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载奥沙利铂壳聚糖纳米粒子修饰西妥昔单抗单链可变片段用于人类结直肠癌治疗
在天然聚合物中，壳聚糖作为化疗药物的药物输送系统引起了人们的特别关注 (7)。壳聚糖源自几丁质的脱乙酰化过程，是一种用途广泛的氨基多糖聚合物，大量存在于节肢动物的外骨骼和真菌的细胞壁中。其独特的属性，包括高载药量、持续循环、多功能性、在肿瘤部位精确释放药物、减轻对健康细胞的毒性、良好的靶向能力、生物相容性、生物降解性、抗菌和抗肿瘤特性以及细胞膜通透性，使其成为一种有吸引力的选择 (8)。化学改性的壳聚糖衍生物已显示出令人鼓舞的结果，可有效输送治疗剂，同时减少副作用。此外，壳聚糖在肿瘤部位的积累可以增强对癌细胞的免疫反应，并阻止肿瘤的生长和扩散。因此，由于具有抗肿瘤和止血活性且毒性极小，壳聚糖被认为是一种安全且生物相容的生物医学应用工具。壳聚糖的活性氨基易于与功能团连接，增强了其作为生物聚合物的多功能性 (7)。
Auto-Mag® DNA片段分选纯化回收试剂（磁珠法）
Auto-Mag® DNA 片段分选纯化回收试剂（磁珠法）是一款基于顺磁珠技术开发的高性能试剂，专为满足 下一代测序 (NGS) 文库构建中的 PCR 产物、DNA 片段和 RNA 的纯化需求而设计，同时支持 DNA 片段的大 小分选与高效回收。在 PCR 产物纯化方面，该试剂提供了单管和 96/384 孔板两种灵活格式，通过优化的缓 冲液选择性地结合 >100 bp 的 PCR 扩增产物，利用简便的清洗步骤去除多余引物、核苷酸、盐和酶，最终 使用低盐洗脱缓冲液或水进行温和高效的洗脱。在 DNA 片段大小分选中，用户可通过调整试剂与 DNA 样 本的体积比，精准选择目标 DNA 片段范围，并通过结合、洗涤和洗脱的简单操作回收分布均匀、符合实验 需求的目标 DNA 片段。
H5N1（禽流感）合成RNA片段
指导文档NIST研究级测试材料10263所提供的材料是NIST研究级测试材料（RGTM）。该材料不是NIST标准参考材料®或NIST参考材料。nist rgtms。目的：NIST研究级测试材料（RGTM）10263是在协作的基础上提供的，以供接收者评估该材料的潜在健身性，作为RT-QPCR分析开发和评估，校准RT-QPCR方法的参考材料，RT-QPCR方法的校准以及对其他H5N1控制材料进行基准标记。有关更多详细信息，请访问https://www.nist.gov/programs-projects/h5-influenza-posistive-controls。描述：RGTM 10263的单位由三个组件组成，标有如下标记的部分：a：ha_h5，b：na_n1，c：mp part b：na_n1。在缓冲溶液中，每个组件在5 ng/µl Jurkat RNA的背景下包含大约100μl的靶RNA。所有目标RNA序列与A/American Wigeon/South Carolina/22/2021 CVV Reastortant病毒菌株匹配。A部分的靶RNA包含来自H5血凝蛋白基因的序列，B部分的靶RNA包含来自N1神经氨酸酶基因的序列，而C部分C的靶RNA包含来自基质蛋白基因的序列。本文档的“ NIST其他信息”部分列出了每个部分目标RNA的遗传序列信息。结果报告：请通过电子邮件将有关您在RGTM 10263的经验的评论和反馈返回h5flu@nist.gov，不迟于收到材料后60天。使用期限：接收者可以从收据开始使用RGTM 10263，直到收件人完成该材料的适应性评估或材料的名义到2029年11月1日的象征性到期日期。安全：RGTM 10263用于研究用途。这是一种人类源材料。RGTM 10263是一种生物安全级材料，应根据适用的联邦，州和/或地方法规以及根据接收者组织的政策和程序来处理。存储：应将材料冷冻在-80°C下。使用说明：在室温下解冻管。一旦解冻，Vortex短暂地，短暂离心并重复。注意：材料的多个冻融可能会导致浓度较低的估计值。NIST技术联系人：Megan Cleveland，Megan.cleveland@nist.gov，301-975-5473免责声明：可以在此信息表中确定某些商业设备，工具或材料，以充分指定实验程序。这种标识并不意味着国家标准与技术研究所的建议或认可，也不意味着确定的材料或设备必然是最适合该目的的材料或设备。
结直肠癌全基因组游离DNA片段长度分布的通道容量
此预印本的版权所有者此版本于 2024 年 11 月 1 日发布。；https://doi.org/10.1101/2024.07.17.24310568 doi: medRxiv preprint
使用基于片段的量子化学计算蛋白质-配体相互作用能量的收敛协议
基于碎片的量子化学方法提供了一种避免电子结构计算的非线性缩放的方法，因此可以使用高级方法研究大型分子系统。在这里，我们使用碎片来计算具有数千个原子的系统中的蛋白质-配体相互作用能，使用一种用于管理基于碎片的计算的新软件平台，该平台实现了屏蔽多体展开。使用最小基半经验方法 (HF-3c) 进行的收敛测试表明，使用单残基碎片和简单氢帽的二体计算足以重现使用传统超分子电子结构计算获得的相互作用能，误差在 1 kcal/mol 以内，计算成本约为 1%。我们还表明，HF-3c 结果说明了密度泛函理论在增强四倍 ζ 质量的基组中获得的趋势。碎片化的战略部署有利于融合生物分子模型系统与高质量电子结构方法和基组一起使用，将从头算量子化学引入迄今为止难以想象的规模的系统。这将有助于为机器学习应用生成高质量的训练数据。
使用 Domainex 的共价片段库和基于 LC-MS 的共价片段筛选平台搜索转谷氨酰胺酶 2 (TG2) 共价抑制剂
支持共价抑制剂药物发现/设计的工具的最新进展以及奥希替尼和伊布替尼等重磅药物的成功，导致人们对“亲电试剂优先”共价药物发现的兴趣日益浓厚。通过完整蛋白质质谱 (MS) 进行共价片段筛选已被证明是一种强大的工具，KRAS(G12C) 抑制剂的发现证明了这一点 [1]。支持共价片段筛选的其他检测方法，包括通过 GSH 检测评估弹头反应性以及通过蛋白酶消化和肽图分析识别结合位点，可进一步优化命中率。共价抑制是时间依赖性的，因此效力的首选测量方法是二级速率常数 kinact/Ki，而不是 IC50。
奥林匹克半岛虹鳟不同种群片段的生物学状况
.................................................................................................................................................... 61 图 24 DLM 估计的时间序列中每个种群的估计趋势。 ... 62 图 25. 在夏季在参考点进行的浮潜调查中，每 5 公里成年夏季钢头鳟的年峰值数量。参考点位于奥林匹克国家公园的六条河流中，X 轴的标签报告了每年重复调查的次数 n。计数包括自然和孵化场来源的成年鳟鱼（见表 5）。详情请参阅 Brenkman 和 Connolly (2008)。 ............................................................................................................. 64 图 26. 在连续浮潜调查中计数的成年夏季钢头鳟的分布和相对丰度（见表 6）。成年钢头鳟的纵向剖面以 1 公里的空间尺度绘制，以箱长表示。 ........................................................................................... 68 图 27. 估计冬季径流种群的 15 年逃逸趋势（切断后总逃逸量）。点显示估计的随时间变化的趋势和个别种群的 95% 置信区间。15 年窗口的结束时间是 x 轴上的年份。仅显示至少有 2 个观测值（数据点）位于前 5 年且有 2 个观测值位于后 5 年的 15 年窗口。请注意，海峡 JF 组中的种群要小得多（图 22）。 ........................................................................................................................................... 70 图 28. 估计的 Busby（1977-1994 年）和后 Busby（1995-2022 年）时期的冬季径流种群的逃逸趋势（切断后总逃逸量）。点显示估计的趋势和 95% 置信区间。 ........................................................................................................................... 72 图 29. 冬季径流库存的 15 年平均逃逸量估算值（截断后的总逃逸量）。各点显示截至 x 轴年份的 15 年期间各个库存的估计平均值。仅显示至少有 2 年在前 5 年、2 年在后 5 年的 15 年窗口。x 轴上的年份是 15 年期的结束年份。 ........................................................................................................................... 74 图 30. 冬季径流库存的平均逃逸量估算值（3 月 15 日截断后的总逃逸量），前期（1989-1993 年）和后期（2018-2023 年）。请注意，y 轴为 log10 刻度。 ........................................................................................................................... 75 图 31.联合管理者报告的自然（3 月捕捞期后逃逸）冬季洄游鲑鱼的捕捞死亡率。这是捕捞量/捕捞量。娱乐性钓鱼（捕获和释放）死亡率仅包含在霍河数据中。...................................................................................... 78 图 32. 有捕捞和无捕捞期间 OP 鲑鱼海峡种群增长的一年估计值。估计值来自 DLM 输出。垂直线显示平均值和 95% 置信区间。............................................................................................................. 80 图 33. 有捕捞和无捕捞期间 OP 鲑鱼海峡种群的种群增长率。估计值来自 DLM 输出。垂直线显示平均值和 95% 置信区间。............................................................................................................. 81 图 34. 联合管理者报告的自然（3 月捕捞期后）冬季洄游鲑鱼逃逸和捕捞的原始数据。 ........................................................................................................... 83 图 35. 估计的对数尺度种群增长率（亩）、估计的年收获死亡率（F）和净种群增长率（亩 + F）。对于“F”和“亩 + F”，每个点代表特定年份的估计值。所有参数均显示平均值和 95% 置信区间。 ............................................................................................................................................. 84 图 36. 1946-1960 年奎诺尔特河虹鳟鳃和定置网收获量。（摘自 Moore 1960 年）。 ............................................................................................................................................. 88估计的对数尺度种群增长率（亩）、估计的年收获死亡率（F）和净种群增长率（亩 + F）。对于“F”和“亩 + F”，每个点代表特定年份的估计值。所有参数均显示平均值和 95% 置信区间。...................................................................................................................................................... 84 图 36. 1946-1960 年奎诺尔特河虹鳟鳃和定置网收获量。（来自 Moore 1960）。...................................................................................................................................................... 88估计的对数尺度种群增长率（亩）、估计的年收获死亡率（F）和净种群增长率（亩 + F）。对于“F”和“亩 + F”，每个点代表特定年份的估计值。所有参数均显示平均值和 95% 置信区间。...................................................................................................................................................... 84 图 36. 1946-1960 年奎诺尔特河虹鳟鳃和定置网收获量。（来自 Moore 1960）。...................................................................................................................................................... 88
表1：用于COI和18S基因片段的DNA-Barcoding的引物。所有序列均以5'至3'方向给出。
ku905921 COI SERCI317-14 BOLD：ACO3861 Clymenella Torquata Gloucester县，美国弗吉尼亚州，美国KU906065 COI SERCI316-14 BOLD：ACO38611 Clymenella torquata粗体：ACO3861 Clymenella torquata Gloucester县，弗吉尼亚州，美国HQ024004 COI NBPOL064-08 BOLD：AAC7695 Clymenella Torquata St. Andrews St. Andrews，New Brunswick，New Brunswick，New Brunswick，加拿大加拿大HQ024009 COI NBPOL12121212121-NEACENELL：AAC769 aac76955 bold：AAC76995555加拿大不伦瑞克省HQ024010 COI NBPOL123-08 BOLD：AAC7695 Clymenella Torquata St. Andrews，New Brunswick，New Brunswick，加拿大HQ024006 COI NBPOL082-08 BOLD BOLD BOLD：AAC7695 NBPOL044-08 BOLD：AAC7695 Clymenella Torquata St. Andrews，新不伦瑞克省，加拿大加拿大HQ024008 COI NBPOL101-08 BOLD：AAC7695 Clymenella Torquata St. Andrews St. Andrews St. Torquata St. Andrews，加拿大新不伦瑞克省HQ024007 COI NBPOL088-08 BOLD：AAC7695 Clymenella Torquata St. Andrews St. Andrews，New Brunswick，加拿大Coi Invcl003-23 Bold：AAC7695
大肠癌中无基因组无细胞DNA片段长度分布的通道容量
该预印本版的版权持有人于2024年7月24日发布。 https://doi.org/10.1101/2024.07.17.24310568 doi：medrxiv preprint