植物二级细胞壁(SCW)由三个主要生物聚合物的异质相互作用组成:cellu-损失,半纤维素和木质素。有关特定分子间相互作用和SCW上部结构的高阶架构的详细信息仍然模棱两可。在这里,我们使用固态核磁共振(SSNMR)测量值来推断有关气管木中所有三个主要生物聚合物的结构构型,分子间相互作用以及相对接近的精致细节。为了增强这些发现的效用,并能够评估有机体中基于物理的环境中的假设,NMR可观察物被阐述为植物SCW内生物聚合物组件的原子,大分子模型。通过分子动力学模拟,我们定量评估了原子模型的几种变体,以确定通过SSNMR测量结果证实的结构细节。
BCMB 430 - 分析生物化学和生物物理学 3 学分 课程目标:了解构成生物科学中使用的技术和仪器基础的物理科学原理 先决条件:生命科学学士学位课程。 第一单元 - 电化学技术和光度测定 11 小时 电化学的基本原理 - pH 电极 - 离子选择性 - 气体传感和氧电极 - 生物传感器的基本细节。比色法和分光光度法的原理和技术-比尔-朗伯定律-仪器-低色度和增色度-荧光测定-流式细胞术-原子吸收光谱法-圆二色性-光学旋光色散-核磁共振光谱-红外光谱第二单元-显微镜 7 小时显微镜-基本原理和应用-光-化合物-相衬-暗场-荧光显微镜扫描电子显微镜-透射电子显微镜 (TEM) -扫描隧道显微镜- (STM) -共聚焦显微镜。第三单元 - 离心 6 小时离心的基本原理 - 仪器、离心装置 - 离心机的类型 - 转子、配件 - 离心方法 - 沉降速度 - 沉降平衡 - 胶体 - 细胞分离方法。第四单元 – 色谱法 10 小时 色谱法的类型 - 柱色谱法、薄层色谱法、纸色谱法、吸附色谱法、分配色谱法、气液离子交换色谱法、亲和色谱法、高效液相色谱法 - 每种类型的原理 - 仪器和附件 - 检测方法和系统 - 定性和定量方面 - 应用;第五单元 – 电泳法 6 小时 电泳类型 - 纸和凝胶 - 琼脂糖和 PAGE - 脉冲场 - 毛细管 - 等电聚焦 - 印迹技术:西方、南方和北方。应用教科书 1. James, P. Allen. (2008). 生物物理化学,Wiley Blackwell,新泽西。2. Wilson, K. 和 Walker, J. (2010) 生物化学和分子生物学原理和技术,剑桥大学出版社,剑桥。推荐阅读 1. Horst, F. (2010) 基本一维和二维核磁共振波谱学,Wiley-VCH,新泽西。 2. Murphy, DB 和 Davidson, MW (2012) 光学显微镜和电子成像基础,Wiley-Blackwell,新泽西州。3. Freifelder, DM (1983) 物理生物化学 - 生物化学和分子生物学应用,WH Freeman,纽约
预测等待时间和预约延迟有助于优化医院资源并提高患者满意度。Curtis 等人利用几种机器学习算法来预测无需预约的放射中心的等待时间或四种模式(计算机断层扫描、核磁共振、超声波和射线照相)的预约放射设施的延迟时间。从放射信息系统中提取了几个变量。九种机器学习算法(神经网络、随机森林、支持向量机 (SVM)、弹性网络、多元自适应回归样条、k 次近邻、梯度增强机、装袋以及分类和回归树)用于对其参数进行微调,以最佳地拟合训练数据。均方根误差指标用于确定算法的预测精度。在九种机器学习算法中,弹性网络在准确有效地预测等待时间和延迟时间方面优于其他算法 [19]。
人类血清和血浆的核磁共振 (NMR) 光谱除了代谢物和脂蛋白外,还显示两种特征信号 GlycA 和 B,它们来自急性期蛋白表面聚糖的乙酰基,是炎症过程的良好标志物。在这里,我们报告了在人类血清中观察到的糖蛋白聚糖 NMR 信号的全面分配,结果显示 GlycA 和 GlycB 信号分别来自 N -聚糖的 Neu5Ac 和 GlcNAc 部分。常规测定的急性期糖蛋白浓度与 NMR 光谱中的独特特征有很好的相关性(R 2 高达 0.9422,p 值 <0.001),可以在 10 – 20 分钟的采集时间内同时定量几种急性期炎症蛋白(图 1)。[1] 这在 COVID-19 和心源性休克患者的血清样本中得到了体现,与健康对照组相比,几种急性期蛋白发生了显着变化。
摘要 2019 年冠状病毒病 (COVID-19) 大流行对人类生活产生了重大影响。本综述重点介绍了经典和现代基于结构的方法对 COVID-19 的多种作用。X 射线晶体学、核磁共振波谱和低温电子显微镜是经典结构生物学的三大基石。这些技术有助于提供有关严重急性呼吸综合征冠状病毒 2 (SARS-CoV-2) 及其相关人类宿主蛋白的基本和详细知识,并能够识别其靶位,从而有助于停止其传播。使用源自同源性建模并与人工智能 (AI) 相结合的现代基于结构的方法在蛋白质结构建模方面取得了进一步进展,促进了先进的计算模拟工具积极指导新疫苗的设计和抗 SARS-CoV-2 药物的开发。本综述介绍了基于结构的方法对 COVID-19 的实际贡献和未来方向。
•利用和分析诸如400MHz核磁共振(NMR)光谱,高压液相色谱(HPLC),紫外线(UV) - 光谱镜检查,薄层色谱(TLC)和Indrared Spectroscoppopicy(IR)等工具。•在活跃的无菌领域工作时,创建大肠杆菌(大肠杆菌)的库存(大肠杆菌)和培养物,以帮助创造和测量反应的生物相容性。•使用Mnova,ChemDraw和OpenLab ChemStation等软件来分析70多个质子NMR,以ACS样式绘制化学结构和反应,并在选定的小瓶上分别执行100 hplc。•学习和利用方法以海报和呈现形式提出化学研究,并向非熟悉的个人,而对研究主题不熟悉的个人。伊利诺伊州湖森林学院Schwalbe Lab研究助理,2022年5月至2022年7月| 2023年1月 - 2023年5月Schwalbe Lab成员
两项发现使得注射药物输送的新测试成为可能,以评估通过局部注射治疗子宫肌瘤的效果。为了进行这项研究,北卡罗来纳中央大学的化学家们开发了标准操作程序,用于制备大批量(20 克)的 LiquoGel TM,其纯度超过 98%,这已由核磁共振波谱证实。LiquoGel TM 载体在室温下为液体,在正常体温下转变为凝胶。这可以保护局部输送的治疗药物。此类药物和其他物质可以“包埋”在水凝胶共聚物的“孔隙”中。该团队还能够开发出具有更牢固(共价)结合物质(LiquoGel TM –R)的 LiquoGel TM 批次,这些物质也可以装载其他药物。更牢固结合的物质可用作治疗或诊断应用的标记或“信标”。与杜克大学的临床医生和科学家合作,他们随后收集了人类子宫肌瘤组织
由于新型抗菌剂开发不频繁,而且进化使现有策略失效,缺乏针对细菌感染的资源是一个普遍且日益严重的问题。我之前在 Lynette Cegelski 教授实验室的研究重点是阐明细菌生物膜组装的基本化学原理,重点研究临床相关的泌尿道致病性大肠杆菌菌株。具体来说,我致力于开发固态核磁共振方法来研究淀粉样蛋白-多糖相互作用,以确定大肠杆菌不溶性细胞外基质的结构;此外,我还研究了细菌淀粉样蛋白的生物发生和新型小分子的抑制机制。在未来的研究中,我有兴趣应用化学和生物物理工具来研究难以解决的生物系统:我对细胞膜和膜蛋白的物理特性和动态性很着迷,我希望围绕这些兴趣及其在癌症进展或免疫现象中的作用开展论文工作。
摘要 要检验量子理论是否适用于所有物理系统和所有尺度,需要考虑量子探针与另一个不必完全遵循量子理论的系统相互作用的情况。重要的例子包括量子质量探测引力场的情况,而引力场尚不存在独特的量子引力理论,或者量子场(如光)与宏观系统(如生物分子)相互作用,而宏观系统可能遵循也可能不遵循幺正量子理论。在这种情况下,最近提出了一类实验,通过检测系统是否能够纠缠两个量子探针,可以间接测试不需要遵循量子理论的物理系统(引力场)的非经典性。在这里,我们说明了该论证的一些微妙之处,与相互作用局部性和非经典性的作用有关,并使用具有四个量子比特的核磁共振量子计算平台进行原理验证实验,说明这些提议的逻辑。