图8。根据维多利亚时代的生物多样性地图集记录和维多利亚时代的生态植被类映射(认为被认为可能是国家威胁性生态社区的可能或可能的等效物),与Wimmera Grasslands相关的国家威胁物种和生态社区的记录图。与Wimmera Grasslands相关的国家威胁物种和生态社区的记录图。
温室气体,臭氧耗尽物质和气溶胶的人为排放以及土地覆盖和土地利用的变化有望在将来改变干旱风险。但是,干旱并不罕见或前所未有,正如夏季平均帕尔默干旱严重程度指数(PDSI)的基于树环的重建中所记录的。使用对这些工业前气候重建的无监督的机器学习方法,我们确定异常值:与“正常”变异性相对于“正常”的变异性,PDSI的空间模式与众不同。我们表明,在许多地区,离群值在20世纪和二十个世纪中更常见。将区域干旱地图集合并为一个全球数据集时,这种趋势更为明显。按定义,预计每十年的离群模式将发生一次,但是从1950 - 2000年开始,每十年超过六年以上,将其视为全球干旱地图集的异常值。使用观察数据集将全球干旱地图集扩展到2020年,这表明21世纪的80%的全球干旱条件在80%的时间内存在。我们的结果表明,在不诉诸气候模型的情况下,世界更频繁地经历干旱状况,这些条件在过去的自然气候变异性的背景下是非常不寻常的。
缺乏准确和全面分析的工具,阻碍了小鼠的全脑电路发展。没有现有的3D大脑图集提供每日产后分辨率,因为建造这种地图集是高度劳动的。轴突形态动态变化,使可靠的分割具有挑战性,许多2D数据集缺乏足够的Z分辨率用于交叉模式3D分析。在这里,我们提出了D-LMBMAPX,这是一种在产后发展的自动化全脑电路分析的深度学习管道。d-LMBMAPX构建高分辨率的3D小鼠大脑图谱,跨越了七个产后阶段,并在任何后日都采用自适应注册策略来进行全脑对齐。它还集成了用于轴突和SOMA分割的基础模型,从而实现了整个开发的定量电路评估。,我们实现了基于扩散模型的样式转移,以用于交叉模式和跨二维注册,并通过将遗传定义的神经元类型从2D ISH数据集对齐到我们的3D地图集进行了验证。使用D-LMBMAPX,我们在产后成熟过程中介绍了全脑多巴胺能预测。
这项研究利用了仍然长大的大脑的细片,允许细胞级成像。dharini是唯一捕获胎儿增长大脑的大脑图集。2016年美国艾伦学院发布的唯一其他类似的公共可用地图集绘制了成年女性的大脑。Dharini有望支持人工智能和机器学习的未来进步,帮助科学家更好地了解人的大脑并改善人工智能模型。
星形胶质细胞在中枢神经系统稳态和神经炎症中起着关键作用。尽管在单细胞分析中取得了进步,但神经退行性疾病中反应性星形胶质细胞的异质性,尤其是整个物种的异质性。在这里,我们提出了来自阿尔茨海默氏症(AD)小鼠模型和多发性硬化症(MS)的187,000个星形胶质细胞的整合地图集,以及来自AD,MS和Parkinson's(PD)患者的438,000个星形胶质细胞。我们的分析确定了四个不同的小鼠星形胶质细胞簇,包括两个与疾病相关的星形胶质细胞(DAA)簇DAA1和DAA2。daa1表现出类似于急性刺激的反应,包括内毒素血症,而DAA2表示众所周知的AD风险基因。在AD模型中,DAA1和DAA2与淀粉样斑块表现出不同的空间关系。在人类中,我们确定了八个不同的星形胶质细胞簇,其中包括体内平衡和疾病相关的亚型。跨物种分析联系了与疾病相关的簇,同时也突出了其他人的表达。我们的星形胶质细胞地图集可通过用户友好的,可搜索的网站提供:http://research-pub.gene.com/astrotlas/。
全脑细胞结构的无偏表征代表了理解大脑功能的宝贵工具。为此,从2D切片到3D脑图的组织学标记物的精确映射是关键的。在这里,我们提供了两个新型的软件工具,促进了这一过程:对齐大脑和地图集(ABBA),旨在简化2D段的精确注册到3D参考地图集,而Braian,一个用于多头标记的集成套件,用于多头标记器自动序列,全脑统计分析,全脑统计分析和数据可视化。结合了这些工具,我们对三个最广泛使用的早期基因(IEG)的全脑表达进行了全面的比较研究。由于其神经活动依赖性表达,IEG已被用作神经活动的代表来产生行为后的无偏图映射,但是它们对整个大脑中神经元激活的响应均尚不清楚。为了解决这个问题,我们在与记忆有关的三种不同的行为条件下,系统地比较了三个大量使用的IEG的脑部表达CFO,ARC和NPAS4。我们的结果突出了其分布和诱导模式的主要差异,表明它们不代表整个大脑区域或活动状态的等效标记,而是可以提供互补信息。简介
天然资本或资产可以通过不同的方式概念化。一种常见的实用方法是8种“广泛栖息地类型”中的一个划分(表1)。原则上每个都代表一个独特的空间区域,可以像拼图拼图一样组合。这些分类为英国自然资本账户和自然英格兰自然资本地图集的基础。它们也是自然资本定义的结构,包括所有自然元素(例如大气,气候和地下资产)是否基于生态系统。