XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search System哺乳
授权现场响应者对海洋哺乳动物中HPAI爆发的实用指南
自1996年出现以来，由H5N1亚型引起的高致病性禽流感（HPAI）已演变为全球泛型，影响着非洲，亚太，亚太，美洲，美洲，欧洲和中东。除了家庭家禽和圈养的鸟类之外，它现在威胁着野生和家庭哺乳动物以及人类。自2021年以来，HPAI H5N1进化枝2.3.4.4b菌株在世界各地的野生鸟类和南美的海洋哺乳动物中引起了显着的死亡（Gamarra-Toledo等，2023年，Ulloa等，Ulloa等，2023，Campagna等。，2023年，南美和南极洲野生动植物的HPAI H5 Off Lu临时组，2023年）。尽管这些暴发与轻度至重度症状的人类感染很少有联系（Castillo等人，2023），所有H5N1菌株（和其他一些亚型）应视为构成人畜共患风险。因此，该病毒对动物健康，公共卫生和生物多样性构成了风险。因此，该病毒对动物健康，公共卫生和生物多样性构成了风险。
哺乳动物病毒的细胞受体
美国的人均人均人均最受监禁的人[1]。困扰美国刑事司法系统的两个问题是高累犯率和精神健康问题的人数不成比例。目前有关于累犯与精神疾病之间关系的确定证据。必须了解这种关系，以便为政策和干预措施提供信息，以减少对精神疾病患者的刑事司法系统的参与。大多数精神疾病的患病率在美国监狱中高于一般人群[2]。每年仅在监狱中被监禁200万人[3]。司法统计局的一项研究调查了近15,000人入狱的人，在美国，有7,000人在监狱中调查了56％的监狱个人和65％的监狱患有心理健康问题[4]。术中心理健康治疗需求的规模远远超过了刑事法律体系提供适当治疗的能力。累犯在被监禁的个体中普遍存在。每年在美国的州和联邦监狱中释放了60万以上的人[5]。44％在释放的第一年内被累进，由于大量的人返回监狱，在释放后的10年内重新犯了80％以上，这是至关重要的，即构成导致犯罪周期的因素。对累犯风险因素的兴趣可以追溯到20世纪初[7]。许多关于累犯的研究研究了解释模型，试图发现解释累犯结果最大差异的变量。在这种解释性方法中，两个元分析回顾了有关成人累犯最显着相关的文献。Gendreau等。 （1996）包括131项具有1141个相关性的研究，发现与一般累犯的最强关联是犯罪史，反社会人格和奇怪的基因需求。 荟萃分析的结果表明，精神症状学与累犯无关，尽管该发现仅基于少数效应大小。 预测结果的许多早期工作都是基于加拿大的数据，加拿大的社会，人口和刑事司法程序与美国的数据非常不同。 最新的随访荟萃分析包括与美国19项研究的成人累犯相关。 与Gendreau等人的结果相比。 （1996），Katsiyannis等人发现使用有问题的物质使用，而其他心理健康问题则与一般累犯有关[8]。 关于精神疾病与累犯的相关性的这两个荟萃分析的不同结果代表了文献中较大的差异。 一些研究发现精神疾病（药物使用障碍）与累犯之间没有联系[9-11]。 另一方面，多项研究报告了精神疾病与累犯或重新审判之间的关联[12-17]。Gendreau等。（1996）包括131项具有1141个相关性的研究，发现与一般累犯的最强关联是犯罪史，反社会人格和奇怪的基因需求。荟萃分析的结果表明，精神症状学与累犯无关，尽管该发现仅基于少数效应大小。预测结果的许多早期工作都是基于加拿大的数据，加拿大的社会，人口和刑事司法程序与美国的数据非常不同。最新的随访荟萃分析包括与美国19项研究的成人累犯相关。与Gendreau等人的结果相比。（1996），Katsiyannis等人发现使用有问题的物质使用，而其他心理健康问题则与一般累犯有关[8]。关于精神疾病与累犯的相关性的这两个荟萃分析的不同结果代表了文献中较大的差异。一些研究发现精神疾病（药物使用障碍）与累犯之间没有联系[9-11]。另一方面，多项研究报告了精神疾病与累犯或重新审判之间的关联[12-17]。例如，一项针对患有精神病或情绪障碍的人的被监禁患者（SMI）的研究，使监狱发现精神病病史没有预测重新逮捕[10]。精神病症状的存在与剧烈累犯的风险增加有关[13]，发现创伤后应激障碍（PTSD）的诊断增加了新逮捕的可能性[16]。
在哺乳动物细胞中细菌亮氨酸tRNA的定向进化，以增强非规范氨基酸诱变
图2。tRNA leu库设计和下一代测序选择数据。a）受体茎的序列对齐的WEBLOGO表示来自682个细菌trNA，表明每个位置在每个位置的每个残基相对丰度。编号方案相对于tRNA ecleu（面板b）。b）野生型大肠杆菌tRNA cuA leu的三叶草结构，通过随机使受体词干碱基对随机使图书馆生成方案。基础配对均通过根据框中显示的彩色方案在每个位置引入每个位置的成对替换来维护。随机化被限制以维持保守的序列元素（面板A）。c）在选择之后和之前，使用其在文库中的标准化丰度（以前/以前/丰度）在库中测量了库中每个突变体在库中的富集。进行了选择的两种生物学重复，并彼此绘制了这两种重复物中观察到的每个突变体的富集。d）显示了最高1％（最丰富）序列的共识序列。提供了WT-TRNA ecleu的序列作为参考。e）在存在或不存在1 mM帽的情况下，通过将每个tRNA ecleu突变体的活性与PLRS1和EGFP-39TAG一起转染中，与PLRS1和EGFP-39TAG进行了测试（另请参见图S5）。在无细胞提取物中测量了EGFP-39TAG的表达，
重新利用哺乳动物的RNA结合蛋白musashi
摘要RNA识别基序（RRM）是自然界中最常见的RNA结合蛋白结构域。然而，含RRM的蛋白质仅在真核门中普遍存在，它们在其中扮演中心的调节作用。在这里，我们设计了一种与哺乳动物RNA结合蛋白Musashi-1的大肠菌中基因表达的正交后转录控制系统，该系统是具有神经发育作用的干细胞标记物，其中包含两个规范的RRM。在电路中，由于与Messenger RNA的N末端编码区域的特定相互作用及其对脂肪酸的反应，因此在转录中受到转录调节，并作为变构翻译阻遏物。我们通过评估一系列RNA突变体的体外结合动力学和体内功能，完全表征了种群和单细胞水平的遗传系统和单细胞水平，显示了报告基因表达的显着折叠变化以及潜在的分子机制。通过自下而上的数学模型很好地概括了系统的动态响应。此外，我们应用了用Musashi-1设计的转录后机制来特异性调节操纵子内的基因，实施组合调节并减少蛋白质表达噪声。这项工作说明了如何将基于RRM的调节适应简单的生物，从而在原核生物中添加了用于翻译控制的新调节层。
哺乳动物大脑皮层间连接的可预测性
尽管哺乳动物的大脑大小相差五个数量级，但它们具有许多共同的解剖和功能特征，这些特征转化为皮质网络的共性。在这里，我们开发了一个机器学习框架来量化加权区域间皮质矩阵的可预测程度。部分网络连接数据是通过采用一致方法生成的逆向追踪实验获得的，并辅以非人类灵长类动物（猕猴）和啮齿动物（小鼠）的投影长度测量。我们表明，这两个物种的区域间皮质网络都具有显著的可预测性。在二进制级别，对于猕猴，链接是可预测的，ROC 曲线下面积至少为 0.8。加权中和强链接的可预测准确率为 85% – 90%（小鼠）和 70% – 80%（猕猴），而这两个物种的弱链接都不可预测。这些观察结果证实了先前的观察结果，即中尺度皮层网络的形成和演化在很大程度上是基于规则的。使用本文介绍的方法，我们对所有区域对进行了归纳，为两个物种的完整区域间网络生成了样本。这对于在物种内和物种间以最小偏差进行连接组比较研究是必要的。
工程自动核解哺乳动物悬架宿主细胞系，以降低无血清慢病毒过程流中的DNA杂质水平
摘要：我们用转基因编码四环素诱导的金黄色葡萄球菌核酸酶，并结合了易位信号。我们调整了未修饰和核酸酶工程的细胞系在无血清培养基中的悬浮液中生长，分别产生HEK293TS和NUPRO-2S细胞系。瞬时转染产生的1.19×10 6慢病毒转染来自Nupro-2S细胞的每毫升（TU/mL），HEK293TS细胞的1.45×10 6 Tu/ml。DNA梯子消失揭示了以四环素诱导的方式由NUPRO-2S细胞引起的中等居民核酸酶活性。DNA杂质水平在NUPRO-2S和HEK293TS细胞引起的慢病毒材料中无法通过SYBR安全琼脂糖凝胶染色检测到。通过PICOGREEN试剂进行直接测量表明，在HEK293TS细胞的慢病毒材料中，DNA以636 ng/ml的形式存在，在Nupro-2S细胞的慢病毒材料中，杂质水平降低了89％至70 ng/ml。通过使用50个单位/mL苯并酶处理HEK293TS衍生的慢病毒材料，这种还原与23 ng/ml相当。关键词：慢病毒，哺乳动物细胞，生物普应，基因治疗，核酸酶
鉴定在哺乳动物中具有活性的祖先有颌类 Gli3 增强子
已知转录调节因子和 Hh 信号通路效应因子 Gli3 的异常表达会引发先天性疾病，最常影响中枢神经系统 (CNS) 和四肢。准确描绘胚胎发育过程中控制 Gli3 转录的基因组顺式调控景观对于解释与先天性缺陷相关的非编码变异至关重要。在这里，我们对分子进化速度较慢的鱼类进行了比较基因组分析，以识别 Gli3 内含子间隔 (CNE15-21) 中七个以前未知的保守非编码元件 (CNE)。斑马鱼的转基因试验表明，这些元件中的大多数驱动 Gli3 表达组织中的活动，主要是鳍、中枢神经系统和心脏。这些 CNE 与人类疾病相关的 SNP 的交集确定了 CNE15 是一种假定的哺乳动物颅面增强子，在脊椎动物中具有保守活性，并且可能受到与人类相关的突变的影响
关于研究主题哺乳动物精子发生的社论：遗传和环境因素
精子发生是一个复杂且严格调节的过程，其中包括精子的增殖，精子分化为精子细胞，生产精子的减数分裂分裂，圆形精子成熟，精子的成熟以及高度专业的成熟精子的精子释放以及释放。这些事件中的任何一个异常都可能导致影响生育能力的精子发生障碍。精子发生障碍可能是由遗传和非遗传因素引起的，其中遗传因素占15％至30％，非遗传学占70％ - 85％（O'Flynn O'Brien等，2010； Neto等，2016）。值得注意的是，作为非遗传学的环境因素对于精子发生很重要，因为男性生殖系统，尤其是精子发生似乎对环境危害特别敏感（Vecoli等，2016）。本研究主题包括七个原始文章和一项迷你审查，以增强和扩展我们对这些因素和机制的了解。精子干细胞（SSC）是最原始的生殖细胞，通过自我更新和连续分化为精子细胞，在睾丸中产生精子（Kubota and Brinster，2018），它们通过自我更新和连续分化来维持精子发生。Wu等人的研究。发现GPX3调节人类SSC的增殖和凋亡。作者表明，GPX3在人类SSC中高度表达，其敲低抑制了细胞增殖。此外，GPX3与CXCL10相互作用，并且它们的敲低表型在人类SSC系列中是一致的。结果表明GPX3和CXCL10对于SSC自我更新至关重要。有一些关于外部环境因素对SSC自我更新和分化的影响的研究。先前的研究表明，缺氧对SSC的增殖有益（Morimoto等，2021）。在此研究主题中，Gille等人。研究了缺氧如何影响SSC的增殖和分化。作者证明，当O2张力≤1％时，SSC显示出轻微的分化偏置和增殖的减少，这与Morimoto等人的结果一致。（2021）。减数分裂过程中发生了几个重要事件，包括DNA复制，染色质冷凝，DSB形成和DSB修复。这些事件不是减数分裂的独家，并且发生在体细胞周期中，并且已证明核肌动蛋白与这些事件有关。但是，没有研究来阐明核肌动蛋白和减数分裂之间的关系。在此研究主题中，Petrusová等。提供了一个迷你审查，以阐明核肌动蛋白在预言I
胚胎谱系的表观遗传启动在哺乳动物的谱系
（未通过同行评审认证）是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。此预印本版的版权持有人于2024年1月23日发布。 https://doi.org/10.1101/2023.10.23.563669 doi：Biorxiv Preprint