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World File Search System扩增
人类TBC1D3基因家族的独立扩增、选择和高变异性
西奈，纽约，纽约州，美国 3. 斯坦福大学医学院生物化学系，斯坦福，加利福尼亚州，美国 4. 斯坦福大学医学系，心血管医学分部，斯坦福，加利福尼亚州，美国 5. 美国密苏里州堪萨斯城儿童仁慈医院基因组医学中心儿科系 6. 美国密苏里州堪萨斯城密苏里大学医学院儿科系 7. 美国华盛顿州西雅图华盛顿大学霍华德休斯医学研究所
靶向MTOR和Survivin同时通过抑制DNA损伤修复并扩增有丝分裂
电子邮件：Ashraf.abousalem@gmail.com *** Mohamed A. Ismail Mansoura University，科学学院，化学系，Mansoura 35516，埃及。 电子邮件：mismail@mans.edu.eg 1。 简介电子邮件：Ashraf.abousalem@gmail.com *** Mohamed A. Ismail Mansoura University，科学学院，化学系，Mansoura 35516，埃及。电子邮件：mismail@mans.edu.eg 1。简介
KMT2A基因扩增在急性髓样白血病中的作用，
尽管赖氨酸甲基转移酶2a（KMT2A）基因重排，代表急性髓样白血病（AML）中常见的致癌事件，但KMT2A扩增的频率较小，并且与独特的临床和遗传特征相关。我们对三名与KMT2A基因扩增相关的AML患者进行了回顾性分析，并意识到了文献综述。所有病例都是男性，中位年龄为65岁。其中两个已经接受了以前的疗法。骨髓的Aspi速率涂片显示出明显的发育异常，并在红细胞系列中具有细胞质液泡。在所有情况下，细胞遗传学研究均显示出复杂的核型和原位杂交（FISH）分析（FISH）分析显示所有患者的DEL（5Q）和TP53基因的缺失和两名患者的DEL（7Q）。在两名患者中进行了下一代测序（NGS）面板，在这些情况下，建立了TP53的双重变化。所有患者均对治疗难治性，并且出现KMT2A扩增后的74天生存期。总而言之，我们的结果表明，我们的KMT2A扩增患者具有文献中描述的相同的临床和遗传特征：先前治疗，高龄，发育异常的迹象，具有频繁空泡，复杂的Karyotype和TP53突变的患者中存在扩增。
小分子药物在过继细胞治疗体外扩增过程中的神奇作用
在过去的几十年中，过继性细胞疗法在治疗癌症方面的进展已使复发/难治性或晚期恶性肿瘤患者获得了前所未有的缓解。然而，细胞衰竭和衰老限制了 FDA 批准的 T 细胞疗法对血液系统恶性肿瘤患者的疗效以及这种方法在治疗实体瘤患者中的广泛应用。研究人员正在通过专注于效应 T 细胞的制造过程来解决当前的障碍，包括工程方法和体外扩增策略来调节 T 细胞分化。在这里，我们回顾了当前用于增强体外制造过程中 T 细胞扩增、持久性和功能的小分子策略。我们进一步讨论了双靶向方法的协同优势，并提出了新型血管活性肠肽受体拮抗剂 (VIPR-ANT) 肽作为增强细胞免疫疗法的新兴候选药物。
基因靶向构建体的尺寸确定、稳定性和克隆重复扩增
人类基因组内特定位点的异常微卫星重复扩增会导致几种不同的、可遗传的、主要为神经系统的疾病。由于细菌载体中此类重复的不稳定性，尤其是大量重复扩增，因此创建这些疾病的模型是一项挑战。设计用于更精确的基因组工程项目（例如工程敲入小鼠）的构造体被证明是一项更大的挑战，因为这些不稳定的重复需要大量的克隆步骤才能引入同源臂或选择盒。在这里，我们报告了我们在 C9orf72 基因中克隆大型六核苷酸重复的努力，该基因源自 BAC 构造体，源自 C9orf72 -ALS 患者。我们提供了详细的方法，用于有效确定细菌中的重复大小和生长条件，以促进生长和亚培养期间的重复保留。我们报告说，亚克隆到线性载体中可显著提高稳定性，但取决于 DNA 复制通过重复的相对方向，这与之前的研究一致。我们设想这里提出的研究结果将提供一种相对简单的途径来维持大范围的微卫星重复扩增，从而有效地克隆到载体中。
ERBB2 扩增或突变的肺癌中 HER2 介导的细胞毒药物内化
标题：ERBB2 扩增或突变型肺癌中 HER2 介导的细胞毒药物内化 标题：抗 HER2 ADC 在肺癌中的抗肿瘤活性 Bob T. Li 1,13#* 、Flavia Michelini 2,3#* 、Sandra Misale 4#* 、Emiliano Cocco 3 、Laura Baldino 2,3 、Yanyan Cai 2,3 、Sophie Shifman 3 、Hai-Yan Tu 1,5 、Mackenzie L. Myers 1 、Chongrui Xu 1,5 、Marissa Mattar 4,6 、Inna Khodos 4,6 、Megan Little 4,6 、Besnik Qeriqi 4,6 、Gregory Weitsman 7 、Clare J. Wilhem 1 、Alshad S. Lalani 8 、Irmina Diala 8 、Rachel A. Freedman 9 、 Nancy U. Lin 9 、 David B. Solit 1,3,11,13 、 Michael F. Berger 2,3,11 、 Paul R. Barber 7,12 、 Tony Ng 7,12 、 Michael Offin 1,13 、 James M. Isbell 10,13 、 David R. Jones 10,13 、 Helena A. Yu 1,13 、 Sheeno Thyparambil 14 、廖伟丽 14 、Anuja Bhalkikar 14 、Fabiola Cecchi 15 、David M. Hyman 1,13 、Jason S. Lewis 13,16,17 、Darren J. Buonocore 2 、Alan L. Ho 1,13 、Vicky Makker 1,13 、Jorge S. Reis-Filho 2,3 , 佩德拉姆Razavi 1,13、Maria E. Arcila 2、Mark G. Kris 1,13、John T. Poirier 1,4、Ronglai Shen 18、Junji Tsurutani 19、Gary A. Ulaner 4,13,14、Elisa de Stanchina 4,6、Neal Rosen 4,20、Charles M. Rudin 1,13 和毛里齐奥·斯卡尔特里蒂 2,3,20* 。 1 美国纽约州纽约市纪念斯隆凯特琳癌症中心医学系 2 美国纽约州纽约市纪念斯隆凯特琳癌症中心病理学系 3 美国纽约州纽约市纪念斯隆凯特琳癌症中心人类肿瘤学和发病机制项目 4 美国纽约州纽约市纪念斯隆凯特琳癌症中心分子药理学项目 5 中国广州广东省人民医院、广东省医学科学院广东省肺癌研究所 6 美国纽约州纽约市纪念斯隆凯特琳癌症中心抗肿瘤评估核心设施 7 英国伦敦国王学院 Richard Dimbleby 癌症研究系 8 美国加利福尼亚州洛杉矶 Wilshire Blvd 10880 Puma Biotechnology 90024 美国波士顿丹娜—法伯癌症研究所肿瘤内科系 10美国纽约州约克 11 美国纽约州纽约市纪念斯隆凯特琳癌症中心分子肿瘤学中心 12 英国伦敦大学学院保罗奥戈曼大楼伦敦大学学院癌症研究所 13 美国纽约州纽约市威尔康奈尔医学院 14 美国马里兰州罗克维尔 mProbe Inc 15 美国马里兰州盖瑟斯堡阿斯利康 16 美国纽约州纽约市纪念斯隆凯特琳癌症中心放射科 17 美国纽约州纽约市纪念斯隆凯特琳癌症中心放射化学和分子成像探针核心 18 美国纽约州纽约市纪念斯隆凯特琳癌症中心流行病学和生物统计学系 19 日本东京昭和大学肿瘤医学系高级癌症转化研究所 20 纽约纪念斯隆凯特琳癌症中心分子治疗中心纽约州约克
可溶性 RAGE 可预防 1 型糖尿病扩增功能性调节性 T 细胞
1 型糖尿病是一种无法治愈的自身免疫性疾病，由于可重复性危机，有希望的治疗方法的临床转化受到阻碍。在这里，两个独立的研究中心通过短期施用晚期糖基化终产物受体 (sRAGE) 拮抗剂来预防小鼠糖尿病。用 sRAGE 治疗可增加胰岛、胰腺淋巴结和脾脏内的调节性 T 细胞 (T regs)，从而提高胰岛胰岛素的表达和功能。T reg 耗竭可消除糖尿病保护作用，并显示依赖于使用基因敲除小鼠拮抗 RAGE。用 RAGE 配体治疗的人类 T regs 下调了抑制、迁移和 T reg 稳态的基因 (FOXP3、IL7R、TIGIT、JAK1、STAT3、STAT5b、CCR4)。 sRAGE 逆转了抑制功能的丧失，其中 T regs 增加了增殖并抑制了常规 T 细胞分裂，证实了 sRAGE 扩增了功能性人类 T regs。这些结果突出了 sRAGE 是一种预防糖尿病的有吸引力的治疗方法，在多个研究中心和人类 T 细胞中显示出有效性和可重复性。
有效扩增克隆插入片段和人类基因组 DNA 中的长靶标
摘要 我们利用聚合酶链式反应 (PCR) 从人类基因组 DNA 中扩增出长达 22 kb 的 3-珠蛋白基因簇，并从噬菌体 A DNA 中扩增出长达 42 kb 的 3-珠蛋白基因簇。我们还直接从重组 A 斑块中扩增出 91 个 9-23 kb 的人类基因组插入片段。为此，我们增加了 pH 值，添加了甘油和二甲基亚砜，减少了变性时间，增加了延伸时间，并使用了具有 3'-至-5'-外切酶或“校对”活性的次级热稳定 DNA 聚合酶。我们的“长 PCR”方案通过使用较低水平的聚合酶和温度和盐条件进行特定引物退火，保持了基因组 DNA 中目标所需的特异性。扩增10-40 kb DNA序列的能力将为基因组图谱和测序带来PCR的速度和简便性，并促进分子遗传学研究。
强直性肌营养不良症 2 型中长度 CNBP 扩增等位基因...
摘要 2 型强直性肌营养不良 (DM2) 是由 CNBP 基因中的 CCTG 重复扩增引起的，该扩增包含 75 至 >11,000 个单位，具有广泛的嵌合性，因此对完全扩增的等位基因进行测序具有挑战性。为了克服这些限制，我们使用无 PCR 的 Cas9 介导纳米孔测序在 9 名 DM2 患者的单核苷酸水平上表征了 CNBP 重复扩增。使用此策略可以精确评估正常和扩增等位基因的长度，与传统方法一致，并揭示了嵌合性的程度。我们还对整个 ~50 kbp 的扩增进行了测序，这在 DM2 或任何其他重复扩增疾病中都是前所未有的。我们的方法精确地计算了重复次数并确定了短中断和不间断等位基因的重复模式。有趣的是，在扩增的等位基因中，只有两个 DM2 样本具有预期的纯 CCTG 重复模式，而其他七个样本在 3 ' 端也呈现出 TCTG 阻断，这在 DM2 患者中以前从未报道过，但在此通过正交方法得到证实。所展示的方法同时确定了重复长度、结构/基序和体细胞嵌合程度，有望改善 DM2 的分子诊断并实现更准确的基因型-表型相关性，从而在临床试验中更好地对 DM2 患者进行分层。
用于扩增被子植物质体基因 matK DNA 片段的有用引物设计
参考文献 Chase MW，Soltis DE，Olmstead RG，Morgan D.，Les DH，Mishler BD，Duvall M. R. ， 价格 R. A. ， Hills HG ， Qiu Y.-L . ， Kron KA ， Rettig J. H.，Conti E.，Palmer J. D 円 Manhart J. R. ， Sytsma K. J. ，迈克尔斯 H. J. ， 克莱斯 W. J. ， Karol KG ， Clark WD ， Hedroen M. ， Gaut BS ， Jansen R. K. ， 金K.-J. ， 温皮 CF ， 史密斯 J 。 F.，Fumier GR，Strauss SH，Xiang Q.-Y. ， Plunkett GM ， Soltis PS ， Swensen S. ， Williams SE ， Gadek P. A . ， 奎因 C.J. ， Eguiarte LE， Golenberg E.， Leam GH Jr.， Graham SW， Barrett SC， Dayanandan S. 和 Albert VA 1993. 种子植物的系统发育：质体基因 rbc 的核苷酸序列分析 L. Ann.密苏里机器人。警卫。 80: 528-580。道尔 J. J。和 Doyle J. L. 1987.一种用于少量新鲜叶组织的快速 DNA 分离程序。植物化学。公牛 l。 19: 11-15。/平塚 J. ， Shimada H. ， Whittier R. ， lshibashi T. ， Sakamoto M. ， Mori M. ， Kondo C. ， Ho 吋 i Y. ， Hirai A. ， Shinozaki K. 和 Sugiura M. 1989. 水稻（Oryza sativa）叶绿体基因组的完整核苷酸序列：不同 tRNA 基因之间的分子间重组导致谷物进化过程中的 m 吋 2 或质体 DNA 倒位。莫尔。基因 t 将军。 217: 185-194。 Johnson LA 和 Soltis DE 1994. 虎耳草科植物的 matK DNA 序列和系统发育重建。字符串系 统。博特。 19：143-156。 Neuhaus H. 和 Link G. 1987.芥菜的叶绿体 tRNA Lys (UUU) 基因。当前。基因。 11：251-257。 Steele KP 和 Vilgalys R. 1994. 利用质体基因 mat K 的核苷酸序列对花荬科进行系统发育分析。博特。 19：126-142。 Sugita M. ， Shinozaki K. 和 Sugiura M. 1985. 烟草叶绿体 tRNA Lys（UUU）基因含有一个2.5千碱基对的内含子：一个开放阅读框和内含子内保守的边界序列。 Proc. Na. l.学院Sci.USA 82: 3557-3561.