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使用固定的T4 DNA连接酶生成寡核苷酸探针最大程度地减少样品损失并节省时间
为了解决这个问题，并促进了对改良的寡核的快速，简单，高产的，荧光团的附件，我们在这里证明了固定的T4 DNA连接酶（IM T4 DNA连接酶，NEB＃M0569）的易于有效使用。目标寡聚包含一个昂贵且难以合同的环嘧啶二聚体（CPD）（2）我们附加了5´FAM荧光团以可视化相应酶促反应的修饰（图2，第2页）。采用相应片段的适当化学计量比，可以立即通过毛细管电泳进行筛查，从而可以立即进行纯化的无连接反应。重要的是要注意连接酶反应中3´的寡磷酸成分中5´磷酸盐的要求。可以化学引入磷酸盐或使用T4多核苷酸激酶（NEB＃M0201）添加。
使用固定的T4 DNA连接酶生成寡核苷酸探针最大程度地减少样品损失并节省时间
为了解决这个问题，并促进了对改良的寡核的快速，简单，高产的，荧光团的附件，我们在这里证明了固定的T4 DNA连接酶（IM T4 DNA连接酶，NEB＃M0569）的易于有效使用。目标寡聚包含一个昂贵且难以合同的环嘧啶二聚体（CPD）（2）我们附加了5´FAM荧光团以可视化相应酶促反应的修饰（图2，第2页）。采用相应片段的适当化学计量比，可以立即通过毛细管电泳进行筛查，从而可以立即进行纯化的无连接反应。重要的是要注意连接酶反应中3´的寡磷酸成分中5´磷酸盐的要求。可以化学引入磷酸盐或使用T4多核苷酸激酶（NEB＃M0201）添加。
等位基因特异性 CRISPR/Cas9 编辑使与胶原蛋白 1 相关的单核苷酸变体失活
105 并且也可根据 CC0 许可使用。（未经同行评审认证）是作者/资助者。本文是美国政府作品。根据 17 USC，它不受版权保护
想象力：Iga肾病中的RO7434656的全球3期试验，RO7434656，一种反义寡核苷酸抑制剂B的反义寡核苷酸抑制剂
j。巴拉特（Barratt）从Alnylam，Arganx，Asterelas，Biocryst，Calliditas Therapeutics，Chinok，Chinok，Chinok，Dimerix，Dimerix，Galapagos，Veras，Veraros，Veraros，Vera Therapeutics，Vera Therapeutics，Vera Therapeutics and Observer获得了咨询/发言人FES；以及Argaanx，Calliditas Therapeutics，Chinook，Galapagos，Gsk，Omers，Travere Therapeutics和Visterra的赠款支持。V. Duggaal和J.lo Aree雇员N. Schmit和J. Cheng是F. Hoffmann-La Roche Ltd. B.H.
使用剪接切换反义寡核苷酸的视网膜炎色素炎11的精确治疗方法，以恢复PRPF31的开放阅读框架
摘要：色素性视网膜炎11是一种不可治疗的，主要遗传的视网膜疾病，由MRNA加工因子31 PRPF31中的杂合突变引起。PRPF31的表达水平与受影响家庭的不完全渗透有关；具有较高PRPF31表达的突变载体可以无症状。当前的研究探讨了反义寡核苷酸外显子跳过策略，以治疗由PRPF31外显子12中截断突变引起的RP11，因为它似乎没有编码PRPF31蛋白质功能所必需的任何域。细胞源自携带PRPF31 1205C>的患者，研究了废话突变。由1205C> A编码的PRPF31转录本由于胡说八道介导的mRNA衰变而无法检测到，相对于健康的供体细胞，PRPF31 mRNA降低了46％。反义寡核苷酸诱导的外显子12的跳过，拯救了开放式阅读框，因此在RP11患者成纤维细胞中，prpf31 mRNA上调为1.7倍。PRPF31上调的水平达到了具有相同突变的非探针载体家族成员推断出的预测的表达阈值。这项研究表明，诱导PRPF31同工型的PRPF31表达和核易位能力的保留增加。未来的研究应评估诱导的PRPF31蛋白在视网膜细胞中MRNA剪接上的功能，以验证可依延RP11引起的突变的治疗方法。
分段通知 - 基因组 - 核苷酸 -
基础模型在几个领域取得了巨大的成功，例如自然语言处理，计算机视觉和最近的生物学。DNA粉底模型尤其是作为基因组学有前途的方法而出现的。然而，到目前为止，尚无模型在广泛的基因组和调节元素上提供颗粒状的核苷酸水平预测，从而限制了其实际实用性。在本文中，我们基于以前在核苷酸变压器（NT）上的工作，以开发一个分割模型，即分割，该模型在单核苷酸分辨率下处理输入DNA序列的输入DNA序列，以预测14个基因组学元素的14种基因组学元素。通过利用NT的预训练权重，分段超过了几种消融模型的性能，包括具有单热编码的核苷酸序列和从SCRATCH训练的模型的卷积网络。分段可以处理多个序列的多个序列长度，以零拍概括，以达到50kbp的序列。我们在整个基因组的剪接位点检测中显示出改善的性能，并表现出强核苷酸水平的精度。因为它同时评估了所有基因元素，因此分段可以预测序列变体对剪接位点变化的影响，而且还可以预测转录本同工型中外显子和内含子重排的影响。最后，我们表明，对人类基因组学元素进行训练的分段模型可以推广到不同物种的元素，并且训练有素的多种属性分段模型可以实现对不见物物种的所有基质元素的更强的一般性。总而言之，分段表明DNA粉底模型可以在单核苷酸分辨率下处理基因组学中复杂的颗粒状任务。分段很容易扩展到其他基因组学元素和物种，因此代表了我们分析和解释DNA的新范式。我们使我们的jax的github存储库中可在pytorch的jax和huggingface空间上提供分段-30kb的人类和多物种模型。
发现MK-8527，一种长效HIV HIV核苷逆转录酶易位抑制剂
•尽管墨西哥第二代Intis的广泛使用，尤其是自2019年Bictaf被用作第一线治疗，而在许多开关策略中，失败的数量受到限制。•仅在27个月内提交了对我们参考实验室的集成酶耐药性的20/100的20/100，在整合酶基因中具有主要突变。•在大多数Insti失败中都存在突变体R263K，当未检测到以前的Insti失败•始终与M50I相关的BIC失败时始终与M50I相关联，在BIC失败的情况下•R263K加上M50L集成酶RAMS的组合与失败处于失败时的病毒量低有关•与多次ARV治疗（2或更多）与RAM的失败无关或与RAM相关的失败•DT与RAM的失败无关。集成酶电阻在RT中显示M184V。
方法开发人员的寡核苷酸设计指南
摘要简介：开发新方法对于在科学方面取得巨大的飞跃，开辟了新的研究途径至关重要，但是很少描述方法开发背后的过程。涵盖的区域：在过去的二十年中，我们使用寡核苷酸偶联的抗体来可视化蛋白质蛋白质相互作用，从而开发了几种新方法，例如原位PLA，Proxhcr和Molboolean。 在此，我们描述了这些方法的寡核苷酸系统背后的基本原理。 本文的主要目的是为研究人员提供有关我们在设计这些方法时如何看待的描述。 我们还详细描述了方法如何工作以及如何解释结果。 专家意见：了解该方法的工作方式对于选择适当的实验方法很重要。 我们还希望本文可能是年轻研究人员进入方法开发领域的灵感。 看到问题是开发解决方案的动力。涵盖的区域：在过去的二十年中，我们使用寡核苷酸偶联的抗体来可视化蛋白质蛋白质相互作用，从而开发了几种新方法，例如原位PLA，Proxhcr和Molboolean。在此，我们描述了这些方法的寡核苷酸系统背后的基本原理。本文的主要目的是为研究人员提供有关我们在设计这些方法时如何看待的描述。我们还详细描述了方法如何工作以及如何解释结果。专家意见：了解该方法的工作方式对于选择适当的实验方法很重要。我们还希望本文可能是年轻研究人员进入方法开发领域的灵感。看到问题是开发解决方案的动力。
烟酰胺单核苷酸（NMN）在2型糖尿病中通过脂肪组织中的意外作用，而不是通过线粒体生物发生
摘要：烟酰胺单核苷酸（NMN）已成为针对年龄相关疾病（包括2型糖尿病）的有希望的治疗干预措施。在这项研究中，我们证实了NMN治疗对葡萄糖摄取的先前观察到的影响，并研究了其在各种组织和细胞系中的基本机制。通过迄今为止最全面的蛋白质组学分析，我们发现了一系列新型器官特异性作用，负责通过IPGTT：脂肪组织生长来测量的葡萄糖摄取（通过增加蛋白质合成，降解和MTORPORPRIFTIAL SIGNAMENTION提高）。值得注意的是，我们观察到了热UCP1的上调，促进了肌间脂肪组织中的葡萄糖转化为热量，同时显示出对肌肉和大脑线粒体生物发生的令人惊讶的抑制作用。此外，肝脏和肌肉细胞表现出独特的反应，其特征是剪接体下调和同时上调伴侣，蛋白酶体和核糖体，从而导致轻度受损和能量感知的蛋白质合成机制。此外，我们的发现揭示了大脑中明显的代谢重新布线。这涉及增加酮体的产生，线粒体Oxphos和TCA循环成分的下调以及诱导众所周知的禁食相关作用。共同阐明了NMN作用的多方面性质，突出了其特异性效应及其在改善葡萄糖摄取中的作用。这些发现加深了我们对NMN治疗潜力的理解，并为管理代谢疾病的新策略铺平了道路。
发现MK-8527，一种长效HIV HIV核苷逆转录酶易位抑制剂 对第二代集成酶抑制剂的抗性是一种罕见的... CD4靶向的mRNA tovilly tat的mRNA逆转HIV-1潜伏期 程序指南
进行了一种持久性测定，将细胞与化合物孵育24小时，从而使化合物摄取和磷酸化随后进行清洗。洗涤后立即（a）或48小时（b）立即进行感染。板对GFP阳性细胞的数量，确定IC 50值，并计算每种化合物的持续比率。较低的持久性值表明复合冲洗后细胞中三磷酸的持久性更长。MK-8527-TP在PBMC和MT4-GFP细胞中具有相似的持久性，并且与ISL-TP相当。