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影响血液和唾液染色中DNA浓度的环境因素：评论
DNA证据现已成为法医调查的重要组成部分，因为它为人识别和犯罪解决方案提供了重要信息。但是，生物材料受某些可能影响生物样品中DNA的环境因素的影响。这可能会影响法医DNA分析的正确性和可靠性。本综述与各种环境条件对生物污渍中DNA的稳定性和降解有关，包括血液和唾液污渍。影响DNA的常见因素是温度，湿度，暴露于阳光和底物的类型。信息对于改善法医DNA分析和法医协议优化至关重要。生物材料中的DNA稳定性和完整性，例如血液和唾液染色，对于法医DNA分析是必不可少的。环境因素显着影响DNA浓度，并可能危害法医分析。本评论探讨了各种环境因素对血液和唾液污渍中DNA稳定性的影响。虽然DNA降解速度减慢，但不能完全被低温阻止，但高温加速了。污染的风险是由于微生物生长的促进和湿度的DNA破坏而引起的。DNA受到阳光暴露带来的光损伤导致链断裂和交联。DNA稳定性也被所使用的底物类型所构成。与非孔子相比，多孔的表面（例如布料表面）更擅长保持luids。保持DNA证据的完整性需要了解这些变量。目前的研究将有助于创建用于法医DNA检查的复杂的DNA保存方法。这项研究强调了改善法医DNA分析技能的要求，与保存DNA证据和环境因素的可能影响有关。
染色体外DNA（ecDNA）：肿瘤异质性、基因组重塑和耐药性的起源。
癌细胞基因组含有正常细胞中没有的环状染色体外 DNA (ecDNA) 元素。临床样本分析表明，它们在大多数癌症中很常见，它们的存在预示着不良预后。它们通常含有高表达的增强子和驱动致癌基因。环状 ecDNA 拓扑结构导致染色质开放构象并产生新的基因调控相互作用，包括与远端增强子的相互作用。着丝粒的缺失导致细胞分裂过程中 ecDNA 随机分布，并且编码在其上的基因以非孟德尔方式传播。ecDNA 可以整合到染色体 DNA 中和退出。特定 ecDNA 的数量会随着治疗而改变。这种重塑癌症基因组的动态能力挑战了长期存在的基本原理，为肿瘤异质性、癌症基因组重塑和耐药性提供了新的见解。
新西兰兔脑组织学染色方法中灰质与白质的区分
材料和方法：本研究使用 14 个月大的新西兰兔的脑组织。将脑组织横向切片，以使其适合组织学程序。为此，将脑组织放在毫米纸上，切成三等份。将获得的样本从同一侧从头到尾切成 10μm 厚，并用六种染色方法对载玻片进行染色。通过显微镜将每张载玻片拍摄为 jpeg 格式。将获得的切片图像传输到 Image J 程序以估计其面积。使用李克特量表调查染色方法是否适合确定脑中灰质和白质以及细胞群的边界。作为这些程序的结果，获得的数据的统计结果以表格和图形呈现。
3D荧光染色和低肠癌的共聚焦成像（肠overods）：所有
长期相互交联和肌脑脊髓炎/慢性疲劳综合征（ME/CFS）患者的患者具有相似的症状，包括运动后不适，神经认知障碍和记忆力丧失。在这两种情况下的神经认知障碍都可能与海马子场中的变化有关。因此，这项研究比较了17个长卷，29名ME/CFS患者和15个健康对照组（HC）的海马园林子场的变化。在7 telsa MRI扫描仪上以亚毫米的各向同性分辨率获取结构MRI数据，然后使用FreeSurfer软件估算每个参与者的海马子场量。我们的研究发现，与HC相比，长期相互关联和ME/CFS患者的左海马子场中的体积明显更大。包括包括左下底部（长covid; p = 0.01，me/cfs; p = 0.002，），前延期头（长covid; p = 0.004，me/cfs; p = 0.005），分子层层hippocampus hippocus heampocus heamp heamp heamp; p = 0.014，me/cfs； covid; p = 0.01，me/ cfs; p = 0.01。 值得注意的是，长期covid和ME/CFS患者之间海马子场的体积相似。 此外，我们发现海马子场的体积与“疼痛”，“疾病持续时间”，“疲劳的严重程度”，“浓度受损”，“不恢复睡眠”和“身体功能”在两种条件下的“疼痛”，“疲劳的严重程度”之间存在显着关联。 这些发现表明，海马改变可能导致长期Covid和ME/CFS患者所经历的神经认知障碍。 此外，我们的研究这两个条件之间的高光相似性。包括左下底部（长covid; p = 0.01，me/cfs; p = 0.002，），前延期头（长covid; p = 0.004，me/cfs; p = 0.005），分子层层hippocampus hippocus heampocus heamp heamp heamp; p = 0.014，me/cfs； covid; p = 0.01，me/ cfs; p = 0.01。值得注意的是，长期covid和ME/CFS患者之间海马子场的体积相似。此外，我们发现海马子场的体积与“疼痛”，“疾病持续时间”，“疲劳的严重程度”，“浓度受损”，“不恢复睡眠”和“身体功能”在两种条件下的“疼痛”，“疲劳的严重程度”之间存在显着关联。这些发现表明，海马改变可能导致长期Covid和ME/CFS患者所经历的神经认知障碍。此外，我们的研究这两个条件之间的高光相似性。
海洋浮游植物中的RNA和DNA测量的新双染色技术
RNA：DNA比率已被用作各种海洋器官中生长速率的生化指标（Sutcliffe 1970，Buckley＆Lough 1987，Bulow 1987，Clemmesen 1987，Clemmesen 1987，1988，Clarke等，Clarke等，1988，Raae等。 1988，Mordy＆Carlson 1991），包括Phyto-Plankton（Dortch等人 1983，1985，Mordy＆Carlson 1991）。 由于RNA和DNA的化学相似性，通过经典方法分别量化每种都需要冗长的提取。 此外，通过分光光度法（紫外线浸泡）和量热法（使用RNA和二苯胺的脑甲醇用于DNA）的最终量化很困难，从而使低剂量和干扰因提取其他细胞成分以及除核酸以外的许多细胞成分（例如 Herbert等。 1971，Cattolico 1978）。 可以通过使用荧光染色来实现更大的敏感性，但是可用的方法仍然是某种程度上 - 繁琐，耗时且遇到一些潜在问题（Holm-Hansen等人。 1968，Thoresen等。 1983，Clemmesen 1988）。 例如，在Prasad等人开发的广泛使用的方法中。 （1972），总核酸用溴化乙锭测量，溴化乙锭与DNA和RNA反应，并产生高度荧光化合物。 然后用酶RNase破坏RNA，并测量DNA引起的荧光。 然后从差异计算 RNA con-中心1988，Raae等。1988，Mordy＆Carlson 1991），包括Phyto-Plankton（Dortch等人 1983，1985，Mordy＆Carlson 1991）。 由于RNA和DNA的化学相似性，通过经典方法分别量化每种都需要冗长的提取。 此外，通过分光光度法（紫外线浸泡）和量热法（使用RNA和二苯胺的脑甲醇用于DNA）的最终量化很困难，从而使低剂量和干扰因提取其他细胞成分以及除核酸以外的许多细胞成分（例如 Herbert等。 1971，Cattolico 1978）。 可以通过使用荧光染色来实现更大的敏感性，但是可用的方法仍然是某种程度上 - 繁琐，耗时且遇到一些潜在问题（Holm-Hansen等人。 1968，Thoresen等。 1983，Clemmesen 1988）。 例如，在Prasad等人开发的广泛使用的方法中。 （1972），总核酸用溴化乙锭测量，溴化乙锭与DNA和RNA反应，并产生高度荧光化合物。 然后用酶RNase破坏RNA，并测量DNA引起的荧光。 然后从差异计算 RNA con-中心1988，Mordy＆Carlson 1991），包括Phyto-Plankton（Dortch等人1983，1985，Mordy＆Carlson 1991）。 由于RNA和DNA的化学相似性，通过经典方法分别量化每种都需要冗长的提取。 此外，通过分光光度法（紫外线浸泡）和量热法（使用RNA和二苯胺的脑甲醇用于DNA）的最终量化很困难，从而使低剂量和干扰因提取其他细胞成分以及除核酸以外的许多细胞成分（例如 Herbert等。 1971，Cattolico 1978）。 可以通过使用荧光染色来实现更大的敏感性，但是可用的方法仍然是某种程度上 - 繁琐，耗时且遇到一些潜在问题（Holm-Hansen等人。 1968，Thoresen等。 1983，Clemmesen 1988）。 例如，在Prasad等人开发的广泛使用的方法中。 （1972），总核酸用溴化乙锭测量，溴化乙锭与DNA和RNA反应，并产生高度荧光化合物。 然后用酶RNase破坏RNA，并测量DNA引起的荧光。 然后从差异计算 RNA con-中心1983，1985，Mordy＆Carlson 1991）。由于RNA和DNA的化学相似性，通过经典方法分别量化每种都需要冗长的提取。此外，通过分光光度法（紫外线浸泡）和量热法（使用RNA和二苯胺的脑甲醇用于DNA）的最终量化很困难，从而使低剂量和干扰因提取其他细胞成分以及除核酸以外的许多细胞成分（例如Herbert等。 1971，Cattolico 1978）。 可以通过使用荧光染色来实现更大的敏感性，但是可用的方法仍然是某种程度上 - 繁琐，耗时且遇到一些潜在问题（Holm-Hansen等人。 1968，Thoresen等。 1983，Clemmesen 1988）。 例如，在Prasad等人开发的广泛使用的方法中。 （1972），总核酸用溴化乙锭测量，溴化乙锭与DNA和RNA反应，并产生高度荧光化合物。 然后用酶RNase破坏RNA，并测量DNA引起的荧光。 然后从差异计算 RNA con-中心Herbert等。1971，Cattolico 1978）。 可以通过使用荧光染色来实现更大的敏感性，但是可用的方法仍然是某种程度上 - 繁琐，耗时且遇到一些潜在问题（Holm-Hansen等人。 1968，Thoresen等。 1983，Clemmesen 1988）。 例如，在Prasad等人开发的广泛使用的方法中。 （1972），总核酸用溴化乙锭测量，溴化乙锭与DNA和RNA反应，并产生高度荧光化合物。 然后用酶RNase破坏RNA，并测量DNA引起的荧光。 然后从差异计算 RNA con-中心1971，Cattolico 1978）。可以通过使用荧光染色来实现更大的敏感性，但是可用的方法仍然是某种程度上 - 繁琐，耗时且遇到一些潜在问题（Holm-Hansen等人。1968，Thoresen等。 1983，Clemmesen 1988）。 例如，在Prasad等人开发的广泛使用的方法中。 （1972），总核酸用溴化乙锭测量，溴化乙锭与DNA和RNA反应，并产生高度荧光化合物。 然后用酶RNase破坏RNA，并测量DNA引起的荧光。 然后从差异计算 RNA con-中心1968，Thoresen等。1983，Clemmesen 1988）。 例如，在Prasad等人开发的广泛使用的方法中。 （1972），总核酸用溴化乙锭测量，溴化乙锭与DNA和RNA反应，并产生高度荧光化合物。 然后用酶RNase破坏RNA，并测量DNA引起的荧光。 然后从差异1983，Clemmesen 1988）。例如，在Prasad等人开发的广泛使用的方法中。（1972），总核酸用溴化乙锭测量，溴化乙锭与DNA和RNA反应，并产生高度荧光化合物。然后用酶RNase破坏RNA，并测量DNA引起的荧光。RNA con-中心
人类 3D 染色质对心脏病相关转录因子的剂量依赖性敏感性
。CC-BY-ND 4.0 国际许可证（未经同行评审认证）是作者/资助者，他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。它是此预印本的版权持有者此版本于 2025 年 1 月 12 日发布。；https://doi.org/10.1101/2025.01.09.632202 doi：bioRxiv 预印本
在生产膜蒸馏的防染色膜中的2D材料喷涂涂层
带有2D材料的膜表面涂层已显示出用于水处理应用的防婚特性。但是，目前基于真空过滤的合成方法不容易缩放。本研究描述了一种可扩展的方法，可用于涂层膜，包括氧化石墨烯（GO），六边形硝酸氢硼（HBN），二硫化钼（MOS 2）和二硫化钨（WS 2）。使用含氧剂将含有每类2D薄片的异丙基醇溶液喷涂到商业聚偏氟化物（PVDF）上。纳米材料用聚多巴胺（PDA）作为一个可以轻松地集成到可扩展的滚动过程中的方法中的交联。使用扫描电子显微镜，原子力显微镜，接触角，拉伸强度测量和傅立叶转换红外光谱法评估了形态，表面粗糙度，疏水性，机械耐用性和化学组成的变化。在72 h的膜蒸馏（MD）实验中测试了2D纳米材料涂层的膜，并将其与原始的PVDF和PDA/PVDF膜进行了比较。使用高浓度的腐殖酸（150 ppm）和石蜡油（200 ppm）的盐排斥和MD性能稳定性评估，从而模拟了从油气萃取中模拟简单的有机废水。通量下降比以每小时渗透率损失百分比（％/h）来衡量，以便将来与不同的实验时间进行比较。所有膜的盐分排斥很高（> 99.9％）。原始的PVDF膜在10小时后因结垢而导致孔隙润湿失败，而PDA/PVDF膜的通量下降率最大（0.3％/小时）。涂有GO和HBN的膜的通量下降比较低（分别为0.0021±0.005和0.028±0.01％/h）。Go涂层的膜是唯一能够治疗含有表面活性剂和含有污垢的饲料的膜类型。改进的性能归因于表面粗糙度和疏水性的降低，这降低了污垢表面上的污垢吸附。这项工作显示了一种可延展的可扩展方法来克服MD中的犯规限制。
分子生物学实验室使用 GelRed 染料对琼脂糖凝胶中的核酸进行染色
在凝胶制备过程中，使用浓度为 1.5% 的 TBE 缓冲液 (Tris-Borate-EDTA) 琼脂糖作为核酸电泳的基质。采用了两种不同的方法，以适应染色技术。为了使用 GelRed® 进行电泳后染色，在不添加任何类型的染料的情况下制备凝胶，然后将染料与浓度为 1:9 的上样缓冲液混合。使用该混合物将样品上样到琼脂糖凝胶中，使用 2ul 缓冲液 + GelRed® 和 6ul 扩增的 PCR 产物。然而，为了染色预电泳凝胶，通过预染色将溴化乙锭掺入琼脂糖中。这是通过在融化后将 0.5 μg/mL 的 EtBR 添加到 100 mL 琼脂糖中来实现的。在这两种方法中，电泳技术都是在以下条件下进行的
细菌清除率和评估虾免疫刺激活性的新鉴别血细胞染色方法
摘要：开发了评估黑虎虾（Penaeus monodon）免疫刺激剂功效的新方法。试验虾饲喂 2% 或 4% 酵母提取物 (YE) 涂层饲料，而对照组饲喂无涂层饲料。喂养 4 周后，对单只虾进行总血细胞计数 (THC)、颗粒血细胞 (GH) 数量和细菌清除率评估。对于血细胞计数，在室温下用 50% 乙醇中的 1.2% 玫瑰红对福尔马林固定的血淋巴染色 20 分钟。一部分混合物用血细胞计数器进行 THC 计数，一部分涂在显微镜载玻片上晾干，然后用苏木精复染进行 GH 计数。通过这种技术，可以获得高质量的涂片以进行准确的分类计数。细菌清除试验用于评估体液和细胞防御机制的总体效果。每只虾肌肉注射 1 × 10 8 个哈维氏弧菌，注射后 0、15、30 和 60 分钟收集抗凝血淋巴，在 TCBS 琼脂上进行四次滴数计数（20 µl）。饲喂 4% YE 的虾的总血细胞计数显著高于（p < 0.05）饲喂无涂层饲料的虾。饲喂 YE 的虾的颗粒细胞百分比和细菌清除率高于饲喂对照饲料的虾。这两种方法可以简单快速地比较虾组抗菌防御能力的差异。
使用 Decoil 从长读测序数据重建染色体外 DNA 结构异质性
1 柏林夏里特医学院儿科肿瘤学和血液学系，柏林 13353，德国； 2 马克斯德尔布吕克中心和柏林夏里特医学院实验与临床研究中心，德国柏林 13125； 3 柏林夏里特医学院，柏林 10117，德国； 4 柏林自由大学，德国柏林 14195； 5 马克斯德尔布吕克分子医学中心，德国柏林 13125； 6 埃尔朗根-纽伦堡弗里德里希亚历山大大学，91054 埃尔朗根，德国； 7 德国癌症联盟 (DKTK)，合作伙伴柏林，DKFZ 与柏林夏里特医学院合作，德国柏林 10117； 8 柏林夏里特医学院神经病理学系，柏林自由大学和柏林洪堡大学的企业成员，德国柏林 13353； 9 表观遗传学研究中心，纪念斯隆凯特琳癌症中心，纽约，纽约 10065，美国