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分析古代织物，都灵的圣裹尸布的例子
考虑到可以应用的各种技术的复杂性，对古老的纺织品进行系统研究并不总是那么简单，本文以HS（Holy Shorh Roud）为例，讨论了与相对结果相对结果应用的最新测试。在简要介绍了纺织品并解释了其复杂性后，本文介绍了1978年获得的一些测试和结果。织物中存在的黑点，可归因于人的图像，添加有关其可能起源的有趣信息。通过将传统的信息与1988年进行的放射性碳测试和创新技术产生的其他新约会结果进行比较，讨论了约会问题。从HS真空吸尘的尘埃，用于对来自外部污染的人类DNA进行研究，提供了对遗物起源的有趣假设；另外，在这些尘埃中，电子微粒为拜占庭习俗提供了有趣的假设。最后，还考虑了与纺织品保护有关的问题。此示例显示了如何从纺织品有趣的科学结果和对先前历史假设的确认中获得的可能性。关键词：古代纺织品，神圣的裹尸布，DNA，体液，技术，约会，历史信息1。引言世界上有许多历史和考古发现，鲜为人知的起源可能会经过详细的研究。其中没有
人类 DNA 中古代内源性逆转录病毒的进一步变种
逆转录病毒将其基因组插入细胞的 DNA 中，有时是产生宿主生物后代的生殖系细胞：这种病毒被称为内源性逆转录病毒 (ERV)。人类基因组包含多种古代 ERV 的遗迹。一些遗迹贡献了新的基因和调控元件。这项研究在经过深入研究的人类基因组版本 hg38 中发现了更多种类的古代 ERV：ERV-Hako、ERV-Saru、ERV-Hou、ERV-Han 和 ERV-Goku。它还发现了许多 ERV-V 的遗迹，之前所知的 ERV-V 仅在 19 号染色体上的两个带有胎盘基因的副本中发现。它发现了一种两侧是 MER41E 长末端重复序列 (LTR) 的 ERV，与已知的 MER41 ERV 惊人地相似。 ERV-Hako 具有包含来自宿主基因 SUSD6 和 SPHKAP 的序列的亚型：SUSD6 变体在狭鼻目和阔鼻目灵长类动物之间转移。逆转录病毒使用 tRNA 来引发逆转录：根据基因组 tRNA 数据库，Hako 是唯一使用 tRNA-Trp（色氨酸，符号 W）的人类 ERV 遗迹，而 HERV-W 因使用 tRNA-Arg 而得名。一种 ERV-Saru LTR 是先前描述的先天免疫中 AIM2 的增强子。这项研究有助于了解灵长类动物 ERV 的历史，但也表明相关的 ERV 可能存在巨大差异，这对在基因组中清晰注释所有 ERV 遗迹的目标提出了挑战。
科学家揭示黄石温泉中古代生命的新发现
作者比较了海螺泉和章鱼泉微生物中发现的呼吸基因。适应极低氧水平的基因“高度表达”，这意味着它们在海螺泉中更活跃。相反，章鱼泉中的生物体表达了适应高氧水平的基因，这可能更为重要，因为在整个大氧化事件期间氧气水平都在增加。
古代 DNA 表明...存在 3000 年的基因连续性
（未经同行评审认证）是作者/资助者。保留所有权利。未经许可不得重复使用。此预印本的版权所有者此版本于 2025 年 2 月 4 日发布。；https://doi.org/10.1101/2025.02.03.636298 doi：bioRxiv preprint
艾伦古代 DNA 资源 (AADR) - David Reich 实验室
艾伦古代 DNA 资源 (AADR)：古代人类基因组精选概要 Swapan Mallick 1,2,3 、Adam Micco 1,3 、Matthew Mah 1,3 、Harald Ringbauer 4,5, 、Iosif Lazaridis 1,4 、Iñigo Olalde 1,6 Nick Patterson 2,4 和 David Reich 1,2,3,4 1 哈佛大学遗传学系医学院，波士顿，MA 02115，美国。 2 麻省理工学院和哈佛大学布罗德研究所，剑桥，MA 02142，美国。 3 霍华德休斯医学研究所，波士顿，MA 02115，美国。 4 哈佛大学人类进化生物学系，剑桥，MA 02138，美国。 5 马克斯·普朗克进化人类学研究所，莱比锡 04103，德国。 6 BIOMICs 研究小组，巴斯克大学，01006 维多利亚，西班牙。通信地址：shop@genetics.med.harvard.edu 和 reich@genetics.med.harvard.edu。已有两百多篇论文报告了古人类的全基因组数据。虽然绝大多数原始数据都是完全公开的，证明了古基因组学界对开放数据的承诺，但原始数据和元数据的格式各不相同。因此需要统一的管理和一个集中的、版本控制的汇编，供研究人员下载、分析和参考。自 2019 年以来，我们一直在维护艾伦古 DNA 资源 (AADR)，旨在提供全球已发表古人类 DNA 数据的最新、精选版本，这些数据包含超过一百万个单核苷酸多态性 (SNP)，几乎所有古代个体都经过了检测。自首次发布以来，AADR 已公开发布六次，并于 2022 年底突破了 10,000 多名拥有全基因组数据的古代个体的门槛。本文旨在作为 AADR 的可引用描述。第一批全基因组古代 DNA 数据于 2010 年发布 [1-3]。然而，直到 2015 年，随着全新世基因组大规模研究的出现、针对目标单核苷酸多态性 (SNP) 的古代 DNA 文库溶液中富集 [4-6] 以及用于处理古代 DNA 文库的自动化协议和液体处理机器人的引入 [7, 8]，拥有全基因组数据的个体数量才开始迅速增加。2010 年至 2014 年间，每年平均发布约 10 名拥有全基因组数据的个体的数据。2015 年至 2017 年间，这一数字增加到每年约 200 人。自 2018 年以来，每年都有数千名个体的数据被发表（图 1）。迄今为止，古代 DNA 数据集中在欧亚大陆西部，但越来越多的数据来自世界其他地区（图 2）。分析古代 DNA 的一个挑战是个体分布在许多独立的研究中。因此，虽然超过 99% 的个体的原始序列数据在公共存储库中完全可用 [9]，但上传的数据以多种格式存在，元数据也是如此，例如考古、年代、和地理信息。有些资源
古代 DNA 挑战了对庞贝石膏模型的普遍解释
Elena Pilli，1，15 Stefania Vai，1，15 Victoria C. Moses，2，3 Stefania Morelli，1 Martina Lari，1 Alessandra Modi，1 Maria Angela Diroma，4 Valeria Amoretti，5 Gabriel Zuchtriegel ，9，10，11 David Caramelli，1， * David Reich，3，9，10，11，11，12，13， *和Alissa Mittnik 3，9，9，12，13，14，14，15，16，16， * 1佛罗伦萨大学生物学系，50122 Florence，佛罗伦萨，佛罗伦萨，佛罗伦萨2大学，美国马萨诸塞州剑桥 02138 3 哈佛大学人类进化生物学系，美国马萨诸塞州剑桥 02138 4 佛罗伦萨大学生物系，意大利佛罗伦萨 50019 5 庞贝考古公园，意大利那不勒斯 80045 6 文化遗产、活动和旅游部，意大利罗马 00197 7 加州大学圣巴巴拉分校人类学系，美国加利福尼亚州圣巴巴拉 93106 8 佛罗里达大学人类学系，美国佛罗里达州盖恩斯维尔 32611 9 哈佛医学院遗传学系，美国马萨诸塞州波士顿 02115 10 哈佛医学院霍华德休斯医学研究所 (HHMI)，美国马萨诸塞州波士顿 02115 11 麻省理工学院和哈佛大学布罗德研究所，美国马萨诸塞州剑桥 02142 04103 莱比锡，德国 13 马克斯普朗克—哈佛古地中海考古研究中心，美国马萨诸塞州剑桥 02138 14 马克斯普朗克进化人类学研究所考古遗传学系，04103 莱比锡，德国 15 这些作者贡献相同 16 主要联系人 *通信地址：david.caramelli@unifi.it (DC)、reich@genetics.med.harvard.edu (DR)、alissa_mittnik@eva.mpg.de (AM) https://doi.org/10.1016/j.cub.2024.10.007
病例报告古代造型症影响三叉神经的颅内部分：病例报告
古老的Schwannomas是Ackerman和Taylor最初描述的Schwannomas的良性良性罕见组织学变种。[1]这些肿瘤长期存在，随着变化的变化而长期增长。通常，这些肿瘤显示出核非典型，高细胞区域以及回归变化，包括钙化，囊性形成，出血，纤维化和透明度在组织病理学上。这些特征与恶性肿瘤非常相似，但是，存在胶囊，出血区域，退化性变化以及有丝分裂活性的不存在，支持肿瘤的良性性质。[8]在免疫组织化学染色上，这些肿瘤对S100蛋白呈阳性，这是将良性schwannomas与其他高级或恶性病变区分开的重要标志。[6]涉及三叉神经颅内部分的古老schwannomas极为罕见，在文献中仅报道了两次。[3,11]
古代DNA揭示了阿尔巴尼亚人列昂尼达斯的起源...
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证（未经同行评审证明）获得的是作者/资助者，他授予Biorxiv授予Biorxiv的许可，以永久显示预印本。这是该版本的版权持有人，该版本发布于2023年6月16日。 https://doi.org/10.1101/2023.03.22.533820 doi：Biorxiv Preprint
古代植物 DNA 是了解我们食物体系的文化遗产和生物多样性的窗口
自 20 世纪 80 年代古代 DNA 革命开始以来，考古植物遗骸和植物标本一直通过分子技术进行分析，以探索植物和人类的进化界面。与古植物学、民族生物学和其他方法相结合，古代 DNA 为人类和植物的共同进化提供了巨大的见解，而现代基因组时代则为植物的使用提供了越来越细致入微的视角。与此同时，我们的全球粮食系统面临着与生物多样性下降、气候未来不确定以及脆弱的农作物野生亲属有关的威胁。古代植物 DNA 并不能轻易解决这些复杂的挑战，但我们讨论了它如何在有关我们粮食系统的复原力、可持续性和主权的持续对话中发挥重要作用。