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World File Search System原虫
通过白盒、灰盒和黑盒建模方法识别代谢途径中的通量检查点
代谢途径建模在药物设计中发挥着越来越重要的作用，因为它可以让我们更好地了解生物体代谢中潜在的调控和控制网络。然而，尽管该领域取得了快速进展，但途径建模对研究人员来说可能成为一场真正的噩梦，尤其是在实验数据很少或途径高度复杂的情况下。在这里，开发了三种不同的方法来模拟溶组织阿米巴原虫糖酵解的第二部分作为应用示例，并成功预测了最终的途径通量：一种包括详细的动力学信息（白框），另一种添加了调整项（灰框），最后一种使用人工神经网络方法（黑框）。之后，每个模型都用于代谢控制分析和通量控制系数确定。该途径的前两种酶被确定为在通量控制中发挥作用的关键酶。这项研究揭示了这三种方法对于在代谢途径建模领域根据现有数据构建合适模型的重要意义，对生物学家和建模者都有用。
DFT 研究 - RSC 出版
替硝唑(TNZ，化学结构式见图1)是第二代硝基咪唑类抗生素1，具有抗菌、抗炎作用，被广泛应用于防治阿米巴原虫、阴道滴虫、贾第鞭毛虫病等感染，也在畜牧业和水产养殖业中用作生长促进剂。2～4然而，随着替硝唑的广泛使用和缺乏适当的监管，环境问题进一步加剧，在一些污水处理厂和淡水系统中被检测到了替硝唑的存在。5残留在水中的替硝唑，即使是低浓度的，也会对人类和环境造成长期的潜在威胁。6因此，如何有效地从环境中去除替硝唑是一个亟待解决的问题。相对于替硝唑降解的研究，其他硝基咪唑的降解方法较多，如吸附、生物降解、Fenton法、光催化等。吸附法广泛应用于有机废水的处理，例如moral-Rodriguez的工作表明，罗硝唑(RNZ)可以通过p-p相互作用吸附在颗粒活性炭(GAC)上。7但这种方法并不能真正去除污染物，只是将污染物从水相转移到固相。8生物方法是另一种常用的方法，但一般比较耗时，
在人畜共患性皮肤利什曼病的流行病区域中的流行病学研究伊朗
这项研究是在1991 - 92年在伊斯法罕市以北的一个乡村地区的Borkhar的12个月内在伊朗伊斯兰共和国中部进行的。目的是确定利什曼病的自然储层宿主的生态，以实现利什曼原虫疫苗的未来现场试验。该地区的主要储层主机是菱形Opimus，Great Gerbil，其次是Meriones Libycus，Libyan Jird和Hemiechinus Auritis，Longeared Hedgehog。在Borkhar地区检查的179个小型哺乳动物中，绝大多数是R. Opimus（82.1％），然后是M. Libycus（15.7％）和最后一h. Auritis（2.2％）。R. opimus的最高感染率为9月（90.5％），在不同村庄的率在22.2％和80.4％之间。M. libycus的平均感染率为17.9％。这些啮齿动物可能是储层宿主在该地区人畜共患病的流行病学中起重要作用。十六只家养犬和流浪狗似乎未感染，因为检查没有活跃的病变或疤痕。
推出 CRISPR/Cas9 胞嘧啶碱基编辑器工具箱“LeishBASEedit”——无需 DNA 双链断裂、同源重组或供体 DNA 即可对利什曼原虫进行基因编辑和高通量筛选
。CC-BY-NC 4.0 国际许可证永久有效。它是在预印本（未经同行评审认证）下提供的，作者/资助者已授予 bioRxiv 许可，可以在该版本中显示预印本。此版本的版权持有者于 2022 年 12 月 8 日发布。；https://doi.org/10.1101/2022.12.08.519658 doi：bioRxiv 预印本
糖酵解和糖体中的蛋白质易位...
摘要。锥虫会引起被忽视的热带疾病，本综述讨论了针对糖酵解和糖体内部蛋白质易位作为治疗这些感染的策略的潜力。不同的研究表明，糖酵解是克氏锥虫、布氏锥虫和利什曼原虫等寄生虫的主要能量来源，它们的糖酵解酶与人类糖酵解酶有很大不同，为选择性药物开发提供了机会。抑制糖酵解可导致寄生虫大量死亡，因为即使部分阻断该途径也会破坏三磷酸腺苷的产生，而三磷酸腺苷对于寄生虫的生存至关重要。本综述还研究了跨糖体膜的蛋白质易位机制，特别是过氧化物酶的关键作用；糖体蛋白的错误定位会对寄生虫的生存产生不利影响。了解蛋白质输入的机制和糖体酶的独特特性可以促进针对这些特定目标的合理药物设计。总体而言，本综述强调需要创新的治疗方法来有效应对锥虫病带来的挑战，并主张进一步研究这些寄生虫的代谢脆弱性，以开发有针对性的有效治疗方法。
N-乙酰转移酶10的功能表征（...
167 168图1。L.（L。）墨西哥具有保存良好的NAT10同源物。A.在人类，墨西哥L.和S. cerevisiae中分布169个Nat10域。所有三个物种共享Nat10酶功能的170个必需域：TMCA，解旋酶，GNAT和TRNA。每个域上方的数字171表示每个域内氨基酸的起点和末端位置。172不同利什曼原虫物种和酿酒酵母之间Nat10的序列身份约为173，约为36％，而L.（L。）墨西哥和人类Nat10之间的身份为39.4％。174 L.（L。）墨西哥的GNAT结构域分别显示为43.86％和46.43％的序列身份，分别与175个酿酒酵母和人类中的175个相应域。B.预测了L.（L。）墨西哥，酿酒酵母的176 Nat10蛋白的3D结构，以及人类突出了GNAT（蓝色），177个TRNA结合（红色），TMCA（紫色）和解旋酶（绿色）（绿色）领域，表明L.（L.）178墨西哥蛋白质具有高度的水平。179 C. GNAT结构域的结构覆盖层显示了三种蛋白质中的高度结构保护180，进一步说明了该关键功能域中的相似性。181 182
心脏、肝脏和皮下包虫囊活检期间发生过敏反应
患者在镇痛和局部麻醉下接受了背部病变活检。然而，在活检过程中，患者出现了过敏反应，随后心肺骤停。患者每 15 分钟接受 80 毫克甲基强的松龙和 0.3 毫克盐酸肾上腺素注射。此外，患者还接受了经口气管插管和心脏按摩。值得庆幸的是，急救队成功稳定了患者，随后的超声心动图检查发现了一个大的包虫囊肿。超声心动图检查发现患者的收缩功能正常。MRI 和计算机断层扫描 (CT) 图像在室间隔和左肝叶中检测到包虫囊肿病变（图 2）。此外，从肩胛区抽取的液体被送去进行细胞学和病理学检查。包虫囊肿间接血凝试验（棘球绦虫抗体）结果为 1/640 阳性。包虫血清学检查呈阳性，基于酶联免疫吸附试验 (ELISA) 的细粒棘球绦虫免疫球蛋白 (IgG) 抗体定性评估证实了包虫病的诊断。开始抗原虫药物治疗。患者病情稳定后，被转诊至三级心脏中心，安装心脏起搏器治疗完全性房室传导阻滞。患者父母和/或法定监护人已获得书面知情同意书。
以蛋白质脂化为靶点研发利什曼病药物
摘要 利什曼病是由利什曼属的多种专性细胞内原生动物引起的传染病，其疾病表现为皮肤、粘膜和内脏形式。尽管利什曼病在 80 多个国家流行，并且是高发病率和死亡率的原因，但它仍然是一种被忽视的热带疾病。化疗是一线治疗方法，但目前使用的药物存在毒性副作用、给药困难和治疗时间延长的问题——此外，耐药性正在出现。新的抗利什曼病药物是公认的国际优先事项。在这里，我们回顾了对 N-肉豆蔻酰转移酶 (NMT) 作为潜在药物靶点的研究。NMT 催化 C 14 脂肪酸从肉豆蔻酰辅酶 A 到真核细胞中大量蛋白质的 N 端甘氨酸残基的共翻译转移。这种共价修饰影响底物蛋白与脂质和伴侣蛋白的稳定性和相互作用。针对杜氏利什曼原虫 NMT 的高通量筛选活动产生的新先导化合物的结构指导开发导致了强效抑制剂的发现，这些抑制剂被用于深入了解蛋白质肉豆蔻酰化在这些寄生虫中的作用，并验证 NMT 作为药物靶点。
一开始就进行全编辑
锥虫原生动物参与一些奇怪的生物化学过程，最奇怪的莫过于 RNA 编辑。在这些生物（例如短膜虫、利什曼原虫和锥虫）的线粒体中，蛋白质编码转录本通过位点特异性删除某些基因组编码的尿苷残基并添加其他非编码的 U 而发生改变（参考文献 1）。该过程重新定制初始初级转录本（“预编辑 RNA”），以使最终产品指定完整的功能性蛋白质。除了对预编辑 RNA 的特定区域进行局部编辑（5'-编辑）之外，锥虫还进行一种引人注目的“泛编辑”，在某些情况下，这种编辑可占信使 RNA 成熟序列的 50% 或更多 1 。在本期第 345 页 2 ，Maslov 等人提出的证据表明，与人们的预期相反，泛编辑是锥虫谱系中的古老特性，而非最近获得的特性。RNA编辑系统的进化（它们如何出现以及为何持续存在）是进化生物学中的一个挑战性问题 3 。迄今为止，U添加/删除编辑仅在线粒体中发现，并且仅存在于动基体目（包括锥虫、博多虫和相关的隐虫）中。然而，其他类型的线粒体 mRNA 编辑也已被记录 4 ，以及线粒体转移 RNA S- 7 和核糖体 RNA 8 的编辑。这些系统的多样性和机制独特性，再加上它们的高度受限发生，强烈表明它们中的大多数（如果不是全部）都是最近在进化中获得的特性 3 。
抑制脂肪酸氧化作为治疗原发性阿米巴脑膜脑炎的新靶点
摘要 原发性阿米巴脑膜脑炎 (PAM) 是一种由自由生活的阿米巴原虫 Naegleria 引起的迅速致命的感染。阿米巴沿着大脑神经迁移到大脑，导致癫痫、昏迷并最终导致死亡。先前的研究表明，N. fowleri 的近亲 Naegleria gruberi 更喜欢将脂质而不是葡萄糖作为能量来源。因此，我们测试了几种已经批准的脂肪酸氧化抑制剂以及目前使用的药物两性霉素 B 和米替福新。我们的数据表明，乙莫克舍、奥利司他、哌克昔林、硫利达嗪和丙戊酸可抑制 N. gruberi 的生长。然后我们在 N. fowleri 上测试了这些化合物，发现乙莫克舍、哌克昔林和硫利达嗪是有效的生长抑制剂。因此，脂质不仅是N. gruberi 的首选食物来源，而且脂肪酸的氧化似乎对N. fowleri 的生长也至关重要。抑制脂肪酸氧化可能带来新的治疗选择，因为硫利达嗪可以在感染部位达到的浓度下抑制N. fowleri 的生长。它还可以增强目前使用的治疗方法，因为棋盘分析显示米替福新和乙莫克舍之间存在协同作用。应进行动物试验以确认这些抑制剂的附加值。虽然针对这种罕见疾病开发新药和进行随机对照试验几乎是不可能的，但抑制脂肪酸氧化似乎是一种有前途的策略，因为我们展示了几种正在或曾经使用的药物的有效性，因此将来可以重新用于治疗 PAM。