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基因组规模和途径工程，用于假单胞菌的可持续航空燃料前体异丙醇生产
可持续航空燃料（SAF）将显着影响航空部门的全球变暖，并且重要的SAF目标正在出现。异丙醇是有希望的SAF化合物DMCO（1,4-二甲基甲基氯辛烷）的先驱，并且已在几种工程的微生物中产生。 最近，假单胞菌Putida成为异丙肾生物生物生物生物生物生物生物生物生物生物生物生物生物生物生物生物生物生物生物量的未来寄主，因为它可以利用廉价的植物生物量。 在这里，我们设计了代谢通用的宿主P. putida来生产异丙醇。 我们采用两种计算建模方法（双光线优化和约束最小切割组）来预测基因敲除靶标并优化P. p. putida中的“ IPP-Bypass”途径，以最大程度地提高异源醇的产生。 Alto gether，在喂养批处理条件下，以3.5 g/L的速度获得了p. p. p. p. p. p.的最高生产滴度。 用于高级生物燃料生产的P. Putida上计算建模和应变工程的这种组合在实现可以使用可再生碳流的生物生产过程中具有至关重要的意义。异丙醇是有希望的SAF化合物DMCO（1,4-二甲基甲基氯辛烷）的先驱，并且已在几种工程的微生物中产生。最近，假单胞菌Putida成为异丙肾生物生物生物生物生物生物生物生物生物生物生物生物生物生物生物生物生物生物生物量的未来寄主，因为它可以利用廉价的植物生物量。在这里，我们设计了代谢通用的宿主P. putida来生产异丙醇。我们采用两种计算建模方法（双光线优化和约束最小切割组）来预测基因敲除靶标并优化P. p. putida中的“ IPP-Bypass”途径，以最大程度地提高异源醇的产生。Alto gether，在喂养批处理条件下，以3.5 g/L的速度获得了p. p. p. p. p. p.的最高生产滴度。用于高级生物燃料生产的P. Putida上计算建模和应变工程的这种组合在实现可以使用可再生碳流的生物生产过程中具有至关重要的意义。
巨噬细胞中DNA外切核酸酶TREX1的增强作为心脏缺血性损伤的治疗 胎儿对母体炎症的反应需要小胶质细胞 表征铜绿假单胞菌中群体传感的天然产物抑制剂揭示了Ortho-Vanillin对RHR的竞争性抑制 选择性dyRK1b抑制剂设计的结构观点 枫木：多样本空间转录组学数据的混合框架 Rudeus，一种用于研究DNA结合蛋白的机器学习分类系统 工程大肠杆菌菌株用于生产长的单链DNA SUMO促进DNA修复蛋白的协作，以支持不存在PML 的替代性端粒延长 双牛素增强微管以促进软环境中的生长锥 人类心脏组织的自动化模型 序列建模和设计从分子到基因组量表，
（未通过同行评审认证）是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。此预印本版的版权持有人于2024年2月22日发布。 https://doi.org/10.1101/2024.02.20.581294 doi：Biorxiv Preprint
表征铜绿假单胞菌中群体传感的天然产物抑制剂揭示了Ortho-Vanillin对RHR的竞争性抑制
dyrk1b最近被认为是肿瘤学，代谢综合征和非酒精性脂肪肝病的关键治疗靶标。然而，由于缺乏结构信息，对DYRK1B的选择性抑制剂的发展受到限制。在这项研究中，我们采用了重组蛋白的产生，活性测定和结晶来阐明DYRK1B的结构。我们在与已知抑制剂AZ191中呈现DyRK1b的晶体结构。为了进行比较分析，我们提供了与AZ191复合物中密切相关的DYRK1A激酶的晶体结构。我们的分析确定了DYRK1B的铰链区域中一个独特的结合位点，这对于选择性抑制剂的设计至关重要。量子机械计算揭示了DyRK1b和DyRK1A之间催化赖氨酸的可及性的显着差异，这表明有选择性抑制剂设计的潜在途径。这些发现标志着寻求特定DYRK1B抑制剂的显着进步，与针对DYRK1B和DYRK1A的当前双特异性抑制剂相比，可能具有集中功效。
抑制氨基酸转运蛋白B0AT1（SLC6A19）的分子基础 基于DNA的福克罗诺探针，用于单次单独... 反馈驱动的IoT微流体，电生理学和脑器官研究成像平台 使用支柱/ ... div>的大脑器官的动态培养 通过分析孟加拉国旅行者的密集微生物时间序列数据预测的人类肠道细菌之间的生态关系 表征铜绿假单胞菌中群体传感的天然产物抑制剂揭示了Ortho-Vanillin对RHR的竞争性抑制 原发性鼻病毒感染重新布线组织尺度记忆响应
1 Broer，S。＆Gauthier-Coles，G。哺乳动物细胞中的氨基酸稳态，重点是氨基酸转运。J Nutr 152，16-28（2022）。https://doi.org:10.1093/jn/nxab342 2 Blau，N.，Duran，M.，Gibson，K。M.＆Dionisi-Vici，C。遗传代谢疾病的诊断，治疗和随访的医生指南。3-141（Springer-Verlag，2014年）。 3 Holecek，M。为什么饥饿和糖尿病中分支链氨基酸会增加？ 营养12（2020）。 https://doi.org:10.3390/nu12103087 4 White，P。J.等。 胰岛素作用，2型糖尿病和分支链氨基酸：一条双向街道。 mol Metab，101261（2021）。 https://doi.org:10.1016/j.molmet.2021.101261 5 Palacin，M。＆Broer，S。在医师的诊断，治疗和随访的医师指南中（B.Thorn，M。Duran，M。Duran，K.M.M.M. Gibson和C. Dionisi-Vici）85-99（Springer-Verlag，2014年）。 6 Seow，H。F.等。 hartnup疾病是由编码中性氨基酸转运蛋白SLC6A19的基因突变引起的。 nat Genet 36，1003-1007（2004）。 https://doi.org:10.1038/ng1406 7 Belanger，A。M.等。 抑制中性氨基酸转运以治疗苯酮尿症。 JCI Insight 3（2018）。 https://doi.org:10.1172/jci.insight.121762 8 Belanger，A。J.等。 在鸟氨酸经钙化酶缺乏的小鼠模型中，过量的氮和通过损失SLC6A19的存活增加。 遗传代谢疾病杂志N/A（2022）。 https://doi.org:https://doi.org/10.1002/jimd.12568 9 Jiang，Y。等。3-141（Springer-Verlag，2014年）。3 Holecek，M。为什么饥饿和糖尿病中分支链氨基酸会增加？营养12（2020）。https://doi.org:10.3390/nu12103087 4 White，P。J.等。 胰岛素作用，2型糖尿病和分支链氨基酸：一条双向街道。 mol Metab，101261（2021）。 https://doi.org:10.1016/j.molmet.2021.101261 5 Palacin，M。＆Broer，S。在医师的诊断，治疗和随访的医师指南中（B.Thorn，M。Duran，M。Duran，K.M.M.M. Gibson和C. Dionisi-Vici）85-99（Springer-Verlag，2014年）。 6 Seow，H。F.等。 hartnup疾病是由编码中性氨基酸转运蛋白SLC6A19的基因突变引起的。 nat Genet 36，1003-1007（2004）。 https://doi.org:10.1038/ng1406 7 Belanger，A。M.等。 抑制中性氨基酸转运以治疗苯酮尿症。 JCI Insight 3（2018）。 https://doi.org:10.1172/jci.insight.121762 8 Belanger，A。J.等。 在鸟氨酸经钙化酶缺乏的小鼠模型中，过量的氮和通过损失SLC6A19的存活增加。 遗传代谢疾病杂志N/A（2022）。 https://doi.org:https://doi.org/10.1002/jimd.12568 9 Jiang，Y。等。https://doi.org:10.3390/nu12103087 4 White，P。J.等。胰岛素作用，2型糖尿病和分支链氨基酸：一条双向街道。mol Metab，101261（2021）。https://doi.org:10.1016/j.molmet.2021.101261 5 Palacin，M。＆Broer，S。在医师的诊断，治疗和随访的医师指南中（B.Thorn，M。Duran，M。Duran，K.M.M.M.Gibson和C. Dionisi-Vici）85-99（Springer-Verlag，2014年）。6 Seow，H。F.等。 hartnup疾病是由编码中性氨基酸转运蛋白SLC6A19的基因突变引起的。 nat Genet 36，1003-1007（2004）。 https://doi.org:10.1038/ng1406 7 Belanger，A。M.等。 抑制中性氨基酸转运以治疗苯酮尿症。 JCI Insight 3（2018）。 https://doi.org:10.1172/jci.insight.121762 8 Belanger，A。J.等。 在鸟氨酸经钙化酶缺乏的小鼠模型中，过量的氮和通过损失SLC6A19的存活增加。 遗传代谢疾病杂志N/A（2022）。 https://doi.org:https://doi.org/10.1002/jimd.12568 9 Jiang，Y。等。6 Seow，H。F.等。hartnup疾病是由编码中性氨基酸转运蛋白SLC6A19的基因突变引起的。nat Genet 36，1003-1007（2004）。https://doi.org:10.1038/ng1406 7 Belanger，A。M.等。 抑制中性氨基酸转运以治疗苯酮尿症。 JCI Insight 3（2018）。 https://doi.org:10.1172/jci.insight.121762 8 Belanger，A。J.等。 在鸟氨酸经钙化酶缺乏的小鼠模型中，过量的氮和通过损失SLC6A19的存活增加。 遗传代谢疾病杂志N/A（2022）。 https://doi.org:https://doi.org/10.1002/jimd.12568 9 Jiang，Y。等。https://doi.org:10.1038/ng1406 7 Belanger，A。M.等。抑制中性氨基酸转运以治疗苯酮尿症。JCI Insight 3（2018）。https://doi.org:10.1172/jci.insight.121762 8 Belanger，A。J.等。 在鸟氨酸经钙化酶缺乏的小鼠模型中，过量的氮和通过损失SLC6A19的存活增加。 遗传代谢疾病杂志N/A（2022）。 https://doi.org:https://doi.org/10.1002/jimd.12568 9 Jiang，Y。等。https://doi.org:10.1172/jci.insight.121762 8 Belanger，A。J.等。在鸟氨酸经钙化酶缺乏的小鼠模型中，过量的氮和通过损失SLC6A19的存活增加。遗传代谢疾病杂志N/A（2022）。https://doi.org:https://doi.org/10.1002/jimd.12568 9 Jiang，Y。等。https://doi.org:https://doi.org/10.1002/jimd.12568 9 Jiang，Y。等。缺乏中性氨基酸转运蛋白B（0）AT1（SLC6A19）的小鼠的FGF21和GLP-1水平升高并改善了血糖控制。MOL METAB 4，406-417（2015）。 https://doi.org:10.1016/j.molmet.2015.02.003 10 Yadav，A。等。 新型化学支架抑制中性氨基酸转运蛋白B（0）AT1（SLC6A19），这是治疗代谢疾病的潜在靶标。 前药11，140（2020）。 https://doi.org:10.3389/fphar.2020.00140MOL METAB 4，406-417（2015）。https://doi.org:10.1016/j.molmet.2015.02.003 10 Yadav，A。等。 新型化学支架抑制中性氨基酸转运蛋白B（0）AT1（SLC6A19），这是治疗代谢疾病的潜在靶标。 前药11，140（2020）。 https://doi.org:10.3389/fphar.2020.00140https://doi.org:10.1016/j.molmet.2015.02.003 10 Yadav，A。等。新型化学支架抑制中性氨基酸转运蛋白B（0）AT1（SLC6A19），这是治疗代谢疾病的潜在靶标。前药11，140（2020）。https://doi.org:10.3389/fphar.2020.00140https://doi.org:10.3389/fphar.2020.00140
GDPR对网络安全的影响：重点是美国和欧洲实践的审查 对供应链管理中当前技术的评估 Keystone物种：生物多样性与稳定的生态建筑师：评论 通过先进技术和正在进行的专业人士培训来促进医疗保健创新文化 使用SVM 的心脏病预测 AI供应链优化：美国和非洲趋势的比较审查 分子鉴定细菌（klebsiella aerogenes，p35235）从街头食品（炒饭）中分离出来；研究果汁的抗生素灵敏度模式和益生菌强化（fragaria ananassa，spasiflora ligularis和phyllanthus 铜绿假单胞菌对塑料的生物降解 鉴定与木偶（OGI/AKAMU）相关的细菌，并冷藏温度 利用AI在建筑环境中进行能源优化 分析木薯（Manihot esculenta crantz）DNA模式和过氧化物酶活性诱导水杨酸的抗性 对一些在尼日利亚卡诺（Gwale “智能”供应链的兴起：AI和自动化如何革新物流 基于Yolov8的多级交通标志检测方法
一般数据保护法规（GDPR）已成为一项具有里程碑意义的立法，重塑了数据隐私和网络安全的全球格局。在2018年5月执行，GDPR对全球组织产生了深远的影响，促使对网络安全实践进行了重新评估，以确保遵守严格的数据保护标准。本文对GDPR对网络安全的影响进行了全面综述，并特别强调了美国（美国）和欧洲采用的对比方法和实践。GDPR介绍了一组旨在保护个人的权利和隐私的强大原则，强调需要透明度，问责制和主动措施来保护个人数据。其域外范围将其影响扩大到欧洲边界之外，迫使全球业务遵守其法规。本文探讨了GDPR合规性带来的挑战和机遇，研究了美国和欧洲的组织如何导航不断发展的网络安全景观。在美国，在美国，在整个州的隐私法规都有不同的情况下，GDPR促使讨论有关联邦隐私法的制定。考虑到州和联邦法规之间在塑造网络安全策略中的相互作用，审查研究了美国企业采用的不同方法。相反，欧洲实践反映了对GDPR的积极反应，因为组织已经接受了规定中嵌入的原则以加强网络安全框架。本文调查了欧洲网络安全标准的发展，强调了成功的策略和潜在的改进领域。通过综合大西洋两岸的经验，这项综述有助于更深入地了解GDPR对网络安全的影响。它阐明了数据保护的不断发展的动态，为寻求增强其网络安全弹性的组织提供了见解，面对迅速变化的监管景观。
丁香假单胞菌和柔软腐烂的果皮细菌种群的比较丰度和多样性在整个Durance河流集水区中从其法国阿尔卑斯山到其delta
河流，小溪，溪流是在将源头与插座连接起来的土地覆盖物中发生的生物，化学和物理过程的集成商。在流域中人类和动物病原体的动态已在各种情况下进行了广泛研究，从而优化了疾病风险的降低。并行，有一种新兴的意识，即可能还可以通过地表水传播作物病原体，尤其是在用于灌溉时。但是，在整个过程中，没有关于潜在的植物病原体存在的程度 - 也没有关于其动态的程度。在这里，我们比较了假单胞菌（PSY）和软腐烂的果皮杆菌（SRP）种群的季节性动态，沿着Durance River的270公里，从上游高山河（Alpestream Alpine）到达了与Rhone河的下游农业生产区。在2016年和2017年秋季，冬季，春季和夏季在21个地点收集的168个样品中，在所有采样地点均检测到PSY菌株，在人口密度的156个样品中，在最高10 5细菌L -1的人口密度下都检测到PSY菌株。相比之下，在98个样品中检测到SRP菌株，主要来自河的南部，人口密度不超过3´10 4细菌L -1。在每个采样位点表征的生物学和化学参数中，温度是唯一解释了两个物种复合物种群大小的可变性的唯一因素。PSY密度随温度升高而降低，而SRP密度随温度升高而增加。SRP的河流种群主要由多功能胸膜杆菌和水生假子组成，它们的流行病学重要性鲜为人知。仅观察到少数几个因其流行病学影响而被称为其流行病学影响的果蝇菌株。相比之下，所有地点的PSY种群都是由从其他研究中以广泛宿主范围及其地理和栖息地无处不在的遗传谱系为主的。我们的观察结果表明，可以利用对SRP的河水进行监视来发出诊断和管理反应，以避免疾病爆发。相反，由于这组细菌，由于没有规则和广泛的疾病暴发，整个集水区的持续存在表明，监视应集中在土地使用，河水条件和农艺学实践的未来变化上，这些实践可能会破坏当前在检查中持Psy暴发的机制。
合成生物学工具包，用于微生物燃料电池中发电的新型假单胞菌的新物种
摘要：微生物燃料电池（MFC）为各种生物技术应用提供了可持续的解决方案，并且是生物技术研究的关键领域。MFC可以通过分解有机物并发电来有效治疗各种垃圾，例如废水和生物柴油废物。某些假单胞菌物种具有细胞外电子转移（EET）途径，使它们能够将电子从有机化合物转移到MFC阳极。此外，假单胞菌物种可以在低氧条件下生长，这是有利的，因为MFC中的电子转移过程通常会导致阳极处的氧气水平降低。这项研究的重点是评估与1 G.L - 1甘油生长的新假单胞菌接种的MFC，这是生物柴油生产的常见副产品。假单胞菌sp。BJA5的最大功率密度为39 mW.m -2。另外，观察到的伏安图和基因组分析表明，BJA5的新型氧化还原介质的潜在产生。此外，我们研究了该细菌作为合成生物学非模型底盘的潜力。通过测试各种遗传部分，包括构成启动子，使用PSEVA载体作为脚手架的复制起源和嘉戈斯，我们评估了细菌的适用性。总的来说，我们的发现提供了利用假单胞菌属的宝贵见解。bja5是MFC的新型底盘。合成生物学方法可以进一步增强该细菌在MFC中的性能，从而提供改进的途径。
假单胞菌假单胞菌CECT 5344
摘要氰化物降解细菌假单胞菌伪钙化素cect 5344使用氰化物和不同的金属 - 氰化物配合物作为唯一的氮源。在氰基疾病的条件下，该菌株能够随着高达100 m m的汞生长，该菌株被细胞内积累。通过液态色谱分析进行定量蛋白质组学分析（LC-MS/MS）已应用于氰化物和汞菌株菌株的排毒5344的氧化氧化物替代氧化氧化剂的相关性，并突出氧化剂替代氧化剂的相关性，以阐明氰化物和汞对分子的分子体。和氰化物的同化，独立于存在或不存在汞。蛋白质在存在氰化物和汞存在下过度占主张的蛋白质包括汞转运蛋白，汞还原酶MERA，转录调节剂Merd，砷酸盐再培养酶和砷耐药蛋白和砷氧化物蛋白，硫氧还蛋白还原酶还原酶，谷胱甘肽s-转移蛋白与硫酸硫酸硫酸盐的硫酸盐和硫酸硫酸盐和硫酸硫酸盐和硫酸盐的硫酸盐和硫酸盐含量。和磷酸盐饥饿诱导的蛋白质phOH等。一项转换研究表明，从菌株CECT 5344基因组中存在的六个推定的MERR基因中，可能与汞耐药性/排毒抗性有关，只有MERR2基因在Cyanotrophic Condi-Condi-Coni-Coni-Condi-Coni-Coni-Condi-Conti-Diens下才有明显的诱导。A bioinformatic analysis allowed the identi fi cation of putative MerR2 binding sites in the promoter regions of the regulatory genes merR5 , merR6 , arsR , and phoR , and also upstream from the structural genes encoding glutathione S -transferase ( fosA and yghU ), dithiol oxidoreductase ( dsbA ), metal resistance chaperone ( cpxP ），以及参与法规传感（Vird）等的氨基酸/肽挤出机。
一种基于 SEVA、CRISPR-Cas3 辅助的假单胞菌基因组工程方法，可实现载体高效消除
。CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可，根据 提供（未经同行评审认证）是作者/资助者，他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。它是此预印本的版权持有者此版本于 2023 年 6 月 29 日发布。；https://doi.org/10.1101/2023.06.29.547033 doi：bioRxiv 预印本
mRNA 疫苗可诱导针对铜绿假单胞菌 III 型分泌性毒力的保护性免疫
（未经同行评审认证）是作者/资助者。保留所有权利。未经许可不得重复使用。此预印本的版权所有者此版本于 2023 年 6 月 10 日发布。；https://doi.org/10.1101/2023.06.09.544431 doi：bioRxiv preprint