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在牡蛎生命中，免疫系统和微生物群之间的串扰和相互塑造
太平洋牡蛎Crassostrea gigas居住在富含环境变化的富含微生物的海洋沿海系统中。它具有多样化和波动的微生物群，与表达多样化的免疫基因库的免疫细胞同居。在牡蛎发育的早期阶段，在受精后，微生物群在教育免疫系统中起着关键作用。在幼虫阶段暴露于丰富的微生物环境会导致牡蛎寿命中的免疫能力提高，从而在后来的少年/成人阶段更好地保护对致病感染的更好保护。这种有益的效应是与世代相传的，与表观遗传重塑有关。在少年阶段，受过教育的免疫系统参与了体内平衡的控制。尤其是，微生物群是由牡蛎抗菌肽通过特定和协同作用作用的。然而，这种平衡是脆弱的，如太平洋牡蛎死亡率综合征所示，这是一种疾病，导致全球牡蛎的大量死亡。在这种疾病中，OSHV-1 µVAR病毒对牡蛎免疫防御的削弱会诱导致命性脓毒症。本综述说明了高度多样化的牡蛎免疫系统与其在整个生命中的动态微生物群之间的持续相互作用，以及这种串扰对牡蛎健康的重要性。本文是主题问题的一部分，“雕刻微生物组：宿主因素如何确定和响应微生物定植”。
发现表明牡蛎血蛋白可提高抗生素的有效性
这项新研究支持使用牡蛎中的天然产物治疗细菌感染的可能性。重要的是，牡蛎血淋巴蛋白对人类肺细胞无毒，这表明应该可以优化安全有效的剂量。这项研究由科学与工程学院的 Kirsten Benkendorff 教授指导。
DNA甲基化与转录噪声相关，响应于东部牡蛎（Crassostrea virginica）的PCO2升高
抽象分子模拟扩展了我们学习生物分子相互作用的能力。由具有不同理化特性的不同脂质组成的生物膜是参与细胞功能的高度动态环境。蛋白质，核酸，聚糖和生物兼容的聚合物是细胞质和脂质膜界面中细胞过程的机械。脂质物种直接调节膜特性，并影响其他生物分子的相互作用和功能。天然分子扩散会导致局部脂质分布的变化，从而影响膜特性。将生物物理和结构膜和生物聚合物的特性投射到二维平面可能是有益的，可以在降低的尺寸空间中量化分子特征，以识别感兴趣界面的相关相互作用，即膜表面或生物聚合物表面接口。在这里，我们提出了一个工具箱，旨在将膜和生物聚合物特性投射到二维平面上，以表征脂质 - 脂质与脂质聚合物接口之间的相互作用模式和空间相关模式。该工具箱包含两个使用MDakits体系结构实施的枢纽，一个用于膜，一个用于生物聚合物，可以独立或一起使用。三个案例研究证明了工具箱在GitHub中具有详细教程的多功能性。该工具箱和教程将定期更新其他功能和决议，以扩展我们对生物分子在二维中的结构 - 功能关系的理解。
牡蛎疱疹病毒 1 感染期间的 ADAR 编辑：事实与局限性
摘要 在感染巨牡蛎 (Crassostrea gigas) 的过程中，牡蛎疱疹病毒 1 (OsHV-1) RNA 会通过 A 到 I 的转化进行酶促修饰。与 OsHV-1 RNA 平行的 ADAR1 表达和超编辑活性的增加表明 dsRNA 编辑与抗病毒反应之间存在功能性联系。我们分析了 87 个 RNA 测序数据集，这些数据集来自暴露于 OsHV-1 的免疫致敏、抗性和易感牡蛎，以比较宿主和病毒转录本上的 ADAR 超编辑水平并追踪牡蛎基因上的超编辑。尽管在感染后期病毒 RNA 的编辑有所增加，但宿主 RNA 比病毒 RNA 更容易发生超编辑。一组占牡蛎转录组 0.5% 的基因（包括几个含三部分基序的序列）不断被超编辑。相反，我们鉴定出参与抗病毒反应、miRNA 成熟和表观遗传调控的基因，这些基因仅在特定条件下被过度编辑。尽管技术和生物学瓶颈阻碍了对双壳类“RNA 编辑组”的理解，但现有的工具和技术可以适用于双壳类软体动物。
免疫基因的差异基础表达使牡蛎对太平洋牡蛎死亡综合症具有抗性
Julien de Lorgeril、Bruno Petton、Aude Lucasson、Valérie Perez、Pierre-Louis Stenger 等人。免疫基因的差异性基础表达使 Crassostrea gigas 具有对太平洋牡蛎死亡综合症的抵抗力。 BMC Genomics，2020，21（1），第63页。 “10.1186/s12864-020-6471-x”。 �第 02432454 页�
评估牡蛎礁作为栖息地：催化未来的管理应用研究
基金会物种，例如东部牡蛎（Crassostrea virginica），可提供许多生态功能，并在沿海环境中提供无数的生态系统服务，包括作为NERR系统储备中各种生物体的重要栖息地。我们的合作团队同时部署了多种已建立和新兴的方法，以在北卡罗来纳州（NC），南卡罗来纳州（Ni-WB），乔治亚州（SI）和佛罗里达州（GTM）中在北卡罗来纳州（NC），南卡罗来纳州（NI-WB）的储量中进行潮间带牡蛎礁进行采样。
表征空心牡蛎脸的微生物组
海洋双壳类动物是通过提供栖息地，确保底蒂 - - 索拉蒂 - - 索拉蒂 - - - 索拉蒂 - - 索拉蒂 - - 索拉蒂 - - 索拉蒂 - - 刺激 - - - 杂质的能量流动并维持水质量的调解）在沿海生态系统中发挥至关重要的作用的关键生态物种。他们的底栖生活方式和过滤活动也使他们有用的哨兵来检测污染。他们在水产养殖中也具有极大的经济意义。近年来，病毒或细菌起源的疾病定期影响牡蛎部门。微生物组的作用的整合可以更好地理解这些生物处理疾病的生理和能力，尤其是在环境中存在污染物的情况下（4）。