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World File Search System扩增
对 ama1 和 mdr1 进行靶向扩增子深度测序以...
1 肯尼亚基利菲 KEMRI-Wellcome Trust 研究计划生物科学系 2 北卡罗来纳大学教堂山分校医学院医学系传染病科，北卡罗来纳州教堂山 27599，美国 3 牛津大学纳菲尔德医学系热带医学与全球健康中心，英国牛津 4 玛希隆大学热带医学院玛希隆-牛津热带医学研究组，泰国曼谷 5 布朗大学沃伦·阿尔珀特医学院病理学与实验室医学系，罗德岛州普罗维登斯 02903，美国 6 北卡罗来纳大学教堂山分校吉林斯全球公共卫生学院流行病学系，北卡罗来纳州教堂山 27516，美国 7 北卡罗来纳大学教堂山分校医学院遗传学与分子生物学课程，北卡罗来纳州教堂山，美国
开发自我扩增的RNA轮状病毒疫苗
欧洲，但在撒哈拉以南非洲的50％以下）。•〜〜130,000年轮状病毒诱发婴儿死亡。•影响疫苗有效性的变量：1。移植获得的RV-IGG（中和抗体）。2。环境肠功能障碍（EED） - 小肠的疾病，
使用牛津纳米孔扩增子测序的温室灌溉水中真菌和卵菌病原体的早期评估
水传播植物的致病真菌和卵菌是温室生产系统中的主要威胁。对这些病原体的早期检测和量化将使我们能够及时治疗所需的经济和生物阈值，从而改善有效的疾病管理。在这里，我们使用了牛津纳米孢子的扩增子来分析从用于生长番茄，黄瓜和Aeschynanthus sp的温室收集的灌溉水中的微生物群落。真菌和卵形群落的特征是使用放大整体内部转录垫片（ITS）区域的引物。为了评估小兵测序的灵敏度，我们将串行稀释的模拟DNA刺激到图书馆制备之前从温室水样品中分离的DNA中。真菌和卵骨读数的相对丰盛在温室灌溉水中和来自番茄番茄的设置中的水样中与众不同。在相应的连续稀释样品中衍生出的源自真菌和卵形模拟群落的序列读数是成比例的，因此确认了最小值扩增子测序对环境监测的适用性。通过使用尖峰标准来测试使用小兵测试定量的可靠性，我们发现样品中尖峰ins的检测受到了真菌或卵形DNA的背景量的高度影响。我们观察到，与较长的尖峰（> 790bp）相比，我们大多数稀释液的长度较短（538bp）的尖峰在我们的大部分稀释液中产生。此外，相对于稀释序列，序列读数不均匀，并且在具有最高DNA浓度的背景样品中最不可检索，这表明性能的动态范围狭窄。我们建议对小兵测序进行连续的基准测试，以改善未来快速植物性诊断和监测的定量元编码工作。
CSFα-突触核蛋白种子扩增测定阳性与疾病的关联
抽象的组织质发生是北美的一种流行真菌病，经常在俄亥俄州和密西西比河河谷沿线报道，尽管自动病例发生在非流行地区。在美国，这种疾病是由两个遗传学上不同的组织囊肿sensu lato，组织的密西西比州组织（NAM1）和H. ohiense（NAM2）引起的。为了弥合分子流行病学间隙，我们基因分型93个组织型分离株（62种新型基因组），包括通过整个基因组测序的临床，环境和兽医样本，包括整个基因组测序，然后进行进化和物种小niche模型分析。我们表明，组织胞浆病是由两个主要谱系H. Ohiense和H. Mississippiense引起的。由加利福尼亚州和德克萨斯州的H. seramericanum引起的零星病例。虽然H. Ohiense在东部州普遍存在，但发现密西西比州的H. Mississipiense在美国的中部和西部地区很普遍，但在某些地区也在地理上重叠，表明这些物种可能共同存在。物种生态裂建模表明，H。ohiense在温暖和干燥的地方繁衍生息，而密西西比州H. Mississippiense则是温度较低和降水量更高的地区的特有。此外，我们预测了两个物种共发生的多个次级接触区，有可能促进基因交换和杂交。这项研究提供了对美国组织胞浆病的基因组流行病学的最全面的理解，并为侵入性真菌疾病的研究奠定了蓝图。
无冰气候中强大的极性扩增依赖...
摘要：以前的研究之间存在一个基本鸿沟，得出的结论是，没有海冰，并且发现极性扩增是独立于海冰的大气的固有特征。我们假设，气候海洋热传输的表示是模拟无冰气候中极性放大的关键。为了调查这一点，我们在CESM2-CAM6的平板海洋水膜片配置中运行了一系列有针对性的实验，并具有不同的开处方海热传输的填充物，这些海洋热传输是在CO 2 Quadrupling下不变的。在没有气候海热传输的模拟中，不会发生极性放大。相比之下，在气候海洋热传输的模拟中，在所有季节中都会发生强大的极性放大。是什么导致了对海洋热传输的这种依赖性？能量平衡模型理论无法解释我们的结果，实际上会预测，引入海洋热传输会导致极性扩展。相反，我们证明了短波云辐射反馈可以解释CESM2-CAM6模拟的不同极性气候响应。在零海洋热传输模拟中进行的针对云锁定实验能够重现气候海洋热传输模拟的极地放大，仅通过规定高纬度云辐射反馈。除了核对以前的差异外，这些结果还对在高排放场景下解释过去的平等气候和气候预测具有重要意义。我们得出的结论是，无冰气候中的极性扩展是由海洋 - 大气耦合的基础，这是通过较小的高纬度短波短波云辐射反馈，从而促进了增强的极性变暖。
N＆G基因扩增和测序
生物的目标是偏离生物生物维护实验室基础设施的“一种尺寸适合所有尺寸”的方法，并确定并实施新的和创新的解决方案，以实现安全有效的实验室，这些解决方案可以在包括低资源环境在内的所有环境中可持续运行。
核酸扩增与CRISPR/Cas技术联合用于病原体检测
病原体被定义为一种传染性微生物或病原体，其中病毒和细菌是临床上最常见的（Casadevall and Pirofski，2002）。这些病原体具有高度可进化性、致病性和迅速传播性，对人类健康构成严重威胁。微生物控制计划越来越多地被全社会采用，以降低消费者感染的风险。细菌培养法因其在常见实验室实验中的稳健性而被广泛认为是病原体检测的“金标准”。然而，它具有耗时、费力和检测效率低等缺点，这严重阻碍了其在临床上的广泛使用。另一种方法是免疫检测，它基于特异性抗体对抗原的识别和结合（Kohl and Ascoli，2017）。虽然它在检测病原微生物方面具有速度快、简单、特异性强等优势，但需要较长的抗体制备时间，检测灵敏度也较低。核酸检测技术与上述方法不同，能够同时满足病原体检测的准确性、快速性和灵敏度的要求，在保障人类安全方面更显优越性。
真核ITS和rRNA扩增子的全长HIFI测序
与简短的读数相比，覆盖范围仅限于ITS1或ITS2区域，HIFI读取的读数涵盖了全真菌其区域的全长。这包含800 bp，如果包括18s和/或28S基因以跨越操纵子，则可以提供约5 kb的扩增子。以及更保守的rRNA基因，这些区域允许在物种水平上降低序列相似性和更高分辨率的分类信息（Tedersoo等，2018； Tedersoo等人，2021年，图2）。除了产生更高的分类价值外，HIFI全长扩增子测序的成本与短阅读的部分扩增子测序相当。在本申请注释中，我们提供了从复杂社区DNA样品中扩增全长真核ITS和rRNA区域的一般指导。
线性扩增子测序分析报告/结果
下面的直方图显示了测序数据的读取长度分布。直方图在 y 轴上显示测序碱基数 (bp)，在 x 轴上显示读取长度。直方图中的每个条形代表读取长度的范围，条形的高度表示该范围内的碱基总数 (bp)。这会产生按每个箱体的核苷酸数加权的图，因为较长的读取在直方图中具有更大的权重。读取长度直方图可用于评估测序数据的质量，因为读取长度的分布可以指示测序过程中是否存在污染物或偏差。它们还可用于确定正在测序的扩增子的大小。
慢性暴露于糖皮质激素会在器官中人类神经发育过程中扩增抑制性神经元细胞命运
一个部门基因和环境，麦克斯·普朗克精神病学研究所，德国慕尼黑80804。b国际马克斯·普朗克（Max Planck）转化精神病学研究院（RIVS-TP），80804，德国慕尼黑。C计算生物学研究所，计算健康中心，Helmholtz Munich，85764，德国Neuherberg。 d Tum Life Sciences Weihenstephan，慕尼黑技术大学，85354，德国Freising。 e瑞典斯德哥尔摩卡罗林斯卡研究所生理学和药理学系。 f生理基因组学，生物医学中心（BMC），LMU慕尼黑医学学院，82152，PlaneGG-Martinsried，德国。 G Max Planck精神病学研究所，德国慕尼黑80804。 H TUM计算，信息和技术学院，慕尼黑技术大学，85748，德国Garching Bei Muenchen。C计算生物学研究所，计算健康中心，Helmholtz Munich，85764，德国Neuherberg。d Tum Life Sciences Weihenstephan，慕尼黑技术大学，85354，德国Freising。e瑞典斯德哥尔摩卡罗林斯卡研究所生理学和药理学系。f生理基因组学，生物医学中心（BMC），LMU慕尼黑医学学院，82152，PlaneGG-Martinsried，德国。G Max Planck精神病学研究所，德国慕尼黑80804。H TUM计算，信息和技术学院，慕尼黑技术大学，85748，德国Garching Bei Muenchen。