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泛素介导的蛋白水解：通过破坏的生物调节
总结泛素蛋白水解系统在一系列基本的细胞过程中起重要作用。是细胞周期的调节，免疫反应和炎症反应的调节，信号转导途径的控制，发育和分化。这些复杂过程通过单个或子集的蛋白质的特异性降解来控制。deg含量涉及两个连续的步骤，共轭泛素的多种部分以及26S蛋白酶体对标记蛋白的降解。一个重要的问题涉及基于系统特异性的机制的身份。底物识别受一个大型家族泛素连接酶的控制，该连接酶可以认识底物，结合它们并催化/促进它们与泛素的相互作用。生物评估22：442±451，2000。β2000 John Wiley＆Sons，Inc。
回顾泛素 - 蛋白酶体在肾脏疾病中的作用
泛素 - 蛋白酶体系统（UPS）是特异性细胞内蛋白质降解的主要途径，这是通过泛素标记的底物的蛋白酶体降解。许多生物学过程，包括细胞周期，转录，翻译，凋亡，受体活性和细胞内信号传导，受到UPS的调节。对UPS的改变或多或少容易降解，是肾脏疾病的疾病。本评论旨在总结肾脏疾病中UPS的机制。此外，本综述还探讨了UPS，自噬和肾脏疾病发展中的关系之间的关系。另一方面，这些系统和发病机理之间的特定分子联系是未知的和有争议的。此外，我们简要描述了一些靶向UPS成分的抗肾脏疾病药物。这篇评论强调UPS是治疗肾脏疾病的有希望的治疗方式。我们的工作虽然仍然基本且有限，但可以为未来潜在的肾脏疾病的潜在治疗靶点提供选择。
加密斑块和UBP12/13去泛素酶拮抗
磁盘和脑电图（M/EEG）是以高时间分辨率但相对较低的空间分辨率来测量体内神经活性的广泛技术。M/EEG基础的来源提出了一个反问题，该问题本身是错误的。近年来，基于人工神经网络开发了一种新的源成像方法。我们提出了一个长期术语内存（LSTM）网络，以解决M/EEG In-verse问题。它整合了低计算成本，对粗空的剥削，也整合了来自脑电图的出色时间信息，输入功能和稳健性到噪声。我们使用仿真数据和实际脑电图数据将LSTM网络与经典的逆溶液进行了比较，在颅内刺激过程中记录在癫痫患者中。与经典的逆溶液相比，LSTM网络在多个指标和不同数量的神经源上显示出更高的准确性，但与我们的替代体系结构相比，与我们的替代体系结构相比，相比之下。LSTM网络关于其对噪声的鲁棒性和低定位误差的性能，这是在将来的源定位研究和临床应用中考虑的有希望的逆解决方案。
去泛素化酶抑制剂PR-的抗肿瘤作用...
摘要：软骨肉瘤是一种治疗选择有限的难治性癌症，治疗方法缺乏重大进展。然而，PR-619 是一种新型去泛素化酶抑制剂，已证明在各种恶性肿瘤中具有抗肿瘤作用。本研究旨在研究 PR-619 对软骨肉瘤的体内和体外影响。使用了两种人软骨肉瘤细胞系 SW11353 和 JJ012。使用 MTT 测定法评估细胞活力，而流式细胞术可以检测细胞凋亡和细胞周期进程。进行了蛋白质印迹分析以评估细胞凋亡、细胞应激和内质网 (ER) 应激。此外，使用异种移植小鼠模型检查了 PR-619 的体内抗肿瘤作用。结果表明，PR-619 通过激活 caspase、PARP 切割和 p21 诱导细胞毒性、细胞凋亡和细胞周期停滞在 G0/G1 期。此外，PR-619 通过激活 IRE1、GRP78、caspase-4、CHOP 和其他细胞应激反应（包括 JNK 激活）增加了多泛素化蛋白的积累和 ER 应激。体内分析表明，PR-619 在异种移植小鼠模型中有效抑制肿瘤生长，且毒性极小。这些发现为 PR-619 在人类软骨肉瘤中的抗肿瘤作用和诱导细胞和 ER 应激提供了证据，表明其有可能成为人类软骨肉瘤的一种新治疗策略。
利用泛素化对 CRISPR-Cas9 系统进行改进......
以CRISPR-Cas9为代表的基因组编辑技术已广泛应用于基因功能分析、基因治疗、作物改良等多个生物领域。然而面对真核生物基因组的复杂性，CRISPR-Cas9基因组编辑工具表现出编辑效率不稳定、在不同靶位点差异性大等问题，进一步提高CRISPR-Cas9系统在全基因组范围内的编辑效率具有重要意义。本研究在前期单转录单元基因组编辑系统（STU-SpCas9）的基础上，利用泛素相关结构域（UBA）增强Cas9蛋白的稳定性，构建了三种Cas9-UBA融合系统（SpCas9-SD01、SpCas9-SD02、SpCas9-SD03）。选取水稻OsPDS、OsDEP1和OsROC5基因的4个不同靶位点，对水稻原生质体和稳定转化水稻植株的基因组编辑效率进行评价，结果表明UBA结构域的融合不影响Cas9蛋白的切割方式，且能有效提高STU-SpCas9在靶位点的编辑效率。该新型CRISPR-Cas9-UBA系统为提高CRISPR-Cas9在植物中的基因组编辑效率提供了新的策略和工具。
关注泛素化驱动的DNA甲基化像差
Mendelian疾病是由单个遗传基因座中的致病性变异引起的，通常表现为神经发育障碍（NDDS），影响了全球大部分儿科种群。这些疾病以非典型的大脑发育，智力残疾和各种相关的表型特征为特征。基因测试有助于临床诊断，但尚无定论的结果可以延长确认过程。最近对表观遗传失调的关注导致发现与NDD相关的DNA甲基化特征或发作性，从而加速了诊断精度。值得注意的是，参与泛素化途径的基因Trip12和USP7表现出特定的情节。了解这些基因在泛素化途径中的作用阐明了它们对情节形成的潜在影响。Trip12充当E3连接酶，USP7充当去泛素酶，在泛素化中呈现了对比的作用。比较这些基因致病性变异患者的表型性状既揭示了区别和共同点，从而提供了对潜在的病理生理机制的见解。本综述将Trip12和USP7在泛素化途径中的作用，它们对情节形成的影响以及对NDD发病机理的潜在影响。理解这些复杂的关系可能会揭示NDD的新型治疗靶标和诊断策略。
E3泛素蛋白连接酶lincr放大了tlr- ...
摘要：通过激活诸如MAP激酶和NF-κB信号途径等细胞内信号传导途径的激活，类似Toll样受体（TLR）诱导先天免疫反应，并在针对细菌或病毒感染的宿主防御中起重要作用。同时，TLR信号的过度激活导致各种炎症性疾病，包括自身免疫性疾病。TLR信号传导以平衡最佳免疫反应和炎症。但是，其平衡机制尚未完全理解。在这项研究中，我们将E3泛素连接酶lincr/ neurl3识别为TLR信号传导的关键调节剂。在有效的细胞中，因激动剂诱导的TLR3，TLR4和TLR5引起的JNK和p38 MAPK的持续激活显然被减弱。与这些观察结果一致，TLR诱导的一系列炎性细胞因子的产生显着减弱，这表明LINCR通过促进JNK和P38的激活来积极调节先天免疫反应。有趣的是，我们进一步的机械研究确定了MAP激酶的负调节剂MAPK磷酸酶-1（MKP1），是LINCR的泛素化靶标。因此，我们的结果表明，通过平衡LINCR（阳性调节剂）和MKP1（阴性调节器），TLR可以激活MAP激酶途径，这可能有助于诱导最佳免疫反应。
UHRF1依赖性PAF15泛素信号的终止由USP7和ATAD5
摘要UHRF1依赖性的泛素信号在维持DNA甲基化的调节中起着不可或缺的作用。uhrf1催化PAF15（PAF15UB2）的瞬时双单偶联化，该单次单位化在DNA复制过程中调节DNMT1在DNA甲基化位点的定位和激活。尽管UHRF1介导的PAF15泛素信号传导的启动已经相对良好，但其终止终止的机制以及如何在维持DNA甲基化完成后尚未阐明它们的终止。这项研究表明，USP7的去泛素化和ATAD5（酵母中的ELG1）卸载是从染色质中去除PAF15的关键过程。在复制染色质时，USP7在与DNMT1的复合物中专门与PAF15UB2相互作用。USP7耗竭或抑制USP7和PAF15之间的相互作用会导致染色质上PAF15UB2异常积累。此外，我们还发现，PAF15（PAF15UB0）的非泛素化形式以ATAD5依赖性方式从染色质中删除。PAF15UB2在染色质上保持高水平，这表明维持DNA甲基化的完成对于终止UHRF1介导的泛素信号是必不可少的。这一发现提供了在S相结束时如何拆卸维持DNA甲基化机制的分子底蕴。
从大规模泛素化中发现合成致死相互作用
癌症疗法的发展受到合适药物靶点的限制。可以根据合成致死率 (SL) 的概念来识别潜在的候选药物靶点，SL 指的是基因对，对于这些基因对来说，单独一个基因的畸变不会致命，但畸变同时发生则会对细胞造成致命影响。在这里，我们介绍了 SLIdR（R 中的合成致死率识别），这是一个用于从大规模扰动筛选中识别 SL 对的统计框架。即使样本量很小，SLIdR 也能成功预测 SL 对，同时最大限度地减少假阳性靶点的数量。我们将 SLIdR 应用于 Project DRIVE 数据，并找到已建立和潜在的泛癌症和癌症类型特异性 SL 对，这与文献和药物反应筛选数据的结果一致。我们通过实验验证了肝细胞癌中预测的两种 SL 相互作用（ARID1A-TEAD1 和 AXIN1-URI1），从而证实了 SLIdR 识别潜在药物靶点的能力。
泛素 - 蛋白酶体系统是杀死抗顺铂的膀胱癌细胞
摘要。同源重组修复（HRR）是双链DNA（dsDNA）断裂无错误修复的细胞机制。在编码HRR的蛋白质（例如BRCA1和BRCA2）的基因等位基因中具有突变的癌细胞在修复过程中都有缺陷。 因此，这些细胞用替代机制（例如非同源末端连接）修复DsDNA破裂。 在BRCA1和BRCA2基因中具有种系突变的乳腺癌中，HRR缺陷会导致对PARP抑制剂的敏感性，这些药物干扰PARP酶功能并促进酶在DNA上的捕获以及修复单链断裂的过程。 HRR缺陷也导致对DNA损害化学疗法的敏感性，因为细胞无法修复化学疗法诱导的DNA病变。 除了BRCA1和BRCA2中的种系突变外，这些基因或种系中的体细胞突变以及体细胞突变，或其他涉及同源重组（HR）的基因的其他遗传和表观遗传变化可能会产生HRR缺陷，从而导致对PARP抑制剂的敏感性。 然而，研究的结论较少，这一事实可能与这些情况下通常缺乏双行性功能丧失有关，而不是通常会损失双行性功能的癌症BRCA1或BRCA2缺陷的癌症。 in癌细胞在修复过程中都有缺陷。因此，这些细胞用替代机制（例如非同源末端连接）修复DsDNA破裂。在BRCA1和BRCA2基因中具有种系突变的乳腺癌中，HRR缺陷会导致对PARP抑制剂的敏感性，这些药物干扰PARP酶功能并促进酶在DNA上的捕获以及修复单链断裂的过程。HRR缺陷也导致对DNA损害化学疗法的敏感性，因为细胞无法修复化学疗法诱导的DNA病变。除了BRCA1和BRCA2中的种系突变外，这些基因或种系中的体细胞突变以及体细胞突变，或其他涉及同源重组（HR）的基因的其他遗传和表观遗传变化可能会产生HRR缺陷，从而导致对PARP抑制剂的敏感性。然而，研究的结论较少，这一事实可能与这些情况下通常缺乏双行性功能丧失有关，而不是通常会损失双行性功能的癌症BRCA1或BRCA2缺陷的癌症。in