科学的底部拖网调查是沿着大陆货架和海洋和海洋的斜坡进行的生态观察计划,这些计划采样了与海底相关的海洋社区。这些调查报告了时空的发生,丰度和/或体重的发生,并有助于渔业管理以及人口和生物多样性研究。底部拖网调查是在世界各地进行的,代表了了解海洋生物地理,宏观生态学和全球变化的独特机会。但是,将这些数据结合在一起以进行跨生态系统分析仍然具有挑战性。在这里,我们提供了一个综合数据集,该数据集由29个公开可获得的底段调查,在18个国家/地区的国家水域进行了标准化和预处理,总共涵盖了2,170个采样的鱼类分类单元,并从1963年至2021年收集了216,548次拖船。我们描述了创建数据集,标志和标准化方法的处理步骤,我们开发了这些方法,以帮助用户使用稳定的区域调查足迹进行时空分析。该数据集的目的是在全球变化的背景下支持研究,海洋保护和管理。
结果:测序分析发现了异质性变异,尤其是 NF2,这是间皮癌发生的关键肿瘤抑制基因。亚克隆肿瘤群在配对活检中是共有的,表明肿瘤是多克隆播散的。转录组分析突出了细胞粘附和细胞外基质通路的失调,这与解剖部位之间组织分子梯度比例的变化有关。甲基化组分析揭示了两名患者的表观遗传机制的作用。最后,观察到免疫介质和与免疫突触相关的基因表达的显著变化,以及肿瘤环境中免疫群体的差异浸润,并导致三名患者的免疫特征从热转变为冷。
家族性高胆固醇血症(FH)的基因研究。调查包括两个阶段:1)卡罗琳斯卡 FH 面板,这是一种 SNP 面板测试,使用 Agena MassARRAY 系统和 iPLEX Gold 化学方法(根据 SWEDAC 的 ISO/IEC 17025 认证)分析三个最重要的 FH 基因中已知的 119 个突变和缺失。 2) 使用卡罗琳斯卡 FH 面板未发现突变的样本将使用 Devyser 的 FH v2 扩增子测序方法和 Illumina 的 NextSeq 仪器进行进一步分析。根据样本类型选择分析:血液、纯化 DNA 或唾液。
在科学和工程中的许多任务中,目标是从从已知的前向模型中收集的少量嘈杂测量值中推断出未知的图像,描述了某些传感或成像模式。由于资源限制,此图像重建任务通常是极度不良的,因此需要采用表达性的先验信息以正行解决方案空间。基于得分的扩散模型,由于其令人印象深刻的经验成功,已成为图像重建中表现出的先验的吸引人的候选人。为了立即适应各种任务,开发有效,一致和健壮的算法非常有趣,这些算法将图像先验分布的无条件得分函数与远期模型的灵活选择结合在一起。这项工作开发了一种算法框架,用于在与一般正向模型的非线性反问题中使用基于得分的扩散模型作为当前数据。是由成像社区中的插件和播放框架激励的,我们引入了一种扩散的插件方法(DPNP),该方法替代称为两个采样器,这是一个仅基于远期模型的可能性函数,并且是基于远期的扩散采样者的近端一致性采样器,并基于远期模型的函数。关键见解是,在白色高斯噪声下进行降解可以通过随机(即DDPM型)和确定性(即DDIM型)采样器使用相同的分数函数进行训练。代码可在https://github.com/x1xu/diffusion-plug-and-play上找到。我们同时建立了DPNP的渐近性和非质子性能保证,并提供了数值实验,以说明其在解决线性和非线性图像重建任务方面的希望。据我们所知,DPNP是使用无条件扩散先验的非线性反问题的第一种可证明的后验抽样方法。据我们所知,DPNP是使用无条件扩散先验的非线性反问题的第一种可证明的后验抽样方法。
1 KBR,Inc,NASA AMES研究中心,加利福尼亚州莫菲特菲尔德,美国2材料科学部,劳伦斯·伯克利国家实验室,加利福尼亚州伯克利,加利福尼亚州94720,美国3美国3号物理学系美国伯克利,94720,美国5材料科学与工程系,斯坦福大学,斯坦福大学,加利福尼亚州斯坦福大学94305,美国6斯坦福大学材料与能源科学研究所,SLAC国家加速器实验室,加利福尼亚州Menlo Park,加利福尼亚州Menlo Park,94025,美国7机械工程和材料科学系,纽约大学,纽约大学,纽约市765111111111。 OX1 3PJ,英国9 Kavli Energy Nanoscience Institute,位于伯克利,伯克利94720,美国
缓冲肽水(BPW) - 缓冲肽水是一种可从食物分离沙门氏菌的富集培养基。在许多食物过程中,沙门氏菌和其他物种可能会因涉及热,干燥,防腐剂,pH变化或渗透压力转移的过程而受到亚致死性损伤。bpw已被证明可以促进应力细胞的复苏,并在ISO 18593(食物链的微生物学 - 水平采样方法)中建议作为湿溶液采样装置,以从表面回收微生物。