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自 2017 年 FDA 批准嵌合抗原受体 (CAR) T 细胞以来，嵌合抗原受体构建体的设计和 CAR T 细胞疗法的制造取得了重大进展，从而提高了 CAR T 细胞在体内的持久性，并改善了某些血液系统恶性肿瘤的临床结果。尽管在某些患者中看到了显著的临床反应，但在实现持久的长期无肿瘤生存期、减少治疗相关的恶性肿瘤和毒性以及扩大可以用这种治疗方法治疗的癌症类型方面仍然存在挑战。仔细分析区分有效和次优 CAR T 细胞反应的生物学因素对于解决这些缺点至关重要。随着实验方法、单细胞技术和计算资源工具箱的不断扩展，人们对发现新方法来简化新 CAR T 细胞产品的开发和验证的兴趣日益浓厚。通过将这些方法纳入转化和临床工作流程，可以开发更好、更准确的预后和预测模型，以帮助指导和指导临床决策。在本综述中，我们简要概述了 CAR T 细胞制造的最新进展，并描述了用于选择性扩增特定表型亚群的策略。此外，我们回顾了评估 CAR T 细胞功能的实验方法，并总结了目前有可能改善 CAR T 细胞制造和预测临床结果的计算机模拟方法。
从基于物理的锂离子电池模型中提取和解释电化学阻抗谱 (EIS)
本文实现了一种高效算法，用于从基于物理的电池模型（例如 P2D 模型）中提取电化学阻抗谱 (EIS)。该数学方法与 EIS 的实验方法不同。在实验中，电压（电流）在很宽的频率范围内受到谐波扰动，并测量相应电流（电压）的幅度和相移。该实验方法可以在仿真软件中实现，但计算成本很高。此处的方法是从完整物理模型中确定局部线性状态空间模型。作为状态空间模型基础的四个雅可比矩阵可以通过对物理模型进行数值微分而得出。然后使用计算效率高的矩阵操作技术从状态空间模型中提取 EIS。该算法可以在瞬态过程中的某一时刻评估完整的 EIS，而与电池是否处于静止状态无关。该方法还能够分离全电池阻抗以评估部分 EIS，例如仅评估电池阳极。尽管这种部分 EIS 很难通过实验测量，但部分 EIS 为解释全电池 EIS 提供了宝贵的见解。© 2024 作者。由 IOP Publishing Limited 代表电化学学会出版。这是一篇开放获取的文章，根据知识共享署名 4.0 许可条款分发（CC BY，http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/），允许在任何媒体中不受限制地重复使用作品，只要正确引用原始作品。[DOI：10.1149/1945-7111/ad4399]
Babel的实验室：突出社区的综合材料数据管理需求
自动化实验方法正在迅速从研究对象本身过渡到作为材料研究中不可或缺的工具。货架硬件的可用性可用性，数据饥饿的机器学习方法传播到材料科学上的传播以及加速材料创新速度以满足气候变化的不断变化的需求，都有助于我们实验室中自动实验方法的采用。1 - 3令人眼花the乱的近期研究具有贡献工具，使该范式shi可以，包括新的开放硬件平台，4种优化和实验计划方法，5和5种以及在不同实验室共享过程的方法。6 - 8这种新发现的生成大量实验数据的能力随着新的机器学习和数据科学方法构建数据，9,10本身将其变成了一流的研究产品。11然而，在收集，组织，存储和共享此数据的系统上已经花费了很少的效果。作为一个研究社区，我们在很大程度上应用了现有的数据管理方法和文化，这些方法和文化围绕手动实验开发到自动化工作。这是针对初始演示项目并涉足ELD的工作，但是随着ELD的成熟并继续以自动化平台的形式生产有价值的数据，我们需要采用更好的数据管理实践。我们目前正在遵循的数据管理路径使我们想起了J. L. Borges在同名中想象的“ Babel库”
利用基因组编辑技术的基因治疗产品的质量及质量保证……
为了表征基因组编辑产品的脱靶效应，不仅需要通过计算机分析预测与目标基因序列相似序列的存在，还需要使用实验方法来分析整个人类基因组中潜在的脱靶位点[32-35]。寻找候选脱靶位点的实验方法包括在基因组编辑过程中在切割位点引入合成 DNA 标签，并在整个基因组中分析该标签的掺入情况的方法（GUIDE-seq）[36]，以及 DIGENOME-seq [37, 38]、CIRCLE-seq [39] 和 SITE-seq [40] 等方法，它们使用从细胞中提取的基因组来寻找基因组编辑酶可能的切割位点。这些分析可能包括识别癌症相关基因中的单核苷酸变异 (SNV)/插入和缺失 (Indel) 和拷贝数变异 (CNV) 等突变[41]。通过计算机分析和实验方法检测到的脱靶候选位点是否确实发生了切割或缺失的潜在方法包括对经过基因组编辑的细胞进行全基因组测序（WGS）[33, 35] 和扩增子测序，通过 PCR 扩增候选位点并进行深度测序 [42]。在这些分析中，检测灵敏度取决于碱基序列的读取深度。但是，由于新一代测序（NGS）的错误频率，检测脱靶效应非常困难，其发生频率低于0.1％（表1）。
方法开发人员的寡核苷酸设计指南
摘要简介：开发新方法对于在科学方面取得巨大的飞跃，开辟了新的研究途径至关重要，但是很少描述方法开发背后的过程。涵盖的区域：在过去的二十年中，我们使用寡核苷酸偶联的抗体来可视化蛋白质蛋白质相互作用，从而开发了几种新方法，例如原位PLA，Proxhcr和Molboolean。 在此，我们描述了这些方法的寡核苷酸系统背后的基本原理。 本文的主要目的是为研究人员提供有关我们在设计这些方法时如何看待的描述。 我们还详细描述了方法如何工作以及如何解释结果。 专家意见：了解该方法的工作方式对于选择适当的实验方法很重要。 我们还希望本文可能是年轻研究人员进入方法开发领域的灵感。 看到问题是开发解决方案的动力。涵盖的区域：在过去的二十年中，我们使用寡核苷酸偶联的抗体来可视化蛋白质蛋白质相互作用，从而开发了几种新方法，例如原位PLA，Proxhcr和Molboolean。在此，我们描述了这些方法的寡核苷酸系统背后的基本原理。本文的主要目的是为研究人员提供有关我们在设计这些方法时如何看待的描述。我们还详细描述了方法如何工作以及如何解释结果。专家意见：了解该方法的工作方式对于选择适当的实验方法很重要。我们还希望本文可能是年轻研究人员进入方法开发领域的灵感。看到问题是开发解决方案的动力。
o r i g i n a l r e s a r c h c h生物信息学和综合实验方法，用于识别和验证共表达的与铁毒相关的gen
目的：骨关节炎（OA）是全世界最常见的关节疾病，是老年人的残疾和慢性疼痛的主要原因。FROFROPTOSOS。是一种以异常的铁代谢和活性氧累积为特征的程序性细胞死亡。但是，它在OA中的作用尚不清楚。方法：为了确定来自OA患者的关节软骨和滑膜样品共表达的螺旋病标志物，进行了硅分析中进行分析。分析了签名基因，并使用ROC曲线预测模型对结果进行了评估。签名基因和铁凋亡表型。使用QRT-PCR确定来自OA患者的样品中非编码RNA的表达水平。CERNA网络分析结果已使用双葡聚糖酶测定确认。结果：JUN，ATF3和CDKN1A被鉴定为OA-和铁铁相关的签名基因。GSEA分析表明，这些基因在免疫和炎症反应中的富集以及氨基酸代谢。cibersort算法在软骨中显示T细胞与这些特征基因之间的负相关性，并且在滑膜中呈正相关。此外，RP5-894D12.5和FAM95B1通过竞争性结合与miR-1972，miR-665和miR-181a-2-3p来调节JUN，ATF3和CDKN1A的表达。此外，在小鼠和人OA滑膜和软骨组织中，JUN，ATF3和CDKN1A表达都被下调。在体内，在OA软骨和滑膜中都下调了GPX4。然而，GPX4和GSH被下调，而在患者OA软骨和滑膜样品中，亚铁离子被上调，表明铁铁蛋白酶与OA的发病机理有关。QRT-PCR恶魔表明，MiR-1972，RP5-894D12.5和FAM95B1在OA组织中差异表达。通过双速度左右分析证实了MiR-1972与JUN之间的相互作用，以及RP5-894D12.5，MiR-1972和JUN之间的CERNA调节机制。结论：这项研究确定JUN，ATF3和CDKN1A可能是关节滑膜炎和OA的诊断生物标志物和治疗靶标。此外，我们的发现表明RP5-894D12.5/miR-1972/jun是OA中潜在的CERNA调节轴，从而深入了解了铁毒性和OA之间的联系。关键词：骨关节炎，铁毒炎，滑膜炎，生物信息学，JUN，ATF3，CDKN1A，GPX4
(SL-7-27) - 船舶结构委员会
本报告是描述 SL-7 仪表计划的一组船舶结构委员会报告之一。该计划是海陆服务公司、美国航运局和船舶结构委员会共同资助的一项计划，是私营企业、船级社和政府之间合作的典范。该计划的目标是提高对船舶船体结构性能的了解以及其设计中使用的分析和实验方法的有效性。虽然该计划的实验和分析以 SL-7 集装箱船为重点，并且大量开发的数据与该船特别相关，但该计划的结论将完全具有普遍性，因此适用于任何水面船舶结构。
肾脏癌研究计划创意发展奖
研究方法：科学原理和实验方法应该证明对肾癌的批判性理解和深入分析。实验策略可能是新颖的，也可以基于从先前发布的数据和/或提出的初步数据中得出的强大原理。应该明确定义研究设计和方法的可行性，应明确计划如何实现该项目的拟议目标。此外，应确定资源，并通过文档支持可用性。应解决对潜在问题和陷阱的识别。如果适用，应包括针对拟议研究的统计分析计划，以及支持设计和样本量的功率分析。
γ-TiAl高周疲劳行为的最新进展...
摘要 回顾了 γ -TiAl 合金的高周疲劳 (HCF) 性能，特别是关于近阈值循环载荷范围内的变形机制。通过检查层状取向和厚度对 HCF 阈值的影响，除了更传统的微观结构考虑因素（例如晶粒尺寸或层状群的体积分数）之外，还评估了改善 HCF 的 γ -TiAl 微观结构的因素。最后，调查了实验方法和加载策略，以确定改进 γ - TiAl 合金 HCF 测试的技术。在此，我们考虑了不同方法的保守性，以及以合适的分辨率测量层状 γ -TiAl 微观结构在 HCF 下的局部机械行为的可能性。
生物学，生物化学和遗传学
生物应用 /应用生物学生物学模块旨在为学生提供原核生物和真核细胞的形态和功能组织，重点介绍了描述性方面以及生物化学和细胞生理学的基本概念，以了解细胞作为基本生物体的基本功能。本课程的目的是学习生物组织不同层次的生物结构的建设性逻辑，管理不同生物系统功能的原理，实验方法的学习及其在生物学现象研究中的应用。学生将学习调节细胞活性，基因表达和遗传物质传播的统一机制。