因此,我们旨在通过反复进行目标AID的基本构建以及对反馈的评估和验证,以建立高度的技术。 (1)基本技术的构建:首先创建超级目标AID,为了使基因组编辑更有效,我们将创建一个改进的功能目标AID(超级目标AID)。研究主要考虑质粒方面的变化。我们旨在通过使用没有复制能力的瞬态质粒来控制温度敏感启动子和组成启动子的DCAS9和CRISPR-GRNA,使用快速降解酶(LVATAG)[参考2],以及使用抑制DNA修复机制(UGIS)的系统。接下来,我们还将考虑修改酶本身。我们还考虑使用反遗传方法的改进,例如减少CAS9非特异性结合的突变[参考3],增加辅助酶活性的突变[参考4]以及对融合酶的接头长度的修改。 (2)评估基础替代效率:基因组编辑中靶点效应的验证,关键点是如何抑制与目标序列不同的位点的意外诱变,以及如何验证这一点。意外突变包括通过类似于目标序列的靶向序列引入的突变,以及完全独立于序列的非特异性突变。为了验证脱靶,使用破坏RPOB基因的利福平抗药性菌株进行评估。在改进目标基因,培养条件和目标AID的编辑方法的同时,进行了非目标评估,并最终进行了大肠杆菌的整个基因组序列以验证测试。
摘要Buruli溃疡(BU)是与皮肤相关的热带疾病之一(皮肤NTDS)之一,是由卵巢菌属甲虫的皮下感染引起的坏死和残疾皮肤疾病。从世界卫生组织(WHO)于1998年建立了全球BU计划,据报道,已有32多个国家(大部分来自西非和澳大利亚)的BU案件> 67,000例。目前正在从利福平加链霉素(注射)到全口径方案的过渡期,但它不能希望消除这种机会性的环境病原体。M. ulcerans在遗传上与相关的致病生物非常相似。然而,M。ulcerans携带独特的巨质质剂PMUM001,编码负责产生脂质的外毒素毒素毒力因子菌根霉素的生物合成机械。这种扩散的化合物导致BU的致病性病因与其他分枝杆菌感染的显着差异。因此,霉菌酮是细胞毒性和免疫抑制作用,并在感染皮肤中引起血管功能障碍。在我们对BU发病机理的理解方面的一个重大进步已经达成了霉菌酮在宿主细胞中的作用机理的一致性,该机制在分泌和膜蛋白生物发生的重大步骤中针对SEC61转运。尽管所有分枝杆菌的疫苗开发都充满了挑战,但Mycolactone Pro Duction可能在BU疫苗的开发中提出了一个特殊的挑战。已知实时销售疫苗BCG仅提供人类的部分和短暂性保护,但在鼠标临床前提供方便的基线
对于 FLT3 突变患者的治疗,Onkopedia 建议如下:• FLT3-ITD 或 FLT3-TKD 突变患者应在诱导治疗的第 8-21 天接受米哚妥林治疗。• 根据一项随机安慰剂对照试验的数据,米哚妥林与标准化疗联合使用可显著延长 60 岁以下 FLT3 突变 AML 患者的 EFS、RFS 和 OS。基于这项研究,EMA 于 2017 年批准米哚妥林与标准诱导化疗联合使用、化疗巩固,以及作为新诊断的 FLT3 突变 AML 患者 12 个 28 天周期的维持治疗。• 与研究人群(年龄 18-59 岁)不同,批准时没有年龄上限。• 60-70 岁患者的数据可从一项 II 期研究中获取。 • 对于计划进行 HSCT 的患者,应在预处理治疗前 48 小时停用米哚妥林。 • 当与强效 CYP3A4 抑制剂(例如酮康唑、泊沙康唑、伏立康唑、利托那韦或克拉霉素)同时使用时,应特别注意毒性,尤其是对于年龄 >60 岁的患者,因为存在米哚妥林水平升高的风险。 • 不应同时使用强效 CYP3A4 诱导剂(例如卡马西平、利福平、恩杂鲁胺、苯妥英、圣约翰草),因为米哚妥林水平会降低。
d 结核病是一种可预防和治愈的传染病,是全球传染病死亡的主要原因之一。从 2000 年到 2023 年,结核病治疗和结核病-艾滋病毒合并感染的抗逆转录病毒疗法挽救了 7900 万人的生命。然而,COVID-19 大流行,加上不公平的卫生服务、冲突、气候变化和自然灾害,严重阻碍了抗击结核病的进展。2023 年,全球估计有 1080 万人患结核病,其中 55% 为男性,33% 为女性,12% 为 15 岁以下儿童。这比 2022 年略有增加,主要是由于人口增长。2023 年全球结核病相关死亡人数减少至 125 万,其中艾滋病毒阴性者为 109 万,艾滋病毒感染者为 16.1 万。这一下降延续了 2022 年出现的积极趋势,此前两年,即 2020 年和 2021 年 COVID-19 疫情最严重时期,结核病发病率曾出现增长。从地理分布来看,2023 年患结核病的大多数人分布在世卫组织的非洲区域(24%)、东南亚区域(45%)和西太平洋区域(17%),东地中海区域(8.6%)、美洲区域(3.2%)和欧洲区域(2.1%)的比例较小。在 2023 年所有结核病病例中,6.1% 为艾滋病毒感染者。世卫组织非洲区域国家新发结核病患者中同时感染艾滋病毒的比例最高,在南部非洲部分地区超过 50%。欧洲结核病患者中患利福平耐药或耐多药结核病的比例最高。
肺部环境拥有一个在健康和疾病中发挥重要作用的微生物社区,包括对病原微生物的先天保护。感染结核分枝杆菌,与结核病(TB)疾病相关的心理压力以及据报道,利福平治疗方案的代谢产物在未糖尿病患者中诱导高血糖症和2型糖尿病(T2DM)诱导高血糖症。提出了高葡萄糖浓度来改变肺微生物群和气道稳态的组成,从而对结核病疾病和治疗结果产生了影响。在这项系统的综述中,我们建议将有关TB诱导的高血糖及其对肺微生物群的影响和气道粘液分泌的文献合成以前糖尿病患者的分泌。将在PubMed,Embase,Medline,Proquest,Cochrane,Scopus以及Google Scholar和相关文章的参考文献上进行系统搜索,以识别其他研究。我们将审查发表的文章,其中包括有关TB诱导的高血糖,肺微生物组,粘蛋白分泌和(或)在结核病诊断后和治疗期间气道表面液体的研究。研究文章的质量将使用修改后的纽卡斯尔 - 奥塔瓦量表(NOS)进行评估。元分析将使用随机效应模型进行异质性进行汇总微生物多样性的估计。Egger的测试将进行探索任何选择性报告偏差。系统审查和荟萃分析的发现将根据预先处理的报告项目进行系统审查和荟萃分析(PRISMA)协议指南。该协议已开发并上传到国际系统审查登记册(Prospero)数据库,注册号:CRD42024482248。
----------------------------------------------------------------------------------------------•胃恶性肿瘤:在成年人中,有症状的反应并不排除胃恶性肿瘤的存在。考虑其他随访和诊断测试。(5.1)•急性微管间质肾炎:停止治疗并评估患者。(5.2)•艰难梭菌相关的腹泻:PPI治疗可能与风险增加有关。(5.3)•骨折:长期和多种剂量PPI治疗可能与髋关节,腕部或脊柱骨质疏松相关的骨折风险增加有关。(5.4)•皮肤和全身性红斑狼疮:大多是皮肤的;现有疾病的新发作或加剧;终止Nexium,并参考专家进行评估。(5.5)•与氯吡格雷的相互作用:避免使用Nexium。(5.6)•氰callamin(维生素B-12)缺乏症:每日长期使用(例如,超过3年)可能导致吸收不良或氰cal症的缺乏。(5.7)•低磁性血症:据报道很少对PPI进行长时间治疗。(5.8)•与圣约翰麦芽汁或利福平的相互作用:避免同时使用Nexium。(5.9,7.3)•与神经内分泌肿瘤的诊断研究相互作用:降低了铬酸A(CGA)水平可能会干扰神经内分泌肿瘤的诊断研究,在评估CGA水平之前,至少14天暂时停止Nexium。(5.10,12.2)•与甲氨蝶呤的相互作用:与PPI的伴随使用可能会升高和/或延长甲氨蝶呤和/或其代谢物的血清浓度,可能导致毒性。(5.12)高剂量甲氨蝶呤给药,考虑暂时退出Nexium。(5.11,7.7)•基础腺息肉:长期使用的风险增加,尤其是一年以上。使用最短的治疗持续时间。
摘要 结核性脑膜炎 (TBM) 的死亡率仍然保持在 30% 左右,大多数死亡发生在开始治疗后的 2 个月内。耐药菌株的死亡率更高,因此及早发现耐药性 (DR) 至关重要。靶向下一代测序 (tNGS) 产生高读取深度,可以检测低频率的 DR 相关等位基因。我们将 Deeplex Myc-TB(一种 tNGS 检测)应用于 72 名经微生物学确诊的 TBM 成人的脑脊液 (CSF) 样本,并将其基因组药物敏感性预测与表型敏感性测试 (pDST) 和全基因组测序的综合参考标准以及临床结果进行了比较。Deeplex 在 24/72 (33.3%) 个 CSF 样本中检测到结核分枝杆菌复合体 DNA,并为 22/24 (91.7%) 生成了完整的 DR 报告。 Deeplex 生成的读取深度与 MTB/RIF Xpert 的半定量结果相关。在与一线 DR 相关的典型基因座上可以看到频率 <20% 的等位基因。忽略这些低频等位基因,Deeplex 与除吡嗪酰胺和链霉素以外所有药物的综合参考标准 100% 一致。三名患者在治疗 30 天后脑脊液培养呈阳性;参考测试和 Deeplex 在其中两名患者中鉴定出异烟肼耐药性,而 Deeplex 单独在一名患者中鉴定出低频利福平耐药等位基因。五名患者死亡,其中一名患者通过 pDST 鉴定出吡嗪酰胺耐药性。脑脊液 tNGS 可以快速准确地检测出耐药 TBM,但其应用仅限于细菌负荷较高的患者。对于细菌负荷较低的患者,需要开发诊断和耐药性检测的替代方法。
Bylvay (odevixibat) 是一种回肠胆汁酸转运蛋白抑制剂,用于治疗患有进行性家族性肝内胆汁淤积症 (PFIC) 的 3 个月或以上患者的瘙痒症。Bylvay 还用于治疗患有 Alagille 综合征 (ALGS) 的 12 个月及以上患者的瘙痒症。PFIC 是一组常染色体隐性遗传的异质性肝病,其特征是胆汁淤积症早期发作(通常在婴儿期),伴有瘙痒和吸收不良,病情迅速发展并最终导致肝功能衰竭。瘙痒是胆汁淤积症中最明显和最难以忍受的症状。有人提出,瘙痒是由于血清胆汁酸增加而刺激无髓鞘表皮下游离神经末梢引起的。ALGS 是一种罕见的遗传性疾病,由参与子宫内胚胎发育的 JAG1 或 Notch2 基因突变引起。在 ALGS 患者中,多个器官系统可能受到突变的影响。在肝脏中,突变导致胆管异常狭窄、变形和数量减少,导致胆汁酸积聚、胆汁淤积,并最终导致进行性肝病。ALGS 患者所经历的胆汁淤积性瘙痒是所有慢性肝病中最严重的,大多数受影响的儿童在三岁时就会出现这种瘙痒。与 PFIC 或 Alagille 综合征相关的瘙痒的常规治疗包括尿糖胆酸 (UCDA)、抗组胺药(例如苯海拉明)、胆汁酸螯合剂(例如考来烯胺)、利福平、纳曲酮和舍曲林。使用限制:Bylvay 可能对具有特定 ABCB11 变体的 PFIC 2 型患者亚组无效,导致胆汁盐输出泵蛋白 (BSEP- 3) 无功能或完全缺失。
• 2022 年,欧盟/欧洲经济区 (EU/EEA) 的 30 个国家共报告了 36 179 例结核病 (TB) 病例(每 100 000 人口 8.0 例)。 • 与前两年相比,2022 年的通知率略有上升。尽管有所增加,但与 2020 年之前的时期相比,年平均变化率总体呈下降趋势。然而,按照目前的速度,欧盟/欧洲经济区尚未实现世界卫生组织到 2030 年结束结核病流行的全球结核病战略。 • 鉴于欧盟/欧洲经济区为减轻 COVID-19 大流行而采取的措施可能会对结核病诊断和临床服务及监测产生影响,因此应谨慎解读 2020 年和 2021 年病例总数和通知率的下降。 • 报告的药物敏感性测试结果显示,4.9% 的结核病病例为利福平耐药/耐多药 (RR/MDR)。在接受二线药物敏感性测试的耐多药结核病病例中,26.9% 报告为广泛耐药前 (pre-XDR),而 10% 报告为广泛耐药 (XDR)。 • 21 个国家报告的艾滋病毒感染率占其结核病总病例的 73.6%,在已知艾滋病毒感染率的结核病病例中,4.1% 为艾滋病毒阳性。 • 2021 年报告的所有结核病病例中有 64.0% 获得治疗成功,2021 年报告的 HIV 合并感染结核病病例中有 54.0% 获得治疗成功,2020 年报告的 RR/MDR 结核病病例中有 52.5% 获得治疗成功,2020 年报告的 XDR 前结核病病例中有 22.2% 获得治疗成功。
背景在2021年,有超过1000万人因结核病(TB)而患病,其中包括近50万人使用多药或耐利Fampicin的TB(MDR/RR-TB)(1)。已知只有三分之一的MDR/RR-TB患者已被诊断并接受治疗。易受利福平但对异尼氏二氮的抗性结核病患者的数量估计比RR-TB高两倍以上,并且在很大程度上未被发现和未经治疗(2)。在全球范围内,MDR/RR-TB中氟喹诺酮耐药性的患病率约为20%。最近,世界卫生组织(WHO)认可使用一种由Bedaquiline,Fipomanid,Linezolid和Moxifloxacin(BPALM)组成的全年全年6个月的新型治疗方法,包括患有MDR/RR-TB的患者,包括对氟尿固醇(前XDR-XDR-TB)的耐药性。新推荐的BPALM方案提供了更好的结果,明显缩短了治疗的持续时间,从而显着改善了MDR/RR-TB患者的生活质量(3)。一个新出现的关注点是Bedaquiline和lineZolid耐药性,因为这两种药物是较短的MDR/RR-TB方案的骨干,预计这些药物对于未来方案中耐药TB的治疗仍然至关重要。为了结束全球结核病的流行,我们必须大大扩展对药物抗药性测试的机会,包括构成推荐用于药物敏感和耐药性TB的最佳可用方案的药物。当前WRD仅检测对有限数量药物的耐药性,并且仅覆盖单个或几个抗性相关的基因区域。目前,没有谁推荐的快速诊断(WRD)可以在单个测试中检测到这两种治疗方案中对所有药物的耐药性来为治疗决策提供信息,也没有任何WRD检测到对新的和重复的药物的耐药性,例如bedaquiline,lineZolid,lineZolidzolid,delamanid和phitamanid和Pitermanid(4)。有针对性的下一代测序(NGS)技术伴侣使用下一代测序技术扩增所选基因,以通过一次测试来检测许多药物的抗性。此外,由于目标NG可以询问整个基因以识别与抗药性相关的特定突变,因此与现有WRD相比,有针对性的NG可以提供提高的精度。此外,新的基于NGS的新测试可以检测到当前未包含在任何其他分子测定中的新的和重新利用的药物的耐药性。基于NGS的靶向测试提供了巨大的潜力,可以提供与现代治疗方案相匹配的全面阻力检测。在2022年,他们委托了一系列有关已发表和未发表的针对性NGS产品的数据的系统评价,这些数据是商业开发用于结核病药物耐药性检测的。WHO TB诊断的评估过程已演变为一种侧重于评估结核病诊断产品而不是特定产品的机制。三种产品符合评估的纳入标准。系统评价包括有关诊断准确性,经济信息以及有关可行性,可接受性,公平性和最终用户价值观和偏好的定性证据的数据。For this guideline process, the class of targeted NGS products was defined as one that uses massively parallel sequencing to detect resistance to TB drugs, starting from a processed clinical sample and ending with an end-user report that relates detected Mycobacterium tuberculosis mutations to the presence (or absence) of drug resistance, based on the interpretation of a standard catalogue of mutations.根据可用数据,回顾了对以下药物的耐药性检测:利福平,异念珠菌,左氧氟沙星,莫西法沙星,乙拉托醇,乙酰胺,吡嗪酰胺,Bedaquiline,linezelquiline,linezolid,clofazimine,clofazimine,amikikacin和sttreptheptycin。谁于2023年5月2日至5日召集了一个指南开发小组(GDG),讨论了系统评价的发现并就此技术提出建议。