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基因组变异和LTR-RT分析的古老桃子兰德拉斯揭示了血液果实形成和果实成熟日期的机制
桃（Perrunus persica）Landrace具有典型的区域特征，强大的环境适应性，并包含许多有价值的基因，为繁殖优秀品种奠定了基础。因此，有必要组装特定陆地的基因组，以促进这些基因的定位和利用。在这里，我们从头组装了一个来自中国北平原的古老血液中国兰德·舒伊米（TJSM）的高质量基因组。组装的基因组大小为243.5 MB，重叠元素N50为23.7 MB，支架N50为28.6 MB。与报道的桃基因组相比，我们组装的TJSM基因组具有最大数量的特定结构变体（SVS）和长时间重复返回转树（LTR-RTS）。有可能调节其宿主基因的潜力，我们在NAC转录因子编码PPBL的启动子中鉴定了6688 bp ltr-rt（命名为IT血液TE），这是一种调节乳头的基因PPBL。血液不仅与血液表型共分离，而且还与果实成熟日期的进步和血液形成的不同强度有关。我们的发现提供了有关血液颜色发展和确定水果成熟日期的基础机制的新见解，并突出了TJSM基因组对桃子水果中的农艺性状相关的更多变化的潜力。
肉质果实形状的分子和遗传调控以及来自拟南芥和水稻的教训
肉质果实形状是影响水果使用和消费者偏好的重要外部品质性状。因此，改变果实形状已成为作物改良的主要目标之一。然而，人们对果实形状调控的潜在机制了解甚少。在本综述中，我们以番茄、黄瓜和桃子为例，总结了肉质果实形状调控遗传基础的最新进展。比较分析表明，OFP-TRM（OVATE 家族蛋白 - TONNEAU1 募集基序）和 IQD（IQ67 结构域）通路可能在调节果实形状方面有所保留，它们主要通过调节肉质果实物种之间的细胞分裂模式。有趣的是，发现 FRUITFULL（FUL1）、CRABS CLAW（CRC）和 1-氨基环丙烷-1-羧酸合酶 2（ACS2）的黄瓜同源物可调节果实伸长。我们还概述了拟南芥和水稻中 OFP-TRM 和 IQD 途径介导的果实形状调控的最新进展，并提出 OFP-TRM 途径和 IQD 途径通过整合植物激素（包括油菜素类固醇、赤霉酸和生长素）和微管组织来协调调节果实形状。此外，还展示了 OFP、TRM 和 IQD 家族成员的功能冗余和分歧。本综述概述了目前关于果实形状调控的知识，并讨论了未来研究中需要解决的可能机制。