摘要古老的茶厂是珍贵的自然资源和茶叶遗传多样性的来源,对于研究植物的进化机制,多样化和驯化而具有巨大的价值。古老的茶叶植物之间的总体遗传多样性以及自然选择期间发生的遗传变化仍然很少理解。在这里,我们报告了由120个古代茶厂组成的八个不同群体的基因组重新陈述:来自吉州省的六组和云南省的两个团体。基于8,082,370个鉴定的高质量SNP,我们构建了系统发育关系,评估了种群结构并进行了全基因组关联研究(GWAS)。我们的系统发育分析表明,120个古老的茶厂主要聚集在三组和五个单个分支中,这与主成分分析(PCA)的结果一致。基于遗传结构分析,将古老的茶水进一步分为七个亚群。此外,发现古老的茶叶植物的变化不会因外部自然环境或人工育种的压力而降低(非同义/同义词= 1.05)。通过整合GWA,选择信号和基因功能预测,四个候选基因与三个叶片性状显着相关,并且两个候选基因与植物类型显着相关。这些候选基因可用于进一步的功能表征和茶植物的遗传改善。
末端干旱是影响硬脂小麦的最常见和毁灭性的气候应力因素之一(Triticum Durum Desf。)全球生产。这种作物的野亲戚被认为是适应这种压力的有用等位基因的巨大潜在来源。嵌套的缔合映射(NAM)面板是用作为经常父母的摩洛哥型摩洛哥型“ nachit”生成的,该品种源自甲状腺菌素,并以其较大的晶粒尺寸而闻名。将其重新组合为三个源自双甲状腺菌,芳香霉菌和aegilops speltoides的顶级表现,总共426个近交子。在八个环境(叙利亚,黎巴嫩和摩洛哥)中评估了该NAM,在两个农作物季节中经历了不同程度的终末水分胁迫。我们的结果表明,干旱压力平均导致41%的收益率损失,而1,000内核重量(TKW)是适应它的最重要特征。具有25K特征基因阵列的基因分型导致共有的图1,678个多态性SNP,涵盖了1,723 cm与参考“ SVEVO”基因组组装相符的1,723 cm。亲属关系区分了与原始父母相匹配的三个进化枝的后代。总共将18个稳定的定量性状基因座(QTL)鉴定为控制各种性状,但独立于空转时间。最重要的基因组区域被命名为q.icd.nam-04,q.icd.nam-14和q.icd.nam-16。在第二个种质面板中进行的等位基因研究确认在所有三个基因座上携带正等位基因的平均TKW优势在干旱条件下进行了现场测试时的平均TKW优势。下面的SNP被转换为具有特异性PCR(KASP)标记的高素质等位基因,并在第三个种质集合中成功验证,在此中,在水分胁迫下,TKW的表型变化的19%。这些发现确认了关键基因座的识别,用于从野生亲戚中得出的干旱适应性,现在可以通过分子繁殖很容易利用。
利益冲突H.B.曾担任Janssen,Astellas,Merck,Pfizer,Foundation Medicine,Blue Earth Diagnostics,Amgen,Amger,Bayer,Oncorus,Loxo,Daicchi Sankyo,Daicchi Sankyo,Sanofi,Sanofi,Curie Therapeutics,Novartis,Novartis,Astra Zeneca; H.B.已获得Janssen,Abbvie/Stemcentrx,Eli Lilly,Astellas,Millennium,Bristol Myers Squibb,Circle Pharma,Daicchi Sankyo,Novartis的研究资金。O.E. 得到Janssen,J&J,Astra-Zeneca,Volastra和Eli Lilly Research Grants的支持; O.E. 是Freenome,Owkin,Pionyr Immunothapeics,Volastra Therapeutics和一名三个生物技术的科学顾问和股权持有人,也是Champions肿瘤学的付费科学顾问; V.C. 曾担任Janssen,Astellas,Merck,Astrazeneca,Amgen和Bayer的顾问/顾问委员会成员; V.C. 已获得Astellas,Janssen,Ipsen,Bayer和Bristol的演讲者Honoraria或旅行支持。O.E.得到Janssen,J&J,Astra-Zeneca,Volastra和Eli Lilly Research Grants的支持; O.E.是Freenome,Owkin,Pionyr Immunothapeics,Volastra Therapeutics和一名三个生物技术的科学顾问和股权持有人,也是Champions肿瘤学的付费科学顾问; V.C.曾担任Janssen,Astellas,Merck,Astrazeneca,Amgen和Bayer的顾问/顾问委员会成员; V.C.已获得Astellas,Janssen,Ipsen,Bayer和Bristol的演讲者Honoraria或旅行支持。
这项研究得到了日本学术振兴会 (JSPS) KAKENHI(资助编号:18H03974、19KK0401、22K19238、23H00367、24K02010、22H04922(AdAMS))、日本科学技术振兴机构 COI-NEXT(JPMJPF2010)和日本医疗研究发展机构 (AMED)(24bm12230009)的支持。 名词解释(注1) CRISPR-Cas3:许多细菌都有一种名为CRISPR-Cas系统的防御系统,类似于适应性免疫。 CRISPR-Cas3属于1类CRISPR系统,2019年被报道为一种使用多蛋白复合物人工切割DNA的国产基因组编辑工具。 (注2)脱靶突变:在基因组编辑技术中,DNA序列中非预期的突变发生在特定目标序列以外的位置。最大限度地减少脱靶突变被认为对于基因组编辑技术的高度安全性至关重要。 (注3)长读测序:与传统方法相比,一次分析更长片段的DNA或RNA碱基序列的技术。在本研究中,我们使用了纳米孔测序方法,这是一种通过将序列穿过纳米级孔(纳米孔)实现高速解码的技术。
森林生态系统是世界上最大的碳汇之一,在陆地生物多样性和碳封存中发挥着关键作用。树木是重要的可持续资源,是农艺和经济特性的丰富来源,可提供木材、纸浆和纸张、纤维相关产品、能源和化学产品。在过去的几十年里,常规杂交育种有助于产生具有改良农艺和经济特性的植物品种。然而,林业中的常规杂交育种耗时长,已达到瓶颈。因此,需要注意改善树种的生长和农艺及经济重要性状。由于高质量基因组组装和注释工具、基因识别技术和高效基因编辑的发展,生物技术最近在作物育种方面取得了巨大进展。但与作物相比,还需要开展大量工作来组装和注释高质量基因组,鉴定调控农艺和经济重要性状的关键基因,并在表现出高杂合性的树种中进行高效的基因编辑。本前沿研究主题旨在介绍林木基因组学领域的最新基础发现,包括针对与关键农艺和经济重要性状相关的基因和途径的遗传学研究、次生生长调控的分子机制以及生物技术在木本植物遗传改良中的潜在应用。本卷分为以下部分:(1)基因组组装和注释;(2)调节树木生长、维管发育和应激反应的关键基因的功能鉴定;(3)木本植物的遗传转化和基因编辑。
0009-0000-3805-9735 https://orcid.org/0009-0000-3805-9735,vipet103@uni-duesseldorf.de https://orcid.org/orcid.org/0009-0009-0009-0009-0009-8999999999999999999999-DEARELD https://orcid.org/0009-0006-6743-0904,tobias.finkenrath@hhu.de.de https://orcid.org/0009-0009-50007-5319-563X https://orcid.org/0000-0002-3523-2907,matias.zurbriggen@uni-duesseldorf.de https://orcid.org/000000-0000-0000-0000-7975-5013,urquizag@hhu.de artifortions:1)德国杜塞尔多夫2)德国植物科学卓越群体 *相应的作者关键词:植物合成基因组学,生物设计自动化,植物学,植物托布里克,金门,随机DNA。
如何申请 主席和主管当局转发的规定格式的完整申请表应在 2023 年 7 月 5 日或之前通过电子邮件发送至新德里 ICAR-IARI 昆虫学部课程协调员,电子邮件 ID:labnumber54@gmail.com。 申请表可从 IARI 网站 https://www.iari.res.in 或 NAHEP-CAAST 网站(https://nahep-caast.iari.res.in)下载。 选定的候选人将在 2023 年 7 月 25 日之前通过邮件通知。 谁可以参加 ICAR 视为大学/SAU/CAU/CU/其他 UGC 认可的大学和研究机构的硕士和博士生有资格申请。 该培训计划最多选拔 25 名参与者。 注册费:无需支付注册费;该计划完全由 NAHEP-CAAST TRAVEL 赞助。 组织者将根据规范提供旅行津贴。 入选学员仅有资格获得卧铺/AC III 级票。 学生应自行安排在所有工作日上午 9:00 到达培训地点。 餐饮和住宿 将为外部学生提供餐饮和住宿。 课程期间将提供茶和小吃,费用将从培训预算中支付。 重要日期: 培训日期:2023 年 9 月 12 日至 22 日 申请截止日期:2023 年 7 月 5 日 选拔通知:2023 年 7 月 25 日。
全球约有 500 万公顷的东非和南亚半干旱环境下种植了小米,它是一种重要的两用作物,可满足这些边缘地区的粮食、饲料和营养需求。尽管产量潜力巨大,但包括小米在内的全球小黍种植面积在 1961 年至 2018 年间减少了 25.7%。小米改良计划于 1913 年在印度启动;然而,与改良其他主要谷物所投入的努力相比,尚未集中精力实现这种气候适应性作物的遗传增益。这导致即使经过 100 多年的育种,农民田地里的小米产量仍然低于其潜在产量。然而,重要性状具有显著的遗传变异。亚洲和非洲的育种计划已经根据当地需求改进了杂交技术和育种目标。 ICRISAT 是一家国际中心,其授权作物之一为小米,该中心正与合作伙伴合作开发新种质,以提高边远地区这种作物的生产力。该项目以印度和肯尼亚为基地,在过去几十年中在全球范围内开发和传播了种质和育种品系。许多有前途且适应性广的品种已在许多国家推出和采用。20 世纪 90 年代,印度和非洲小米基因库之间的杂交为印度的小米生产带来了范式转变。现在,随着新品种的鉴定,育种渠道得到了加强
该课程涉及对基因组启用的见解,对环境海洋科学的更广泛框架。本课程中的主题包括从个体到生态系统级别的海洋生物的基因,基因组和元基因组的进化和功能方面。先决条件。该课程旨在为学生提供分子生态学领域的介绍,专门针对其生物体的海洋环境。该课程涉及将分子种群遗传学,系统发育学以及(元)基因组学和(meta-)转录组学应用于传统的生态和进化问题(例如,物种诊断,生物多样性的物种诊断,保护和评估,定量性遗传学,特质和繁殖研究和繁殖的研究和繁殖的遗传性和繁殖性生物学的遗传能力,以及行为的生物学生态学)。