Motu Profiler或Short Motus是一种软件工具,可以从分类学组成,代谢活性成员的丰富性以及菌株群体的多样性方面对微生物群落的生产。为此,它维护了单拷贝系统发育标记基因序列的数据库,该数据库被用作参考,简短读取的元基因组和元文字读数被映射为识别和定量微生物分类群。在这里,我们描述了两个基本协议中最常见的MOTU剖面用例。其他支持协议提供有关其安装和深入指南的信息,以调整其设置,以增加或降低检测和量化分类单元的严格度,以及用于自定义输出文件格式。提供了解释分析结果的指南,以及有关独特功能,方法学细节和工具的开发历史的其他信息。©2021作者。Wiley Perigonicals LLC发布的当前协议。
截至周一,全岛共有 208 例新冠肺炎活跃病例:圣克罗伊岛 138 例,圣托马斯岛 55 例,圣约翰岛 20 例。全岛七天阳性率为 12.4%。此外,圣克罗伊岛路易斯医院有两名新冠肺炎患者住院,施耐德地区医疗中心有四名患者住院。
逆转录病毒将其基因组插入细胞的 DNA 中,有时是产生宿主生物后代的生殖系细胞:这种病毒被称为内源性逆转录病毒 (ERV)。人类基因组包含多种古代 ERV 的遗迹。一些遗迹贡献了新的基因和调控元件。这项研究在经过深入研究的人类基因组版本 hg38 中发现了更多种类的古代 ERV:ERV-Hako、ERV-Saru、ERV-Hou、ERV-Han 和 ERV-Goku。它还发现了许多 ERV-V 的遗迹,之前所知的 ERV-V 仅在 19 号染色体上的两个带有胎盘基因的副本中发现。它发现了一种两侧是 MER41E 长末端重复序列 (LTR) 的 ERV,与已知的 MER41 ERV 惊人地相似。 ERV-Hako 具有包含来自宿主基因 SUSD6 和 SPHKAP 的序列的亚型:SUSD6 变体在狭鼻目和阔鼻目灵长类动物之间转移。逆转录病毒使用 tRNA 来引发逆转录:根据基因组 tRNA 数据库,Hako 是唯一使用 tRNA-Trp(色氨酸,符号 W)的人类 ERV 遗迹,而 HERV-W 因使用 tRNA-Arg 而得名。一种 ERV-Saru LTR 是先前描述的先天免疫中 AIM2 的增强子。这项研究有助于了解灵长类动物 ERV 的历史,但也表明相关的 ERV 可能存在巨大差异,这对在基因组中清晰注释所有 ERV 遗迹的目标提出了挑战。
我们介绍了VARM,va riant r Elationship m atcher策略,以识别电子商务目录中的一对变体产品。实体解决方案的传统定义与产品提及是否是指相同的基础产品。但是,这未能捕获对电子商务应用程序至关重要的产品关系,例如在同一网页上列出的相似但不相同的产品或共享评论。在这里,我们制定了一种在变体产品关系中的新型实体分辨率,以捕获这些相似的电子商务产品链接。与传统的定义相反,新定义既需要识别两个产品是彼此的变体匹配,以及它们之间有什么变化的属性。为了满足这两个要求,我们制定了一种利用编码和生成AI模型的优势的策略。首先,我们构建了一个捕获网页产品链接的数据集,并因此构建了产品关系,以训练编码LLM以预测任何给定的产品的变体匹配。第二,我们使用抹布提示了一代LLM,以在变体产品组之间提取变异和共同属性。为了验证我们的战略,我们使用世界领先的电子商务零售商之一的真实数据评估了模型性能。结果表明,我们的策略超出了替代解决方案,并为利用这些新型产品关系的方式铺平了道路。
$这些作者同样贡献了隶属关系:1阿尔茨海默氏症和神经退行性疾病中心,德克萨斯州西南医学中心(UTSW),美国德克萨斯州达拉斯市,彼得·奥唐纳尔(Peter O'Donnell Jr)生物物理学系,彼得·奥唐纳尔(Peter O'Donnell Jr)脑研究所。2美国德克萨斯州西南医学中心(UTSW)病理学系,美国德克萨斯州达拉斯。 3美国德克萨斯州达拉斯市西南医学中心(UTSW)眼科科科学系。 4美国印第安纳波利斯印第安纳大学医学院病理学和实验室医学系。 *与:Lorena SaelicesGómez,Lorena.saelicesgomez@utsouthwestern.edu摘要:ATTR淀粉样变性是一种表型异质性疾病,其特征在于以淀粉样蛋白纤维纤维形式进入各种甲状腺素的形式,以经thy蛋白的病理沉积为特征。 ATTR淀粉样变性可能源于变异(ATTRV)淀粉样变性的突变或野生型(ATTRWT)淀粉样变性的衰老。 Attrwt通常表现为心肌病表型,而ATTRV可能以多神经病,心肌病或混合呈现,以及许多其他来自次要器官参与的症状。 已经鉴定出了超过130种不同的转化素突变变异,其中许多与特定疾病症状有关。 然而,这些突变在差异疾病表现中的作用仍然难以捉摸。 使用冷冻电子显微镜,我们从结构上表征了来自载有V122 ∆突变的Attrv患者的纤维,主要与多层病变相关。 我们的结果表明,这些原纤维是多态性的,既表现为单丝和双丝丝。2美国德克萨斯州西南医学中心(UTSW)病理学系,美国德克萨斯州达拉斯。3美国德克萨斯州达拉斯市西南医学中心(UTSW)眼科科科学系。 4美国印第安纳波利斯印第安纳大学医学院病理学和实验室医学系。 *与:Lorena SaelicesGómez,Lorena.saelicesgomez@utsouthwestern.edu摘要:ATTR淀粉样变性是一种表型异质性疾病,其特征在于以淀粉样蛋白纤维纤维形式进入各种甲状腺素的形式,以经thy蛋白的病理沉积为特征。 ATTR淀粉样变性可能源于变异(ATTRV)淀粉样变性的突变或野生型(ATTRWT)淀粉样变性的衰老。 Attrwt通常表现为心肌病表型,而ATTRV可能以多神经病,心肌病或混合呈现,以及许多其他来自次要器官参与的症状。 已经鉴定出了超过130种不同的转化素突变变异,其中许多与特定疾病症状有关。 然而,这些突变在差异疾病表现中的作用仍然难以捉摸。 使用冷冻电子显微镜,我们从结构上表征了来自载有V122 ∆突变的Attrv患者的纤维,主要与多层病变相关。 我们的结果表明,这些原纤维是多态性的,既表现为单丝和双丝丝。3美国德克萨斯州达拉斯市西南医学中心(UTSW)眼科科科学系。4美国印第安纳波利斯印第安纳大学医学院病理学和实验室医学系。*与:Lorena SaelicesGómez,Lorena.saelicesgomez@utsouthwestern.edu摘要:ATTR淀粉样变性是一种表型异质性疾病,其特征在于以淀粉样蛋白纤维纤维形式进入各种甲状腺素的形式,以经thy蛋白的病理沉积为特征。ATTR淀粉样变性可能源于变异(ATTRV)淀粉样变性的突变或野生型(ATTRWT)淀粉样变性的衰老。Attrwt通常表现为心肌病表型,而ATTRV可能以多神经病,心肌病或混合呈现,以及许多其他来自次要器官参与的症状。已经鉴定出了超过130种不同的转化素突变变异,其中许多与特定疾病症状有关。然而,这些突变在差异疾病表现中的作用仍然难以捉摸。使用冷冻电子显微镜,我们从结构上表征了来自载有V122 ∆突变的Attrv患者的纤维,主要与多层病变相关。我们的结果表明,这些原纤维是多态性的,既表现为单丝和双丝丝。我们的研究暗示了导致ATTR淀粉样变性的表型变异的结构联系,因为attrifirils的多态性可能在主要多神经性表型的患者中表现出来。
HAL 是一个多学科开放存取档案库,用于存放和传播科学研究文献,无论这些文献是否已出版。这些文献可能来自法国或国外的教学和研究机构,也可能来自公共或私人研究中心。
6 沙迦大学医学院家庭与社区医学系,阿拉伯联合酋长国沙迦,7 沙迦大学沙迦医学研究所,阿拉伯联合酋长国沙迦,8 努拉·宾特·阿卜杜勒拉赫曼公主大学医学院基础医学系,沙特阿拉伯利雅得,9 沙特国王大学医学城内科系传染病科,沙特阿拉伯利雅得,10 努拉·宾特·阿卜杜勒拉赫曼公主大学医学院临床科学系,沙特阿拉伯利雅得,11 印度孟买 Lilavati 医院与研究中心儿科系儿科重症监护科,12 沙迦大学医学院临床科学系,阿拉伯联合酋长国沙迦,13 艾斯尤特大学医学院儿科系,埃及艾斯尤特,14 传染病科加拿大安大略省渥太华大学医学院疾病科,15 沙特阿拉伯利雅得卫生部和费萨尔大学沙特国王医疗城科,16 美国佐治亚州亚特兰大埃默里大学休伯特全球健康系,17 沙特阿拉伯宰赫兰约翰霍普金斯阿美医疗保健中心专科内科和质量部,18 美国印第安纳州印第安纳波利斯印第安纳大学医学院医学系传染病科,19 美国马里兰州巴尔的摩约翰霍普金斯大学医学院医学系传染病科
Alan Brinkley、Dan Carter、Lance Conn、Barry Cushman、Matt Dillard、John Hart Ely、Jon Entin、David Garrow、Paul Gaston、Sam Issacharoff、John Jeffries、Walter Kamiat、Pam Karlan、Herbert Klarman、Hal Krent、Chuck McCurdy、Neil McMillen、Dan Ortiz、Gerald Rosenberg、Jim Ryan、Reuel Schiller、Bruce Schulman、Bill Stuntz、David Thelen、J.Mills Thornton III、Mark Tushnet 和 Ted White,以及凯斯西储大学法学院和弗吉尼亚大学历史系教师研讨会的参与者和《美国历史杂志》的两位匿名读者。WijdanJreisat、Reuel Schiller、Leslie Shaunty 和 Joel Straka 提供了出色的研究协助。我还要感谢 Susan Armeny 出色的文字编辑工作,以及 Kent Olson 超出职责范围的参考帮助。最后,如果没有 Kathy Burton、Evelyn Gray、Christine Moll、Susan Simches 和(尤其是)Phyllis Ware 愉快而高效的口述转录,我不可能为这个项目阅读如此广泛的资料。