否定性

16S rRNA测序分析伊朗人口中结直肠癌阳性与大肠癌否定性的口服和粪便菌群

抽象背景结直肠癌（CRC）构成了重大的医疗挑战，占全球癌症病例的近6.1％。通过使用创新生物标志物进行的人口筛查促进的早期检测对于MITIGAT的CRC发病率是关键的。与CRC阴性对应物（CNS）相比，这项研究旨在仔细检查CRC阳性个体（CP）的粪便和唾液微生物组，以通过微生物生物标记物来增强CRC诊断。材料和方法总共从伊朗德黑兰的Shahid Beheshti医学科学大学Taleghani医院收集了80个口头和粪便样品，其中包括接受筛查的CPS和CNS。使用16S rRNA测序测定法进行了微生物介绍，并在Illumina novaseq平台上采用Nextera XT Index套件。结果在CP的唾液和粪便样品中观察到了不同的微生物谱，与各种分类水平的CNS（包括门，家庭和种类）的粪便显着不同。CPS的唾液样品表现出大量的Calothrix Parietina，颗粒状Adiacens，Rothia dentocariosa和Rothia Mucilaginosa，在CNS中没有。此外，在CPS的粪便中，Lachnospileceae和Prevotellaceae明显更高，而CPS唾液中的fusobacteria phylum显着升高。相反，与CNS相比，非致病细菌akkermansia粘蛋白iphila的CPS粪便样品显着降低。关键字结直肠癌，口腔微生物群，粪便菌群，早期检测，16S rRNA测序通过一致选择唾液和粪便微生物的结论，基于平均值降低的Gini值，并采用唾液的逻辑回归，并支持粪便模型，我们成功地开发了一种微生物群检测，具有提高的敏感性和提高crc检测的敏感性和特异性。