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World File Search System演化
咖啡基因组提供了对咖啡因生物合成融合演化的见解
咖啡是一种有价值的饮料作物，由于其特征性的味道，香气和咖啡因的刺激作用。我们生成了该物种咖啡佳虫的高质量草稿基因组，该种类在Asterid被子植物中显示了保守的染色体基因顺序。尽管没有显示出在番茄等茄科物种中鉴定出的全基因组三重固定的迹象，但该基因组包括几种特定物种的基因家族膨胀，其中包括N-甲基转移酶（NMT）参与咖啡因生产，国防相关的基因，以及涉及碱性蛋白酶的二级混合物合成。咖啡因NMT的比较分析表明，这些基因通过可可和茶的基因独立于基因而扩展，这表明eudicots中的咖啡因是多形的起源。W
基于混合集群演化元博弈的海上对空反导杀伤链优选策略研究
引用格式： 李博文 , 李晶晶 , 张龙剑 , 等 . 基于混合集群演化元博弈的海上对空反导杀伤链优选策略研究 [J]. 中国舰船研 究 . DOI: 10.19693/j.issn.1673-3185.04217. LI B W, LI J J, ZHANG L J, et al. Research on optimal selection strategy of surface-to-air anti-missile kill chain based on mixed swarm evolutionary meta-game[J]. Chinese Journal of Ship Research(in Chinese). DOI: 10.19693/j.issn.1673- 3185.04217.
从概率幅度计算量子力学演化的复杂性
编辑：Hubert Saleur 我们研究在配备 Fubini-Study 度量的 Bloch 球面上连接任意源状态和目标状态的时间最优和时间次优量子哈密顿演化的复杂性。这项研究分多个步骤进行。首先，我们通过路径长度、测地线效率、速度效率和连接源状态和目标状态的相应动态轨迹的曲率系数来描述每个幺正薛定谔量子演化。其次，从经典的概率设置开始，在仅对系统物理有部分了解的情况下，可以使用所谓的信息几何复杂性来描述弯曲统计流形上熵运动的复杂性，然后我们过渡到确定性量子设置。在这种情况下，在提出量子演化的复杂性定义之后，我们提出了量子复杂性长度尺度的概念。具体来说，我们讨论了这两个量的物理意义，即布洛赫球面上指定从源状态到目标状态的量子力学演化的区域的可访问（即部分）和可访问（即全部）参数体积。第三，在计算了两个量子演化的复杂性测量和复杂性长度尺度之后，我们将我们的测量行为与路径长度、测地线效率、速度效率和曲率系数的行为进行比较。我们发现，一般来说，高效的量子演化比低效的演化复杂度要低。然而，我们还观察到复杂性不仅仅是长度。事实上，弯曲程度足够的长路径可以表现出比曲率系数较小的短路径更简单的行为。
演化经济理论
经济理论是研究经济如何运作的学科。演化经济学广泛关注经济变化如何发生，并专注于创新和创业、产业和制度动态（而不是利润），以及与经济增长和发展相关的模式和趋势（Hodgson，2019 年）。演化经济学思想的基础是创新和经济变化是相互交织的（Ayres，2000 年；Ayres，1953 年）。采用演化经济方法的理论家通常关注经济增长、生产力和利益相关者的互动。采用演化经济学原理的规划者关注基础设施、结构和制度的变化及其随时间的影响。另一方面，大多数管理技术开发的实践者关注创新过程和创新和技术变革系统，因为它们可能会对经济发展产生影响（Nelson，2008 年；Schot & Steinmueller，2018 年）。演化经济学的核心概念是世界是复杂而动态的。因此，梅特卡夫（1998：第 8 页）宣称：“创新驱动的经济过程是开放式的，经济永远不会处于均衡状态，甚至不会接近均衡状态……结果是被发现的，而不是在事件发生之前就被假定的”。因此，演化经济学被认为是非定向的，缺乏对给定终点的预先确定（即，它不是目的论的）。由于创新（即技术变革）被视为一种
水平基因转移：细菌的自适应演化
完整的基因组（WGS）：所有染色体均完全由不超过十个染色体碱基的间隙组装而成：所有染色体都完全组装，但包含支架间隙：顺序连续体是通过间隙连接的，但序列未分配到重叠式染色体：
理解行为策略：《管理决策》的历史演化视角
摘要 目的——本文旨在追溯行为策略 (BS) 领域的历史发展，该领域将心理学应用于战略管理。主要目的是提供对这一研究流派的历史演变以及相关未来轨迹的背景理解。这项工作是“半个多世纪的管理决策”庆祝和非正式期刊部分的一部分。 设计/方法/方法——我们将管理决策 (MD) 中产生的 BS 文献视为管理思想演变的代表，MD 是管理领域最古老、运行时间最长的学术出版物。通过系统文献综述 (SLR) 流程，我们通过 MD 网站和 Scopus 收集了 97 篇 BS 文章样本，这些文章自 MD 成立 (1967 年) 至今 (2024 年)。在分析方面，我们采用了反身主题分析方法来综合主要的 BS 主题，然后从历史角度阅读文献发展的三个“时代”。期刊范围之外的选定国际文献被视为对这一历史分析的补充。发现 – 从历史上看，在 BS 领域，人们的兴趣从规则转移到合理管理战略决策过程，研究导致认知错误的原因，了解如何避免偏见以及为剧烈变化做好准备。本文还确定了未来研究可以研究的六个未来研究轨迹，即“积极启发法”、“情境嵌入的心理过程”、“非传统思维”、“认知进化触发因素”、“去偏见策略”和“应对新战略挑战的行为理论”。研究局限性/含义 – 本研究的局限性在于它只关注 MD 来研究 BS 的历史演变，从而忽略了其他期刊的重要贡献。因此，MD 的编辑偏好影响了结果。仍然需要对 BS 领域进行全面的 SLR，需要更广泛的期刊覆盖范围来减轻选择偏差并加强领域评估。原创性/价值 – 这篇文章是第一个提供 BS 领域历史演变观点的文章，补充了关于这一研究流的其他几篇评论。这填补了管理思想演进研究的空白。关键词 行为策略 管理史 策略 决策 偏见 理性 认知 论文类型 文献综述
通过mRNA-LNP量身定制的汽车巨噬细胞的腹膜内编程，以增强癌症免疫疗法 获胜者效应的攻击回路中的多阶段可塑性 Sidelobe抑制了贝塞尔梁的一杆光... 标题：肠道菌群脑瘤诱导的肠道菌群失调调节1 深层：多个测序技术的精确体细胞变体发现 差异相互作用决定了基于RNA的生物分子冷凝水界面的各向异性 连续的，低流和多路复用泵 通过图神经网络在表型预测中利用蛋白质 - 蛋白质相互作用 通过大型语言模型指导的定向演化蛋白质设计
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证（未获得同行评审证书）获得的是作者/资助者，他已授予Biorxiv授予Biorxiv的许可，以永久显示预印本。这是该版本的版权所有，该版本于2024年8月19日发布。 https://doi.org/10.1101/2024.07.30.605730 doi：Biorxiv Preprint
通过图神经网络在表型预测中利用蛋白质 - 蛋白质相互作用通过大型语言模型指导的定向演化蛋白质设计
摘要 - 指导的进化，一种蛋白质工程的策略，通过严格且资源密集的筛查或在广泛的突变中进行筛选或选择的过程来优化蛋白质特性（即健身）。通过对序列属性进行计算机筛选，机器学习引导的定向进化（MLDE）可以加快优化过程并减轻实验工作量。在这项工作中，我们提出了一个通用的MLDE框架，在该框架中，我们应用了蛋白质表示学习和蛋白质属性预测中深度学习的最新进步，以加速搜索和优化过程。特别是我们引入了一条优化管道，该管道利用大型语言模型（LLMS）来查明序列中的突变热点，然后建议替换以提高整体适应性。与其他最先进的基线算法相比，我们提出的框架在条件蛋白质产生中的效率和功效提高了。我们希望这项工作将不仅对蛋白质工程，而且对使用数据驱动方法解决组合问题进行新的启示。我们的实施可在https://github.com/ hysonlab/directed Evolution上公开获取。
量子和经典绝热演化之间的差异
绝热进化是时间调制的超材料的新兴设计原理，通常受到拓扑量子计算（例如编织操作）的见解的启发。然而，对经典绝热超材料的追求源于以下假设：经典和量子绝热进化是等效的。我们表明，只有在所有频段的频率距离距0的频率之间，并且在经典系统中不能再现了量子绝热演化的某些实例，例如量子绝热演化的某些实例，例如量子绝热演化的某些实例，例如量子绝热进化的某些实例，在经典系统中不能再现。这是因为模式耦合在经典力学上根本不同。我们得出经典条件，以确保绝热性，并证明只有在这些条件下（与量子绝热条件不同），单个带浆果相位和Wilczek-Zee矩阵的任何地方都会出现，而堕落的波段则出现，因为它们会出现，这是编码经典绝热进化的几何形状的有意义的数量。最后，对于一般的多频道系统，我们在非亚伯仪仪上的经典系统潜力中发现了一个校正项。