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抽象的组织质发生是北美的一种流行真菌病,经常在俄亥俄州和密西西比河河谷沿线报道,尽管自动病例发生在非流行地区。在美国,这种疾病是由两个遗传学上不同的组织囊肿sensu lato,组织的密西西比州组织(NAM1)和H. ohiense(NAM2)引起的。为了弥合分子流行病学间隙,我们基因分型93个组织型分离株(62种新型基因组),包括通过整个基因组测序的临床,环境和兽医样本,包括整个基因组测序,然后进行进化和物种小niche模型分析。我们表明,组织胞浆病是由两个主要谱系H. Ohiense和H. Mississippiense引起的。由加利福尼亚州和德克萨斯州的H. seramericanum引起的零星病例。虽然H. Ohiense在东部州普遍存在,但发现密西西比州的H. Mississipiense在美国的中部和西部地区很普遍,但在某些地区也在地理上重叠,表明这些物种可能共同存在。物种生态裂建模表明,H。ohiense在温暖和干燥的地方繁衍生息,而密西西比州H. Mississippiense则是温度较低和降水量更高的地区的特有。此外,我们预测了两个物种共发生的多个次级接触区,有可能促进基因交换和杂交。这项研究提供了对美国组织胞浆病的基因组流行病学的最全面的理解,并为侵入性真菌疾病的研究奠定了蓝图。

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