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World File Search System变体
使用ACEOFBases Target预测对DNA变体进行DNA变体的精确体内功能分析
。cc-by 4.0国际许可证（未经同行评审证明）获得的是作者/资助者，他已授予Biorxiv授予Biorxiv的许可，以永久显示预印本。这是该版本的版权所有，该版本于2021年7月26日发布。 https://doi.org/10.1101/2021.07.26.453883 doi：biorxiv preprint
SARS-CoV-2-变体转变动力学与...相关
为了探索这一假设并描述全球变异转换速度、时间和幅度的异质性，我们对 2020 年 10 月至 2023 年 1 月中旬报告给全球流感数据共享倡议 (GISAID) 的 1400 多万个 SARS-CoV-2 序列进行了回顾性分析。12 我们使用多项回归样条模型来估计和总结 230 个国家和次国家区域以及 16 个 SARS-CoV-2 变异波的变异转换动态，包括最近出现的 Omicron 亚谱系 BA.2.75、XBB.1/XBB 和 BQ.1。10 我们的结果表明不同地点之间变异转换存在很大的异质性。对于 Omicron，我们根据地理位置的变异行为对其进行聚类，从而让我们能够识别具有相似转换动态的地点组。然后，我们利用临床和人口统计数据来探索变异波的特性与随时间变化的因素之间的关系，包括人口的疫苗接种状况、政府政策和竞争中的变异数量。这项研究证明了新出现的变异行为与人口的免疫学和人口背景之间的关联。此外，这项研究代表了迄今为止全球范围内对 SARS-CoV-2 变异转变的最全面描述。
1 WHO SARS-COV-2变体的标签风险评估...
2025年2月3日的LP.8.1的初始风险评估是SARS-COV-2变体，源自JN.1 Descendent sineage kp.1.1.3，最早收集的样本于2024年7月1日。lp.8.1是WHO追踪的七个vum之一，并于2025年1月24日被指定为VUM [1,2]。与最新且当前主要的SARS-COV-2变体KP.3.1.1和XEC相比，LP.8.1具有以下其他峰值突变：S31-（仅XEC仅XEC），F186L，R190S，R190S，R346T，R346T，V445R和K1086R。V445R突变已显示可增强与HACE2的结合亲和力，从而有可能增加变体的传播性[3]。另外，使用伪病毒，LP.8.1显示出与XEC相当的强体弹性弹性，有效地通过广泛的抗体进行了中和，包括一些3类单克隆抗体[3]。由于XEC已被证明有限从JN.1或KP.2 mRNA增强疫苗[4-6]的免疫逃逸[4-6]，预计LP.8.1将在与这些疫苗的免疫反应中具有相似的免疫反应水平。
关于注册疫苗的变体申请的指南
SCOPE ................................................................................................................................ 2
附录ERG变体研究网络
补充图3。生殖线ERG（P.Y373C）变体的保护和作用。（a）P.Y373C变体映射在ERG蛋白上（NM_182914）。（b）在跨物种的人类ETS转录因子和直系同源ERG蛋白的P.Y373C变体周围的氨基酸保存。（c）ERG P.Y373C变体对DNA结合的预测影响。预测极地接触（溶剂排除的氢键）（红线）和由于诱变引起的预测极性接触破坏（灰色虚线）。3D蛋白质建模在ERG-DNA X射线晶体学模型（PDB ID：6VGE A链中）进行，该模型从Uniprot Online数据库中获得。Pymol用于可视化P.Y373C的预测结构影响。（d）P.Y373C VAF与血小板计数的比较。液滴数字PCR用于确定来自族的1个成员的VAF（I-1，I-2，II-1，II-2）（表1-患者15、16、17）在显示的时间点上样本，还绘制了相应时间点的血小板计数。单核细胞（MNC），骨髓（BM），间充质基质细胞（MSC）。
SARS-COV-2变体LF.7.2.1，NP.1和LP.8.1
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证。是根据作者/资助者提供的预印本（未经同行评审认证）提供的，他已授予Biorxiv的许可证，以在2024年12月27日发布的此版本中显示此版本的版权持有人。 https://doi.org/10.1101/2024.12.27.630350 doi：Biorxiv Preprint
FOX（VOX变体）和Prov数字签名
使用s，t和陷阱门发现了对等式pub（x）= h（m）的解决方案σ，然后σ是m的签名。i要验证签名（m，σ），验证pub（σ）和h（m）相等。i Fox除了普通UOV外，还使用了两种特定技术。
reev：审查，评估和解释变体
1柏林卫生研究院，核心单位生物信息学，柏林，德国2医学遗传学和人类遗传学研究所，Charité-柏林大学医学中心，柏林大学医学中心，柏林自由大学柏林和汉堡大学，柏林，柏林，德国柏林3生物医学创新学院Charité的健康 - 柏林大学医学中心，德国，4 RG发展与疾病，Max Planck分子遗传研究所，柏林，德国，德国5柏林卫生研究院，柏林，柏林，德国卫生研究院，BIH卫生研究院，柏林柏林，德国，基因组统计学和Bionymictistics，Bionany德国波恩大学医院医院8 BIH生物医学创新学院，数字临床科学家计划，柏林卫生研究院，Charité-德国柏林柏林大学医学中心9 MaxDelbrück分子医学中心，柏林，德国柏林，德国，德国，
第一个是 egfr 基因组变体（gdna）...
随着精准肿瘤学中分子诊断领域的不断扩大，迫切需要制定国际标准 (IS) 来协调癌症生物标志物的测量和新技术的实施。使用数字 PCR (dPCR) 和下一代测序 (NGS) 准确检测基因组变异是精准癌症医学的重要组成部分。正确表征临床样本中体细胞单核苷酸变异 (SNV) 和插入/缺失的变异等位基因部分 (VAF) 对治疗决策有重大影响。本报告描述了一项多中心合作研究的结果，该研究评估了三种候选材料协调三种临床相关表皮生长因子受体 (EGFR) 变异测量的能力。候选材料来自基因编辑的癌细胞系，每种材料都含有三种众所周知的 EGFR 变体之一（两种驱动变体和一种抗性变体）：EGFR T790M (c.2369C>T)（候选 1；NIBSC 代码 20/194）、EGFR L858R (2573T>G)（候选 2；NIBSC 代码 20/198）和 E746_A750del (c.2235_2249del)（候选 3；NIBSC 代码 20/194）。参与者使用他们常规建立的方法评估了这些材料。总共有 10 个实验室从 4 种方法中返回了 34 个数据集，包括基于 dPCR 和 NGS 的内部和商业分析。两个实验室评估了未稀释的材料，其他实验室评估了各种稀释度的每种材料，以确定它们是否适用于各种变体水平的检测验证或二级标准校准。参与者被要求报告这三种变体的数据，以及这三种材料的任何其他序列变体数据。所有结果均以定量方式报告，以便为每种材料分配共识值。本研究的结论表明，这三种材料都适合用作校准这三种变体的国际标准，并且在 NGS 和 dPCR 中经过验证，VAF 为 100%。此外，这三种候选材料适合稀释以获得较低的 VAF 值。建议：
工程乳腺癌模型中的变体
1。Philippa D. Darbre，内分泌干扰化学物质的历史，当前的内分泌和代谢研究中的意见，第7卷，2019年，第26-33页，第2页。Prueitt RL，Hixon ML，Fan T，Olgun NS，Piatos P，Zhou J，Goodman JE。对人类双酚A潜在的致癌性的系统回顾。调节毒素Pharmacol。2023 Aug; 142：105414。3。Khan，N.G.，Correia，J.，Adiga，D。等。 对双酚A的致癌潜力的全面综述：线索和证据。 Environ Sci Pollut Res 28，19643–19663（2021）。 4。 sidali A，Teotia V，Solaiman NS，Bashir N，Kanagaraj R，Murphy JJ，Surendranath K. Au-Au-Au-Au-au-au-au-au-au元素RNA结合蛋白：文字后调节和基因组完整性的十字路口。 int J Mol Sci。 2021 12月22日; 23（1）：96。 doi：10.3390/ijms23010096。 PMID：35008519; PMCID：PMC8744917。 5。 Murphy JJ，Surendranath K，Kanagaraj R. RNA结合蛋白及其在癌症中的新作用：超越冰山一角。 int J Mol Sci。 2023 Jun 1; 24（11）：9612。 doi：10.3390/ijms24119612。 PMID：37298567; PMCID：PMC10253441Khan，N.G.，Correia，J.，Adiga，D。等。对双酚A的致癌潜力的全面综述：线索和证据。Environ Sci Pollut Res 28，19643–19663（2021）。4。sidali A，Teotia V，Solaiman NS，Bashir N，Kanagaraj R，Murphy JJ，Surendranath K. Au-Au-Au-Au-au-au-au-au-au元素RNA结合蛋白：文字后调节和基因组完整性的十字路口。int J Mol Sci。2021 12月22日; 23（1）：96。 doi：10.3390/ijms23010096。PMID：35008519; PMCID：PMC8744917。 5。 Murphy JJ，Surendranath K，Kanagaraj R. RNA结合蛋白及其在癌症中的新作用：超越冰山一角。 int J Mol Sci。 2023 Jun 1; 24（11）：9612。 doi：10.3390/ijms24119612。 PMID：37298567; PMCID：PMC10253441PMID：35008519; PMCID：PMC8744917。5。Murphy JJ，Surendranath K，Kanagaraj R. RNA结合蛋白及其在癌症中的新作用：超越冰山一角。int J Mol Sci。2023 Jun 1; 24（11）：9612。 doi：10.3390/ijms24119612。PMID：37298567; PMCID：PMC10253441