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World File Search System对破缺
DNA损伤反应和不匹配修复基因缺陷在晚期和转移性前列腺癌
摘要：多达25％的晚期前列腺癌（PCA）中存在DNA损伤反应（DDR）和相关基因的改变。最常改变的基因参与同源重组修复，fanconi贫血和不匹配修复途径，并且它们的降低导致DDR-DEDE的表型的高度异构谱。这些改变的一半以上涉及非BRCA DDR基因。从治疗性的角度来看，多ADP-核糖聚合酶抑制剂在具有BRCA2和BRCA1改变的肿瘤中具有强大的临床效率。不匹配修复 - 具有较高的PCA和CDK12降低的PCA子集，容易受到免疫检查点抑制剂的影响。新兴数据指向具有ATM降低的PCA中ATR抑制剂的效率。仍然，对于大多数非BRCA DDR改变，没有足够的治疗意义明确，并且尚未确定成功的靶向治疗选择。
利用粲偶素定向流探测倾斜的夸克胶子等离子体
基于输运模型，结合现实的三维体介质展开，研究了粲偶素定向流。非中心对称核-核碰撞可以产生具有对称破缺纵向分布的旋转夸克胶子等离子体（QGP）。在√sNN=200GeVAu+Au半中心碰撞中，粲偶素在初始硬过程中原始产生，它们主要被初始高温倾斜源解离，然后移出体介质，以保留介质的早期信息。原始产生的粲偶素的动量分布受QGP流体动力学膨胀的影响较小，因为其倾斜形状被稀释。这种有偏解离可以产生J/ψ和ψ(2S)的定向流，它们比轻带电强子和开重味子的值大得多。粲偶素定向流有助于量化原子核-原子核碰撞中 QGP 初始能量密度的快度奇数分布。
手册 RH4705.ai
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肠道微生物组的全身代谢耗竭破坏了对黑色素瘤免疫疗法的反应
免疫疗法已被证明是与转移性黑色素瘤作斗争的患者的福音，显着改善了其临床结合和整体生活质量。在动物模型和人类患者中都建立了肠道微生物组组成与免疫疗法的效率之间的引人注目的联系。然而，肠道微生物影响治疗结果的精确生物学机制知之甚少。使用来自黑色素瘤患者的680个粪便元基因组的鲁棒数据集，构建了元基因组组装基因组（MAGS）的详细目录，以探索肠道微生物组的组成和功能特性。我们的研究发现了明显的发现，从而加深了肠道微生物与黑色素瘤免疫疗法的效率之间的复杂关系。，我们发现了具有良好治疗结果的患者的特定元基因组学，其特征是MAGS的普遍存在具有总体代谢潜力和多糖利用率的促值，以及负责钴胺素和氨基酸产生的那些。此外，我们对以其免疫调节作用而闻名的短链脂肪酸的生物合成途径的研究表明，这些途径在特定的MAG中具有差异的丰富性。除其他外，依赖钴胺素的木材 - 乙酸合成的Ljungdahl途径与对黑色素瘤免疫疗法的反应直接相关。
TNF 是表观遗传学上不同的人类破骨细胞前体的稳态调节剂
摘要 目的 虽然确切的人类前体细胞尚未确定，但循环中的髓系前体细胞负责出生后破骨细胞 (OC) 的分化和骨骼健康。增强的破骨细胞生成导致类风湿性关节炎 (RA) 中的关节破坏，而肿瘤坏死因子 (TNF) 是一种众所周知的促破骨细胞生成因子。在此，我们研究了核因子 κ-Β 配体的受体激活剂 (RANK-L) 与 TNF 之间的相互作用，RANK-L 对髓系前体的融合和 OC 的正常发育必不可少，而 TNF 则指导来自人外周血的不同前 OC 群体的分化。方法 流式细胞术细胞分选和分析用于评估髓系群体分化为 OC 的潜力。转录组学、表观遗传分析、受体表达和抑制剂实验用于揭示 RANK-L 和 TNF 信号传导层次。结果 TNF 可作为 CD14 + 单核细胞 (MO) 分化为 OC 的关键稳态调节剂，通过抑制破骨细胞生成以有利于巨噬细胞发育。相反，一种以前未发现的 CD14 − CD16 − CD11c + 髓系前 OC 群体不受这种负调节。在健康的 CD14 + MO 中，TNF 通过 TNFR1-IKK β 依赖性途径驱动 RANK 启动子的表观遗传修饰并停止破骨细胞生成。在 RA 患者亚组中，CD14 + MO 表现出改变的表观遗传状态，导致 TNF 介导的 OC 稳态失调。结论这些发现从根本上重新定义了 RANK-L 和 TNF 之间的关系。此外，他们还鉴定出了一种新的人类循环非 MO OC 前体池，与 MO 不同，它们在表观遗传上经过预处理以忽略 TNF 介导的信号传导。在 RA 中，这种表观遗传预处理发生在 MO 区室中，从而导致该通路失败的病理后果。
研究文章 | 2022 年 1 月 15 日 自身抗原缺失时 IgD 等位基因排除缺陷
相当一部分外周 B 细胞具有自身反应性，目前尚不清楚这种潜在有害细胞的激活是如何调节的。在这项研究中，我们表明不同的激活阈值或 IgM 和 IgD BCR 可根据发育过程中的不同要求调整 B 细胞激活。我们依靠自身反应性 3-83 模型 BCR 来生成和分析在两种不同背景下仅表达自身反应性 IgD BCR 的小鼠，这些小鼠根据同源抗原的存在与否确定了两个阶段的自身反应性。通过将这些模型与表达 IgM 的对照小鼠进行比较，我们发现与 IgM 相比，IgD 在体内具有更高的激活阈值，因为它需要自身抗原来实现正常的 B 细胞发育，包括等位基因排斥。我们的数据表明，IgM 提供了在早期发育阶段触发编辑任何自身反应特异性所需的高灵敏度，包括那些能够与自身抗原弱相互作用的特异性。相比之下，IgD 具有独特的能力，可以忽略弱相互作用的自身抗原，同时保留对高亲和力抗原的反应性。这种 IgD 功能使成熟的 B 细胞能够忽略自身抗原，同时仍然能够有效应对外来威胁。免疫学杂志，2022，208：293 302。T
![arXiv:2101.00175v1 [quant-ph] 2021 年 1 月 1 日](/simg/1\1a2607433483a4b46b93ee856d3592ccd5e40cd0.webp)
arXiv:2101.00175v1 [quant-ph] 2021 年 1 月 1 日
近年来，PT 对称非厄米系统因各种有趣的特性而在理论和实验上得到了广泛的研究和探索。在本文中，我们重点研究了三量子比特系统的动力学特征，其中一个特征是在局部 PT 对称哈密顿量下演化的。发现了熵演化过程中一种新的异常动力学模式，该模式呈现出一种参数相关的稳定态，这是由 PT 对称破缺相中哈密顿量的非厄米性决定的。二体子系统的纠缠和互信息可以超过初始值，这在厄米和两量子比特 PT 对称系统中是不存在的。此外，在具有核自旋的四量子模拟器上实现了对非厄米系统中具有非零熵和纠缠的稳定态的实验演示。我们的工作揭示了三量子比特 PT 对称系统中独特的动态特性，为在量子计算机上实现多方非厄米系统的实际量子模拟铺平了道路。
通过原子层取代调整二维过渡金属磷三硫属化物中的自旋波
摘要 二维 (2D) 范德华过渡金属磷三硫属化物家族由于其固有的 2D 反铁磁性而重新引起了人们的关注，这证明它们是单层极限下自旋电子学和磁子学中前所未有且高度可调的构建块。在此，受 Janus 过渡金属二硫属化物中表现出的原子取代潜能的启发，我们从第一性原理研究了基于 MnPS 3 和 NiPS 3 的硒化 Janus 单层的晶体、电子和磁性结构。此外，我们计算了磁振子色散并进行实时实空间原子动态模拟，以探索自旋波在 MnPS 3 、NiPS 3 、MnPS 1.5 Se 1.5 和 NiPS 1.5 Se 1.5 中的传播。我们的计算预测磁各向异性将大幅增强，并会出现较大的 Dzyaloshinskii-Moriya 相互作用，这是由于 2D Janus 层中诱导的反演对称性破缺所致。这些结果为开发 Janus 2D 过渡金属磷三硫属化物铺平了道路，并凸显了它们在磁子应用方面的潜力。
气候变化破坏了高山生态系统中植物和土壤微生物养分循环的季节性耦合
fi g u r e 2在高山草原中评估的全范围植物和土壤特性的季节性动态。属性按最大季节进行分组：（a）春季； （b）夏天； （c）秋天。在灌木膨胀下，某些特性明显更高（ + s）或较低（-s）。AOA，氨氧化古细菌； AOB，氨氧化细菌； CBH，几核酸水解酶； GLC，β-葡萄糖酶； NAG，N-乙酰葡萄糖氨基酶； Per，过氧化物酶； Pho，磷酸酶；痘，苯酚氧化酶； URE，尿布； xyl，β-二基固醇酶。 出于可视化的目的，将所有变量缩放为平均值为0，标准偏差为1。 对未量化的数据进行统计分析n = 8。 有关更多详细信息，包括实际均值和SE，精确的P和χ2值，请参见表S1 – S3。AOA，氨氧化古细菌； AOB，氨氧化细菌； CBH，几核酸水解酶； GLC，β-葡萄糖酶； NAG，N-乙酰葡萄糖氨基酶； Per，过氧化物酶； Pho，磷酸酶；痘，苯酚氧化酶； URE，尿布； xyl，β-二基固醇酶。出于可视化的目的，将所有变量缩放为平均值为0，标准偏差为1。对未量化的数据进行统计分析n = 8。有关更多详细信息，包括实际均值和SE，精确的P和χ2值，请参见表S1 – S3。
量子连接
肖恩·哈特诺尔。高能物理学和凝聚态物理学围绕着对称破缺和重正化群等共同的基本概念展开，并共享费曼图和拓扑等核心数学机制。这导致了这两个领域之间历史上卓有成效的交汇。在过去的几十年里，出现了两个新的联系点。首先，全息对偶性已经证实，黑洞视界的经典演化精确地捕捉了物质强量子相的耗散动力学。近年来，这种联系已经超越了简单的相关函数（描述粗粒度热平衡方法），转向了更细微的可观测量，可以探测多体量子混沌的特征。与这种转变密切相关的是 Sachdev-Ye-Kitaev (SYK) 模型的出现。该模型具有成熟的全息理论的许多特征（和局限性），但在微观上更接近传统的凝聚态哈密顿量，并且受到更大的技术控制。其次，多体量子纠缠同时成为这两个领域的组织原则。看来，支持全息引力出现的量子态具有纠缠结构，可能类似于物质拓扑非平凡相的纠缠结构。充实这种联系有望成为未来进步的源泉。