威康基金会桑格研究所 – 硕士论文 使用 prime editing 随机化基因调控区域 通过分析全基因组染色质数据集并将研究结果与文献检索相结合,确定了有趣的增强子区域。 使用 CRISPR prime editing 将多个重组酶识别序列插入这些基因的增强子簇中。 创建了具有稳定 prime editor 表达的细胞系,可实现 loxP 位点 80% 以上的插入效率(这些细胞系现在被实验室中的其他人广泛使用)。 在实验室中建立了具有 Cas9 富集的靶向牛津纳米孔测序。 与帝国理工学院的一个团队合作学习该方法。 在 2022 年国际哺乳动物合成生物学会议上以海报形式展示了我的工作。 2021 年 11 月 12 日,法国斯特拉斯堡
通过组蛋白变体CENP-A的存在来定义并保持表观遗传学的定义和维持。尚不完全了解如何指定中心质体CENP-A位置并通过DNA复制确切地保持。 最近发布的端粒到核(T2T)基因组组件包含第一个完整的人类丝粒序列,为检查CENP-A位置提供了新的资源。 在多个细胞分裂之后,在同一细胞系列的克隆中映射CENP-A位置到T2T组装中高度相似的CENP-A位置。 相比之下,在不同人类细胞系的几个centromeres上表现出丝粒CENP-A上乳束,这证明了CENP-A富集的位置和人类细胞之间的KineTochore re裂位点不同。 在整个细胞周期中,通过DNA复制保持了其精确的位置,沉积在G1相中的CENP-A分子。 因此,尽管在DNA复制过程中CENP-A稀释,但CENP-A仍将CENP-A精确地重新加载到子丝粒内的相同序列上,从而在人类细胞中保持独特的丝粒身份。如何指定中心质体CENP-A位置并通过DNA复制确切地保持。最近发布的端粒到核(T2T)基因组组件包含第一个完整的人类丝粒序列,为检查CENP-A位置提供了新的资源。在多个细胞分裂之后,在同一细胞系列的克隆中映射CENP-A位置到T2T组装中高度相似的CENP-A位置。相比之下,在不同人类细胞系的几个centromeres上表现出丝粒CENP-A上乳束,这证明了CENP-A富集的位置和人类细胞之间的KineTochore re裂位点不同。在整个细胞周期中,通过DNA复制保持了其精确的位置,沉积在G1相中的CENP-A分子。因此,尽管在DNA复制过程中CENP-A稀释,但CENP-A仍将CENP-A精确地重新加载到子丝粒内的相同序列上,从而在人类细胞中保持独特的丝粒身份。
Twist Bioscience 文库制备和靶向富集检测是一种高度模块化的靶向富集下一代测序 (NGS) 试剂盒,具有从固定面板到全外显子组测序的各种应用。该试剂盒利用基因组 DNA (gDNA) 的片段化、连接和扩增来制备 NGS 文库,并利用基于珠子的杂交文库捕获来富集文库。Twist Bioscience 为用户提供了高度的灵活性,以满足实验室的需求,包括酶促或机械片段化、使用 Twist 全长组合双 (CD) 索引适配器或通用双索引 (UDI) 引物的两组不同的索引化学反应、单重或多重富集选项、用于文库富集的市售固定面板和定制面板选项,以及“标准”16 小时杂交选项或可运行 15 分钟至 4 小时的“快速”杂交选项。整个手动文库制备和靶向富集方案可以在最短一天或最多三天内完成。
2018年估计妇女中约有210万名新诊断的乳腺癌病例。三重阴性乳腺癌(TNBC),其特征是缺乏激素受体(雌激素和孕激素),缺乏表皮生长因子受体2和预后不良的表达,代表所有乳腺癌的10-20%。因此,这种类型的乳腺癌的新生物标志物的鉴定与早期诊断高度相关。此外,TNBC肽配体可用于设计专门针对这种乳腺癌的强大药物输送系统。因此,以下研究旨在选择和表征新型肽的新肽,用于乳腺癌鼠类乳腺癌细胞系-4T1。使用噬菌体显示,将7和12个氨基酸随机肽库筛选在4T1细胞系上。进行了四轮,加上使用3T3鼠成纤维细胞系的反选择。表征了富集的选择性肽,并通过免疫荧光和流式细胞仪分析证实了其与4T1组织样品的结合能力。所选肽(4T1PEP1 - CPTASNTSC和4T1PEP2 -EVQSSKFPAHVS)在几轮选择中富集,并表现出特定的与4T1细胞系的结合。
都柏林 2,爱尔兰 电子邮件:connons@tcd.ie,iamartin@tcd.ie 吖内酯是环化氨基酸衍生物,在手性催化剂存在下可以进行动态动力学拆分。1 过去三十年来,它们一直受到有机化学家的极大关注,因为它们具有大量可能的转化;包括对映选择性开环反应。与此过程相关的一个关键限制是缺乏非醇衍生的亲核试剂;对映选择性硫解 2 和氨解 3 是理想的,但目前范围有限。该项目旨在通过间接氨解外消旋吖内酯来开发一种可重复和对映选择性的肽连接。这将成为肽化学家合成对映体富集的非天然氨基酸的有用资源。为此,使用胺亲核试剂取代苯酚酯中间体以避免直接非选择性加成的问题,并且开发了一类新型、高度可改性的金鸡纳衍生离子对催化剂。
靶向肿瘤相关抗原 (TAA) 的双特异性 T 细胞接合剂 (TCE) 是一种经过验证的治疗策略,但迄今为止,它们在实体瘤中的成功率有限。关键挑战包括健康组织中 TAA 表达的靶向、肿瘤外毒性、广泛的全身性 T 细胞激活引起的细胞因子释放综合征以及阻碍抗肿瘤免疫的免疫抑制性实体瘤微环境 (TME)。为了解决这些限制,我们开发了选择性效应增强细胞接合剂 (SEECR),这是一类新型的肿瘤可激活、免疫细胞接合双特异性分子,旨在在外周组织中保持最低活性,同时在 TME 中富集的蛋白酶切割后选择性激活。SEECR-T 分子旨在同时接合癌细胞上的 TAA、T 细胞上的 CD3 并结合共刺激结构域以增强 T 细胞活化和功能。
2。我们的业务CIL总部位于美国马萨诸塞州的图克斯伯里,是全球领先的稳定同位素和稳定同位素标记的化合物的领先生产商。cil是全球医疗企业Otsuka Group的一部分,并在世界各地运营设施。CIL专门研究将稳定(非放射性)同位素与天然丰度分离的过程,然后使用这些高度富集的碳,氢,氮和氧气将生化和有机化合物标记。我们的化学家用稀有,高度有价值的同位素(例如,2H或D,13或D,13C,15N,18O)代替常见原子(例如1H,12c,14n,16o),以便可以使用各种技术(包括质谱(MS)和核磁共振成分(NMR)轻松测量最终产品。CIL的产品用于全球实验室,医疗,政府,学术中心和医疗机构的研究应用。它们也用于商业应用中,例如药品和电子产品,以提高产品质量和寿命。
摘要:手性氮杂环丙烷是天然产物和各种重要靶分子中发现的重要结构基序。它们是合成手性胺的多功能构建块。虽然催化剂设计的进步使得对映选择性氮杂环丙烷活化烯烃的方法成为可能,但简单且丰富的烷基取代烯烃带来了重大挑战。在这项工作中,我们介绍了一种利用平面手性铑茚基催化剂促进未活化烯烃对映选择性氮杂环丙烷化的新方法。这种转化表现出显着程度的功能基团耐受性,并显示出优于活化烯烃的优异化学选择性,从而提供了多种对映体富集的高价值手性氮杂环丙烷。计算研究揭示了一种逐步氮杂环丙烷化机制,其中烯烃迁移插入起着核心作用。该过程形成了有张力的四元金属环,并作为整个反应中的对映体和速率决定步骤。
突触体传统上是从啮齿动物或死后人类脑组织中富集的,但啮齿动物模型缺乏人类特有的突触特征,而死后组织中突触体的功能受到死后间隔的限制,并且通常仅显示疾病终点。此外,由于道德问题和可用性问题,只有少数研究针对人类样本。然而,神经类器官 (NO) 已成为分离完整和活的人类神经末梢以研究人类特有的突触传递方面的可能新来源。此外,突触体的富集通常使用密度梯度离心进行,这需要大量的起始材料。在本研究中,我们开发了一种应用差速离心方案从人类 NO 中富集突触结构的方法。然后,我们使用基于质谱的定量蛋白质组学来记录突触和生长锥特异性蛋白的富集,并在 KCl 刺激下进行定量磷酸化蛋白质组学来证明衍生突触结构的活力和生理功能。
摘要 IGF1R 信号在大脑中的作用及其与衰老和神经功能障碍的关系存在争议。由于研究表明,低 IGF1R 活性会持续改善衰老小鼠心脏的心肌生物能和功能,但对年轻小鼠心脏则无影响,因此研究这种与大脑衰老的关系十分重要。我们使用 CRISPR 技术开发了一种小鼠模型,用百岁老人中富集的人类 R407H(IGF1R R407H)变体的等效物有针对性地替换小鼠 IGF1R,从而降低 IGF1R 蛋白活性。中年小鼠表现出认知能力的提高,因此可能模拟衰老大脑中的 IGF1R 信号,类似于衰老心脏中报道的情况。由于阿尔茨海默病 (AD) 是一种与年龄相关的疾病,特定的 IGF1R R407H 通路可以作为基于 AAV 载体的 AD 小鼠以及整体大脑衰老的治疗靶点。关键词:IGF1R 信号传导、IGF1R R407H 变体、脑老化、认知、阿尔茨海默病