研究铺平了道路，从而有助于更好地管理患者。