我们展示了异源多倍体根结线虫Meloidogyne javanica的染色体级基因组组装。我们发现M . javanica基因组主要是异源多倍体,包含两个亚基因组A和B,最有可能起源于两个祖先亲本物种的杂交。使用全长非嵌合转录本、与参考数据库的比较和从头算预测技术对组装进行了注释,并使用祖先k聚体谱分析对亚基因组进行了分阶段。亚基因组B似乎显示染色体重叠群的分裂,虽然亚基因组之间存在大量同源性,但我们还确定了缺乏同源性的区域,这些区域可能在杂交之前或之后在祖先基因组中发生了分化。这种带注释和分阶段的基因组组装为了解这些全球重要植物病原体的起源和遗传学提供了重要资源。
摘要:root-inkot nematodes(meloidogyne spp。)是久坐的内寄生虫,在全球农作物上造成严重的经济损失。由于欧盟在甲胺的应用中的规定,现在至关重要的是发现对线虫管理的环保控制策略。生物防治是一种安全可靠的方法来管理这些多晶金线虫。生物防治剂不仅控制着这些寄生线虫,而且还改善了植物的生长并诱导植物对各种生物胁迫的全身耐药性。种类繁多的生物,例如细菌,真菌,病毒和原生动物,生活在其自然模式下,作为线虫拮抗剂。各种评论文章总体上讨论了生物防治在线虫管理中的作用,但是对根结线虫生物防治的特定综述尚未详细详细介绍。因此,这篇评论通过讨论其重要的已知拮抗剂,作用方式和相互作用来重点关注根结线虫的生物控制。
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