使用穿透式细胞外多通道电极阵列(通常称为神经探针)记录神经元活动是探测神经元活动最广泛的方法之一。尽管有大量可用的细胞外探针设计,但尖峰分类软件要求的电极通道顺序和相对几何形状的映射这一耗时过程总是留给最终用户。因此,这个手动过程容易出现错误映射,进而导致不良的尖峰分类误差和效率低下。在这里,我们介绍了 ProbeInterface,这是一个开源项目,旨在通过消除在尖峰分类之前手动进行探针映射的步骤来统一神经探针元数据描述,以分析细胞外神经记录。ProbeInterface 首先是一个 Python API,使用户能够以任何所需的复杂度级别创建和可视化探针和探针组。其次,ProbeInterface 有助于以可重现的方式生成任何特定数据采集设置的全面接线描述,这通常涉及使用记录探头、探头、适配器和采集系统。第三,我们与探头制造商合作编译了一个可用探头的开放库,可以使用我们的 Python API 在运行时下载。最后,使用 ProbeInterface,我们定义了一种用于探头处理的文件格式,其中包含 FAIR 探头描述的所有必要信息,并且与神经科学中的其他开放标准兼容且互补。
摘要。已经开发了ECHAM5/MYSY AT- MOSPHER化学模型(EMAC)的子模型PSC,以模拟极性平流层云的主要类型(PSC)。子模型中超冷三元溶液(STS,1B PSC)的参数化基于Carslaw等人。(1995b),在Marti和Mauersberger上模拟冰颗粒(2型PSC)的热力学方法(1993)。存在硝酸三水合物(NAT)颗粒(1A型PSC)的形成两个不同的参数。首先是基于Hanson和Mauersberger(1988)的瞬时热力学方法,第二个是新的,并借助于Carslaw等人的表面生长因子来考虑NAT颗粒的生长。(2002)。可以在子模型中选择此NAT参数之一。本出版物解释了子模型PSC的背景和使用子模型的使用,目的是模拟EMAC中的现实PSC。
摘要 综述目的 本综述旨在强调与仿生肢体和体感反馈恢复相关的多感觉整合过程日益增长的重要性。 最新发现 通过神经刺激恢复准现实感觉已被证明可为肢体截肢者带来功能和运动益处。近期,与人工触觉相关的认知过程似乎在假肢的完全整合和接受中发挥着至关重要的作用。 摘要 仿生肢体中实现的人工感觉反馈增强了截肢者对假肢的认知整合。多感觉体验是可以测量的,必须在设计新型体感神经假体时予以考虑,其目标是为假肢使用者提供逼真的感觉体验。正确整合这些感觉信号将保证更高水平的认知益处,从而实现更好的假肢并减少感知到的肢体扭曲。
摘要 研究:AI 社会认知评估与建模。评估 LLM 中的心智理论及其在心理学中的应用 NLP:LLM IFT、表征学习(对比和三重态损失)、语义聚类、总结 DL:Transformers、MoE、EncDec、RNNs、DPO、LoRA 工具:Python、Pytorch、Deepspeed、AWS Sagemaker、hydra、SQL 管理:建立 ML 团队、职能、策略和 OKR、招聘和指导科学家和实习生以及建立数据和注释合作伙伴关系。
● 简介。课程框架 ● 最近邻方法、线性回归 ● 感知器、逻辑回归、支持向量机、决策树 ● 应用 1:基因表达分析、生物标志物发现、精准医疗 ● 无监督学习、主成分分析、聚类 ● 应用 2:单细胞 RNA-seq 分析、其他基因组应用 ● 概率模型、马尔可夫模型、EM 算法 ● 应用 3:基因发现、调控基序发现、CpG 岛 ● 神经网络、深度学习 ● 应用 4:生物医学图像分析
QBIO 465 Artificial Intelligence in Biology and Medicine Units: 4 TBD Semester Lecture: Tuesdays and Thursdays 12:30-1:50 pm Discussion: Fridays 11:00-11:50 am Location: RRI 301 Instructor: Tsu-Pei Chiu, PhD Office: RRI 413J Office Hours: Fridays, 4:00-5:00 pm, or by appointment Contact Info: tsupeich@usc.edu助教:Jesse Weller办公室:RRI 413L办公时间:星期二,11:00 AM-12:00 PM或通过预约联系信息:wellerj@usc.edu简短描述AI技术,包括传统的机器学习和高级学习方法,用于基因组学,系统生物学,数据集成,结构,药物学,医学,医学,医学,以及医学,医学,和医学,并发现,以及基于项目。课程描述本课程介绍了各种各样的人工智能(AI)技术,强调各种深度学习方法。本课程将指导学生采用这些复杂技术来应对各种生物学和医疗挑战的过程。通过一种全面,直观的教学方法,学生将沉浸在动手活动中,直接与许多不同类型的生物学和医疗数据集合作。学习目标主题包括基因组学的原理和方法,系统生物学,结构生物学,多摩学数据整合,结构生物学发现,医学图像,大脑形象,道德问题等。使用AI技术,包括传统的机器学习和先进的深度学习方法以及目前的新兴研究领域。使用的主要编程语言将是Python,该语言将在针对AI和深度学习应用程序量身定制的讲座中进行审查。学生将使用该语言实施AI算法来分析生物学和医疗数据集的每周计算分配和学期末期项目。成功完成本课程后,学生将获得对AI原则的广泛了解,尤其是深度学习技能,并能够通过讲座和练习来分析和建模生物学和医学数据。建议准备:数学208x或QBIO 305G或QBIO 310(或同等学历)。数学225或数学235或数学245(或同等学历)。建议使用Python的编程经验。课程记录本课程是为字母等级的。演讲幻灯片将发布在Brightspace上。
学期学时20学期 - VI课程代码课程类型学会时间HQ-006古兰经强制性的翻译1 Chem-319物理化学I-I(化学动力学)强制性2 Chem-320物理化学化学(体温动力学)强制性2化学-321物理化学实验室强制性化学1 Chemistory 1 Chemistor 1 Chemistor 1 Chemistor 1 Comportor 2 Comprions 2 Comportion 1 Chemistor 1 Comportor 2 Comistry 1 Comportor 2 Cosistry 2 Comistry 1 Chemistry 1 Comportion 2 Comistor 2 Chem-323 Inorganic Chemistry-II (f-block elements) Compulsory 2 Chem-324 Inorganic Chemistry Lab Compulsory 1 Chem-325 Organic Chemistry-I (Reaction Mechanisms-I) Compulsory 2 Chem-326 Organic Chemistry-II (Spectroscopy) Compulsory 2 Chem-327 Organic Chemistry Lab Compulsory 1
摘要:Monte Carlo(MC)是研究散射媒体中光子迁移的强大工具,但很耗时以解决反问题。为了加快MC模拟的速度,可以将缩放关系应用于现有的初始MC模拟,以生成具有不同光学属性的新数据集。我们命名了这种方法基于轨迹,因为它使用了初始MC模拟的检测到的光子轨迹的知识,这与基于较慢的光子方法相反,在这种方法中,新型MC模拟具有新的光学特性。我们研究了缩放关系的收敛性和适用性限制,这两者都与所考虑的轨迹样本也代表了新的光学特性有关。为了吸收吸收,缩放关系包含平滑收敛的兰伯特啤酒因子,而对于散射,它是两个快速分化因子的乘积,其比例很容易达到十个数量级。我们通过研究给定长度的轨迹中的散射事件数量来研究这种不稳定。我们根据记录的轨迹中的最小最大散射事件进行了散射缩放关系的收敛测试。我们还研究了MC模拟对光学性质的依赖性,这在反问题中最关键,发现散射衍生物归因于小泊松分布的散射事件分布的小偏差。本文也可以用作教程,有助于理解比例关系的物理学与其局限性的原因,并制定了应对它们的新策略。
基因组结构变体,包括缺失,重复,反演和遗传序列的易位,是遗传多样性的丰富资源。特别是,大西洋鲑鱼基因组显示出基因组结构变异的极端水平,这可能是由于它们最近的全基因组重复的独特历史所致。大西洋鲑鱼基因组中的结构变异是进化基因组学和水产养殖基因组学中最有希望的边界之一。然而,由于其复杂的性质,以及结构变体如何以功能优势驱动适应性进化,这尚待澄清。
